RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356286.9

RBCK1-202, Transcript of RANBP2-type and C3HC4-type zinc finger containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RBCK1, Length 2,774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1-202ENST00000356286 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.98■■□□□ 1.59
RBCK1-202ENST00000356286 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.96■■□□□ 1.59
RBCK1-202ENST00000356286 KCNH8Q96L42 1107 aa24.95■■□□□ 1.59
RBCK1-202ENST00000356286 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.94■■□□□ 1.58
RBCK1-202ENST00000356286 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.93■■□□□ 1.58
RBCK1-202ENST00000356286 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.93■■□□□ 1.58
RBCK1-202ENST00000356286 MAPKBP1O60336 1514 aa24.92■■□□□ 1.58
RBCK1-202ENST00000356286 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.89■■□□□ 1.58
RBCK1-202ENST00000356286 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.88■■□□□ 1.57
RBCK1-202ENST00000356286 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
RBCK1-202ENST00000356286 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
RBCK1-202ENST00000356286 MAP3K1Q13233 1512 aa24.85■■□□□ 1.57
RBCK1-202ENST00000356286 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
RBCK1-202ENST00000356286 NESP48681 1621 aa24.85■■□□□ 1.57
RBCK1-202ENST00000356286 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
RBCK1-202ENST00000356286 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
RBCK1-202ENST00000356286 WDR97A6NE52 1622 aa24.78■■□□□ 1.56
RBCK1-202ENST00000356286 TOPBP1Q92547 1522 aa24.75■■□□□ 1.55
RBCK1-202ENST00000356286 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.72■■□□□ 1.55
RBCK1-202ENST00000356286 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.72■■□□□ 1.55
RBCK1-202ENST00000356286 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.71■■□□□ 1.55
RBCK1-202ENST00000356286 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
RBCK1-202ENST00000356286 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.67■■□□□ 1.54
RBCK1-202ENST00000356286 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.67■■□□□ 1.54
RBCK1-202ENST00000356286 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.65■■□□□ 1.54
RBCK1-202ENST00000356286 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
RBCK1-202ENST00000356286 BCANQ96GW7 911 aa24.6■■□□□ 1.53
RBCK1-202ENST00000356286 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.6■■□□□ 1.53
RBCK1-202ENST00000356286 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.6■■□□□ 1.53
RBCK1-202ENST00000356286 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.59■■□□□ 1.53
RBCK1-202ENST00000356286 FMN1Q68DA7 1419 aa24.59■■□□□ 1.53
RBCK1-202ENST00000356286 MYT1Q01538 1121 aa24.57■■□□□ 1.52
RBCK1-202ENST00000356286 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RBCK1-202ENST00000356286 PTPRKQ15262 1439 aa24.55■■□□□ 1.52
RBCK1-202ENST00000356286 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.55■■□□□ 1.52
RBCK1-202ENST00000356286 CUL7Q14999 1698 aa24.54■■□□□ 1.52
RBCK1-202ENST00000356286 TONSLQ96HA7 1378 aa24.54■■□□□ 1.52
RBCK1-202ENST00000356286 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.522e-7■■■■■ 36.8
RBCK1-202ENST00000356286 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.53■■□□□ 1.52
RBCK1-202ENST00000356286 TRIM52Q96A61 297 aa24.53■■□□□ 1.52
RBCK1-202ENST00000356286 ARID3CA6NKF2 412 aa24.52■■□□□ 1.52
RBCK1-202ENST00000356286 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.52■■□□□ 1.52
RBCK1-202ENST00000356286 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.52■■□□□ 1.52
RBCK1-202ENST00000356286 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.51■■□□□ 1.51
RBCK1-202ENST00000356286 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.515e-8■■■□□ 14.9
RBCK1-202ENST00000356286 ANP32CO43423 234 aa24.48■■□□□ 1.51
RBCK1-202ENST00000356286 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.48■■□□□ 1.51
RBCK1-202ENST00000356286 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.48■■□□□ 1.51
RBCK1-202ENST00000356286 FKBP8Q14318 412 aa24.47■■□□□ 1.51
RBCK1-202ENST00000356286 NCOA2Q15596 1464 aa24.45■■□□□ 1.5
RBCK1-202ENST00000356286 HFM1A2PYH4 1435 aa24.42■■□□□ 1.5
RBCK1-202ENST00000356286 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.41■■□□□ 1.5
RBCK1-202ENST00000356286 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.41■■□□□ 1.5
RBCK1-202ENST00000356286 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.4■■□□□ 1.5
RBCK1-202ENST00000356286 UACAQ9BZF9 1416 aa24.4■■□□□ 1.5
RBCK1-202ENST00000356286 NAIPQ13075 1403 aa24.39■■□□□ 1.5
RBCK1-202ENST00000356286 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.37■■□□□ 1.49
RBCK1-202ENST00000356286 GRIN2BQ13224 1484 aa24.36■■□□□ 1.49
RBCK1-202ENST00000356286 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.36■■□□□ 1.49
RBCK1-202ENST00000356286 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.35■■□□□ 1.49
RBCK1-202ENST00000356286 SAMD9Q5K651 1589 aa24.35■■□□□ 1.49
RBCK1-202ENST00000356286 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.33■■□□□ 1.49
RBCK1-202ENST00000356286 CCER2I3L3R5 266 aa24.31■■□□□ 1.48
RBCK1-202ENST00000356286 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.3■■□□□ 1.48
RBCK1-202ENST00000356286 FOXD1Q16676 465 aa24.3■■□□□ 1.48
RBCK1-202ENST00000356286 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
RBCK1-202ENST00000356286 NEFLP07196 543 aa24.27■■□□□ 1.48
RBCK1-202ENST00000356286 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.25■■□□□ 1.47
RBCK1-202ENST00000356286 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.24■■□□□ 1.47
RBCK1-202ENST00000356286 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.22■■□□□ 1.47
RBCK1-202ENST00000356286 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
RBCK1-202ENST00000356286 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
RBCK1-202ENST00000356286 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
RBCK1-202ENST00000356286 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.18■■□□□ 1.46
RBCK1-202ENST00000356286 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.17■■□□□ 1.46
RBCK1-202ENST00000356286 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RBCK1-202ENST00000356286 KDM6BO15054 1643 aa24.16■■□□□ 1.46
RBCK1-202ENST00000356286 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.15■■□□□ 1.46
RBCK1-202ENST00000356286 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RBCK1-202ENST00000356286 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RBCK1-202ENST00000356286 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.14■■□□□ 1.45
RBCK1-202ENST00000356286 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
RBCK1-202ENST00000356286 ARHGEF11O15085 1522 aa24.12■■□□□ 1.45
RBCK1-202ENST00000356286 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
RBCK1-202ENST00000356286 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
RBCK1-202ENST00000356286 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
RBCK1-202ENST00000356286 IQGAP2Q13576 1575 aa24.1■■□□□ 1.45
RBCK1-202ENST00000356286 HECW1Q76N89 1606 aa24.09■■□□□ 1.45
RBCK1-202ENST00000356286 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RBCK1-202ENST00000356286 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
RBCK1-202ENST00000356286 CCDC184Q52MB2 194 aa24.06■■□□□ 1.44
RBCK1-202ENST00000356286 PBRM1Q86U86 1689 aa24.05■■□□□ 1.44
RBCK1-202ENST00000356286 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
RBCK1-202ENST00000356286 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
RBCK1-202ENST00000356286 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24■■□□□ 1.43
RBCK1-202ENST00000356286 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
RBCK1-202ENST00000356286 NBPF8Q3BBV2 869 aa24■■□□□ 1.43
RBCK1-202ENST00000356286 MIA2Q96PC5 1412 aa23.99■■□□□ 1.43
RBCK1-202ENST00000356286 WDR62O43379 1518 aa23.99■■□□□ 1.43
RBCK1-202ENST00000356286 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.8 ms