RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
NOP56-201ENST00000329276 WDR97A6NE52 1622 aa27.24■■□□□ 1.95
NOP56-201ENST00000329276 MAP3K1Q13233 1512 aa27.21■■□□□ 1.95
NOP56-201ENST00000329276 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.21■■□□□ 1.95
NOP56-201ENST00000329276 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.2■■□□□ 1.95
NOP56-201ENST00000329276 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.16■■□□□ 1.94
NOP56-201ENST00000329276 ANP32CO43423 234 aa27.16■■□□□ 1.94
NOP56-201ENST00000329276 MSH5O43196 834 aa27.12■■□□□ 1.93
NOP56-201ENST00000329276 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.11■■□□□ 1.93
NOP56-201ENST00000329276 ITGAEP38570 1179 aa27.1■■□□□ 1.93
NOP56-201ENST00000329276 KIF27Q86VH2 1401 aa27.1■■□□□ 1.93
NOP56-201ENST00000329276 TIAM1Q13009 1591 aa27.09■■□□□ 1.93
NOP56-201ENST00000329276 TRIM52Q96A61 297 aa27.08■■□□□ 1.93
NOP56-201ENST00000329276 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.92
NOP56-201ENST00000329276 ERICH6Q7L0X2 663 aa27■■□□□ 1.91
NOP56-201ENST00000329276 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.99■■□□□ 1.91
NOP56-201ENST00000329276 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.98■■□□□ 1.91
NOP56-201ENST00000329276 CFTRP13569 1480 aa26.96■■□□□ 1.91
NOP56-201ENST00000329276 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.96■■□□□ 1.91
NOP56-201ENST00000329276 CUX1P39880 1505 aa26.93■■□□□ 1.9
NOP56-201ENST00000329276 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.92■■□□□ 1.9
NOP56-201ENST00000329276 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.88■■□□□ 1.89
NOP56-201ENST00000329276 NESP48681 1621 aa26.87■■□□□ 1.89
NOP56-201ENST00000329276 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.86■■□□□ 1.89
NOP56-201ENST00000329276 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
NOP56-201ENST00000329276 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.81■■□□□ 1.88
NOP56-201ENST00000329276 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
NOP56-201ENST00000329276 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
NOP56-201ENST00000329276 TONSLQ96HA7 1378 aa26.78■■□□□ 1.88
NOP56-201ENST00000329276 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
NOP56-201ENST00000329276 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.76■■□□□ 1.87
NOP56-201ENST00000329276 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
NOP56-201ENST00000329276 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
NOP56-201ENST00000329276 IGF1RP08069 1367 aa26.66■■□□□ 1.86
NOP56-201ENST00000329276 PRDM2Q13029 1718 aa26.66■■□□□ 1.86
NOP56-201ENST00000329276 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
NOP56-201ENST00000329276 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.65■■□□□ 1.86
NOP56-201ENST00000329276 UACAQ9BZF9 1416 aa26.64■■□□□ 1.85
NOP56-201ENST00000329276 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
NOP56-201ENST00000329276 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.61■■□□□ 1.85
NOP56-201ENST00000329276 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.6■■□□□ 1.85
NOP56-201ENST00000329276 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.58■■□□□ 1.84
NOP56-201ENST00000329276 HFM1A2PYH4 1435 aa26.57■■□□□ 1.84
NOP56-201ENST00000329276 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.55■■□□□ 1.84
NOP56-201ENST00000329276 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.848e-13■■■■■ 29.6
NOP56-201ENST00000329276 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.54■■□□□ 1.84
NOP56-201ENST00000329276 NCOA2Q15596 1464 aa26.53■■□□□ 1.84
NOP56-201ENST00000329276 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
NOP56-201ENST00000329276 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.52■■□□□ 1.84
NOP56-201ENST00000329276 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.51■■□□□ 1.83
NOP56-201ENST00000329276 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.5■■□□□ 1.83
NOP56-201ENST00000329276 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.49■■□□□ 1.83
NOP56-201ENST00000329276 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.49■■□□□ 1.83
NOP56-201ENST00000329276 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.48■■□□□ 1.83
NOP56-201ENST00000329276 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.47■■□□□ 1.83
NOP56-201ENST00000329276 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.47■■□□□ 1.83
NOP56-201ENST00000329276 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.44■■□□□ 1.82
NOP56-201ENST00000329276 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.41■■□□□ 1.82
NOP56-201ENST00000329276 NAIPQ13075 1403 aa26.4■■□□□ 1.82
NOP56-201ENST00000329276 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
NOP56-201ENST00000329276 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.39■■□□□ 1.81
NOP56-201ENST00000329276 FMN1Q68DA7 1419 aa26.37■■□□□ 1.81
NOP56-201ENST00000329276 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
NOP56-201ENST00000329276 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.36■■□□□ 1.81
NOP56-201ENST00000329276 PTPRKQ15262 1439 aa26.35■■□□□ 1.81
NOP56-201ENST00000329276 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
NOP56-201ENST00000329276 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
NOP56-201ENST00000329276 TOPBP1Q92547 1522 aa26.34■■□□□ 1.81
NOP56-201ENST00000329276 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
NOP56-201ENST00000329276 NBR1Q14596 966 aa26.31■■□□□ 1.8
NOP56-201ENST00000329276 NCOA1Q15788 1441 aa26.3■■□□□ 1.8
NOP56-201ENST00000329276 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.3■■□□□ 1.8
NOP56-201ENST00000329276 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
NOP56-201ENST00000329276 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
NOP56-201ENST00000329276 HECW1Q76N89 1606 aa26.29■■□□□ 1.8
NOP56-201ENST00000329276 CCDC184Q52MB2 194 aa26.28■■□□□ 1.8
NOP56-201ENST00000329276 MRS2Q9HD23 443 aa26.28■■□□□ 1.8
NOP56-201ENST00000329276 P3H3Q8IVL6 736 aa26.28■■□□□ 1.8
NOP56-201ENST00000329276 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
NOP56-201ENST00000329276 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.28■■□□□ 1.8
NOP56-201ENST00000329276 CCDC7Q96M83 1385 aa26.26■■□□□ 1.79
NOP56-201ENST00000329276 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
NOP56-201ENST00000329276 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.26■■□□□ 1.79
NOP56-201ENST00000329276 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
NOP56-201ENST00000329276 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.26■■□□□ 1.79
NOP56-201ENST00000329276 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.26■■□□□ 1.79
NOP56-201ENST00000329276 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
NOP56-201ENST00000329276 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.24■■□□□ 1.79
NOP56-201ENST00000329276 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.22■■□□□ 1.79
NOP56-201ENST00000329276 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.22■■□□□ 1.79
NOP56-201ENST00000329276 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.21■■□□□ 1.79
NOP56-201ENST00000329276 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
NOP56-201ENST00000329276 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.21■■□□□ 1.79
NOP56-201ENST00000329276 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
NOP56-201ENST00000329276 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
NOP56-201ENST00000329276 AKNAQ7Z591 1439 aa26.18■■□□□ 1.78
NOP56-201ENST00000329276 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
NOP56-201ENST00000329276 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
NOP56-201ENST00000329276 CUL7Q14999 1698 aa26.16■■□□□ 1.78
NOP56-201ENST00000329276 ERCC6Q03468 1493 aa26.16■■□□□ 1.78
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