RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329397.5

PTP4A3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTP4A3, Length 2,785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3-201ENST00000329397 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.12■■□□□ 1.61
PTP4A3-201ENST00000329397 MAPKBP1O60336 1514 aa25.12■■□□□ 1.61
PTP4A3-201ENST00000329397 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.11■■□□□ 1.61
PTP4A3-201ENST00000329397 PRDM2Q13029 1718 aa25.1■■□□□ 1.61
PTP4A3-201ENST00000329397 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.07■■□□□ 1.6
PTP4A3-201ENST00000329397 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PTP4A3-201ENST00000329397 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PTP4A3-201ENST00000329397 BCL11AQ9H165 835 aa25.02■■□□□ 1.6
PTP4A3-201ENST00000329397 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.02■■□□□ 1.6
PTP4A3-201ENST00000329397 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.02■■□□□ 1.6
PTP4A3-201ENST00000329397 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PTP4A3-201ENST00000329397 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25■■□□□ 1.59
PTP4A3-201ENST00000329397 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PTP4A3-201ENST00000329397 WDR97A6NE52 1622 aa24.97■■□□□ 1.59
PTP4A3-201ENST00000329397 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.93■■□□□ 1.58
PTP4A3-201ENST00000329397 MAP3K1Q13233 1512 aa24.92■■□□□ 1.58
PTP4A3-201ENST00000329397 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.91■■□□□ 1.58
PTP4A3-201ENST00000329397 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.88■■□□□ 1.57
PTP4A3-201ENST00000329397 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.87■■□□□ 1.57
PTP4A3-201ENST00000329397 NESP48681 1621 aa24.87■■□□□ 1.57
PTP4A3-201ENST00000329397 BCANQ96GW7 911 aa24.83■■□□□ 1.57
PTP4A3-201ENST00000329397 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PTP4A3-201ENST00000329397 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.79■■□□□ 1.56
PTP4A3-201ENST00000329397 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.77■■□□□ 1.56
PTP4A3-201ENST00000329397 TOPBP1Q92547 1522 aa24.77■■□□□ 1.56
PTP4A3-201ENST00000329397 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.74■■□□□ 1.55
PTP4A3-201ENST00000329397 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.74■■□□□ 1.55
PTP4A3-201ENST00000329397 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.73■■□□□ 1.55
PTP4A3-201ENST00000329397 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.72■■□□□ 1.55
PTP4A3-201ENST00000329397 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PTP4A3-201ENST00000329397 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PTP4A3-201ENST00000329397 TRIM52Q96A61 297 aa24.69■■□□□ 1.54
PTP4A3-201ENST00000329397 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.68■■□□□ 1.54
PTP4A3-201ENST00000329397 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.68■■□□□ 1.54
PTP4A3-201ENST00000329397 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.68■■□□□ 1.54
PTP4A3-201ENST00000329397 PTPRKQ15262 1439 aa24.67■■□□□ 1.54
PTP4A3-201ENST00000329397 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.66■■□□□ 1.54
PTP4A3-201ENST00000329397 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.65■■□□□ 1.54
PTP4A3-201ENST00000329397 FKBP8Q14318 412 aa24.65■■□□□ 1.54
PTP4A3-201ENST00000329397 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.63■■□□□ 1.53
PTP4A3-201ENST00000329397 TONSLQ96HA7 1378 aa24.63■■□□□ 1.53
PTP4A3-201ENST00000329397 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.62■■□□□ 1.53
PTP4A3-201ENST00000329397 CUL7Q14999 1698 aa24.6■■□□□ 1.53
PTP4A3-201ENST00000329397 FMN1Q68DA7 1419 aa24.6■■□□□ 1.53
PTP4A3-201ENST00000329397 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.59■■□□□ 1.53
PTP4A3-201ENST00000329397 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PTP4A3-201ENST00000329397 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.534e-7■■■■□ 23.2
PTP4A3-201ENST00000329397 ANP32CO43423 234 aa24.57■■□□□ 1.52
PTP4A3-201ENST00000329397 ARID3CA6NKF2 412 aa24.56■■□□□ 1.52
PTP4A3-201ENST00000329397 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.56■■□□□ 1.52
PTP4A3-201ENST00000329397 SLC24A1O60721 1099 aa24.55■■□□□ 1.52
PTP4A3-201ENST00000329397 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.55■■□□□ 1.52
PTP4A3-201ENST00000329397 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.54■■□□□ 1.52
PTP4A3-201ENST00000329397 NCOA2Q15596 1464 aa24.53■■□□□ 1.52
PTP4A3-201ENST00000329397 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.526e-7■■■■□ 21.6
PTP4A3-201ENST00000329397 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.51■■□□□ 1.51
PTP4A3-201ENST00000329397 HFM1A2PYH4 1435 aa24.51■■□□□ 1.51
PTP4A3-201ENST00000329397 NAIPQ13075 1403 aa24.49■■□□□ 1.51
PTP4A3-201ENST00000329397 UACAQ9BZF9 1416 aa24.49■■□□□ 1.51
PTP4A3-201ENST00000329397 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.47■■□□□ 1.51
PTP4A3-201ENST00000329397 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.47■■□□□ 1.51
PTP4A3-201ENST00000329397 SAMD9Q5K651 1589 aa24.44■■□□□ 1.5
PTP4A3-201ENST00000329397 GRIN2BQ13224 1484 aa24.44■■□□□ 1.5
PTP4A3-201ENST00000329397 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.43■■□□□ 1.5
PTP4A3-201ENST00000329397 CCER2I3L3R5 266 aa24.42■■□□□ 1.5
PTP4A3-201ENST00000329397 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.42■■□□□ 1.5
PTP4A3-201ENST00000329397 NEFLP07196 543 aa24.4■■□□□ 1.5
PTP4A3-201ENST00000329397 FOXD1Q16676 465 aa24.39■■□□□ 1.49
PTP4A3-201ENST00000329397 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PTP4A3-201ENST00000329397 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.35■■□□□ 1.49
PTP4A3-201ENST00000329397 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.34■■□□□ 1.49
PTP4A3-201ENST00000329397 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.33■■□□□ 1.49
PTP4A3-201ENST00000329397 KDM6BO15054 1643 aa24.33■■□□□ 1.48
PTP4A3-201ENST00000329397 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.32■■□□□ 1.48
PTP4A3-201ENST00000329397 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PTP4A3-201ENST00000329397 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PTP4A3-201ENST00000329397 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
PTP4A3-201ENST00000329397 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.3■■□□□ 1.48
PTP4A3-201ENST00000329397 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PTP4A3-201ENST00000329397 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PTP4A3-201ENST00000329397 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.3■■□□□ 1.48
PTP4A3-201ENST00000329397 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.25■■□□□ 1.47
PTP4A3-201ENST00000329397 CCDC184Q52MB2 194 aa24.24■■□□□ 1.47
PTP4A3-201ENST00000329397 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PTP4A3-201ENST00000329397 ARHGEF11O15085 1522 aa24.23■■□□□ 1.47
PTP4A3-201ENST00000329397 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.22■■□□□ 1.47
PTP4A3-201ENST00000329397 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.21■■□□□ 1.47
PTP4A3-201ENST00000329397 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
PTP4A3-201ENST00000329397 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.18■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 HECW1Q76N89 1606 aa24.16■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.16■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 IQGAP2Q13576 1575 aa24.15■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 PBRM1Q86U86 1689 aa24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms