RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336600.5

C6orf223-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 223, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C6orf223, Length 3,581 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf223-201ENST00000336600 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
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C6orf223-201ENST00000336600 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.7■■□□□ 1.23
C6orf223-201ENST00000336600 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.7■■□□□ 1.22
C6orf223-201ENST00000336600 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.7■■□□□ 1.22
C6orf223-201ENST00000336600 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.7■■□□□ 1.22
C6orf223-201ENST00000336600 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.7■■□□□ 1.22
C6orf223-201ENST00000336600 CFTRP13569 1480 aa22.69■■□□□ 1.22
C6orf223-201ENST00000336600 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.67■■□□□ 1.22
C6orf223-201ENST00000336600 TOP2BQ02880 1626 aa22.65■■□□□ 1.22
C6orf223-201ENST00000336600 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
C6orf223-201ENST00000336600 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.64■■□□□ 1.21
C6orf223-201ENST00000336600 PRXQ9BXM0 1461 aa22.63■■□□□ 1.21
C6orf223-201ENST00000336600 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.57■■□□□ 1.2
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C6orf223-201ENST00000336600 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
C6orf223-201ENST00000336600 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.56■■□□□ 1.2
C6orf223-201ENST00000336600 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.55■■□□□ 1.2
C6orf223-201ENST00000336600 KCNH8Q96L42 1107 aa22.51■■□□□ 1.19
C6orf223-201ENST00000336600 HMGXB3Q12766 1538 aa22.49■■□□□ 1.19
C6orf223-201ENST00000336600 FOXD1Q16676 465 aa22.49■■□□□ 1.19
C6orf223-201ENST00000336600 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.47■■□□□ 1.19
C6orf223-201ENST00000336600 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
C6orf223-201ENST00000336600 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.42■■□□□ 1.18
C6orf223-201ENST00000336600 FKBP8Q14318 412 aa22.39■■□□□ 1.17
C6orf223-201ENST00000336600 TONSLQ96HA7 1378 aa22.38■■□□□ 1.17
C6orf223-201ENST00000336600 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
C6orf223-201ENST00000336600 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
C6orf223-201ENST00000336600 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.35■■□□□ 1.17
C6orf223-201ENST00000336600 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
C6orf223-201ENST00000336600 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.33■■□□□ 1.17
C6orf223-201ENST00000336600 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.32■■□□□ 1.16
C6orf223-201ENST00000336600 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.3■■□□□ 1.16
C6orf223-201ENST00000336600 TOPBP1Q92547 1522 aa22.29■■□□□ 1.16
C6orf223-201ENST00000336600 ANP32CO43423 234 aa22.29■■□□□ 1.16
C6orf223-201ENST00000336600 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.27■■□□□ 1.16
C6orf223-201ENST00000336600 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.25■■□□□ 1.15
C6orf223-201ENST00000336600 MSH5O43196 834 aa22.23■■□□□ 1.15
C6orf223-201ENST00000336600 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.22■■□□□ 1.15
C6orf223-201ENST00000336600 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.22■■□□□ 1.15
C6orf223-201ENST00000336600 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
C6orf223-201ENST00000336600 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.19■■□□□ 1.14
C6orf223-201ENST00000336600 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.19■■□□□ 1.14
C6orf223-201ENST00000336600 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
C6orf223-201ENST00000336600 ERCC6Q03468 1493 aa22.18■■□□□ 1.14
C6orf223-201ENST00000336600 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
C6orf223-201ENST00000336600 NEFLP07196 543 aa22.17■■□□□ 1.14
C6orf223-201ENST00000336600 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
C6orf223-201ENST00000336600 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.16■■□□□ 1.14
C6orf223-201ENST00000336600 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
C6orf223-201ENST00000336600 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
C6orf223-201ENST00000336600 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
C6orf223-201ENST00000336600 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
C6orf223-201ENST00000336600 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
C6orf223-201ENST00000336600 FMN1Q68DA7 1419 aa22.12■■□□□ 1.13
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C6orf223-201ENST00000336600 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.09■■□□□ 1.13
C6orf223-201ENST00000336600 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
C6orf223-201ENST00000336600 TIAM1Q13009 1591 aa22.05■■□□□ 1.12
C6orf223-201ENST00000336600 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
C6orf223-201ENST00000336600 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.03■■□□□ 1.12
C6orf223-201ENST00000336600 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.01■■□□□ 1.11
C6orf223-201ENST00000336600 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.01■■□□□ 1.11
C6orf223-201ENST00000336600 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.01■■□□□ 1.11
C6orf223-201ENST00000336600 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.01■■□□□ 1.11
C6orf223-201ENST00000336600 RGL3Q3MIN7 710 aa21.99■■□□□ 1.11
C6orf223-201ENST00000336600 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.99■■□□□ 1.11
C6orf223-201ENST00000336600 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.98■■□□□ 1.11
C6orf223-201ENST00000336600 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.97■■□□□ 1.11
C6orf223-201ENST00000336600 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
C6orf223-201ENST00000336600 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
C6orf223-201ENST00000336600 JPH4Q96JJ6 628 aa21.97■■□□□ 1.11
C6orf223-201ENST00000336600 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
C6orf223-201ENST00000336600 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
C6orf223-201ENST00000336600 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
C6orf223-201ENST00000336600 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
C6orf223-201ENST00000336600 NBR1Q14596 966 aa21.93■■□□□ 1.1
C6orf223-201ENST00000336600 NCOA2Q15596 1464 aa21.93■■□□□ 1.1
C6orf223-201ENST00000336600 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.92■■□□□ 1.1
C6orf223-201ENST00000336600 TSPY4P0CV99 314 aa21.92■■□□□ 1.1
C6orf223-201ENST00000336600 TSPY10P0CW01 314 aa21.92■■□□□ 1.1
C6orf223-201ENST00000336600 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
C6orf223-201ENST00000336600 PTPRKQ15262 1439 aa21.9■■□□□ 1.1
C6orf223-201ENST00000336600 WDR97A6NE52 1622 aa21.89■■□□□ 1.09
C6orf223-201ENST00000336600 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
C6orf223-201ENST00000336600 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
C6orf223-201ENST00000336600 PKD2Q13563 968 aa21.86■■□□□ 1.09
C6orf223-201ENST00000336600 MRS2Q9HD23 443 aa21.86■■□□□ 1.09
C6orf223-201ENST00000336600 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.85■■□□□ 1.09
C6orf223-201ENST00000336600 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.85■■□□□ 1.09
C6orf223-201ENST00000336600 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
C6orf223-201ENST00000336600 MAPKBP1O60336 1514 aa21.78■■□□□ 1.08
C6orf223-201ENST00000336600 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
C6orf223-201ENST00000336600 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.75■■□□□ 1.07
C6orf223-201ENST00000336600 PRDM2Q13029 1718 aa21.75■■□□□ 1.07
C6orf223-201ENST00000336600 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.74■■□□□ 1.07
C6orf223-201ENST00000336600 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.73■■□□□ 1.07
C6orf223-201ENST00000336600 GRIN2BQ13224 1484 aa21.73■■□□□ 1.07
C6orf223-201ENST00000336600 NAIPQ13075 1403 aa21.73■■□□□ 1.07
C6orf223-201ENST00000336600 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.72■■□□□ 1.07
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