RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323578.12

CHID1-201, Transcript of chitinase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHID1, Length 3,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1-201ENST00000323578 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.91■■□□□ 1.26
CHID1-201ENST00000323578 NCAPD3P42695 1498 aa22.9■■□□□ 1.26
CHID1-201ENST00000323578 BCL11AQ9H165 835 aa22.9■■□□□ 1.26
CHID1-201ENST00000323578 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CHID1-201ENST00000323578 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.89■■□□□ 1.25
CHID1-201ENST00000323578 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.88■■□□□ 1.25
CHID1-201ENST00000323578 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.85■■□□□ 1.25
CHID1-201ENST00000323578 CFTRP13569 1480 aa22.85■■□□□ 1.25
CHID1-201ENST00000323578 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.84■■□□□ 1.25
CHID1-201ENST00000323578 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.81■■□□□ 1.24
CHID1-201ENST00000323578 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.8■■□□□ 1.24
CHID1-201ENST00000323578 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.8■■□□□ 1.24
CHID1-201ENST00000323578 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.8■■□□□ 1.24
CHID1-201ENST00000323578 ANP32CO43423 234 aa22.79■■□□□ 1.24
CHID1-201ENST00000323578 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CHID1-201ENST00000323578 NEFLP07196 543 aa22.77■■□□□ 1.24
CHID1-201ENST00000323578 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CHID1-201ENST00000323578 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.75■■□□□ 1.23
CHID1-201ENST00000323578 TONSLQ96HA7 1378 aa22.73■■□□□ 1.23
CHID1-201ENST00000323578 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.72■■□□□ 1.23
CHID1-201ENST00000323578 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CHID1-201ENST00000323578 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.71■■□□□ 1.23
CHID1-201ENST00000323578 WDR97A6NE52 1622 aa22.71■■□□□ 1.23
CHID1-201ENST00000323578 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CHID1-201ENST00000323578 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.69■■□□□ 1.22
CHID1-201ENST00000323578 FOXD1Q16676 465 aa22.68■■□□□ 1.22
CHID1-201ENST00000323578 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.68■■□□□ 1.22
CHID1-201ENST00000323578 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.67■■□□□ 1.22
CHID1-201ENST00000323578 HMGXB3Q12766 1538 aa22.67■■□□□ 1.22
CHID1-201ENST00000323578 MAPKBP1O60336 1514 aa22.66■■□□□ 1.22
CHID1-201ENST00000323578 NESP48681 1621 aa22.65■■□□□ 1.22
CHID1-201ENST00000323578 TIAM1Q13009 1591 aa22.64■■□□□ 1.21
CHID1-201ENST00000323578 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
CHID1-201ENST00000323578 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.62■■□□□ 1.21
CHID1-201ENST00000323578 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.61■■□□□ 1.21
CHID1-201ENST00000323578 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CHID1-201ENST00000323578 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CHID1-201ENST00000323578 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.51■■□□□ 1.19
CHID1-201ENST00000323578 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CHID1-201ENST00000323578 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CHID1-201ENST00000323578 PTPRKQ15262 1439 aa22.43■■□□□ 1.18
CHID1-201ENST00000323578 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.42■■□□□ 1.18
CHID1-201ENST00000323578 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CHID1-201ENST00000323578 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.41■■□□□ 1.18
CHID1-201ENST00000323578 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.4■■□□□ 1.18
CHID1-201ENST00000323578 CCDC184Q52MB2 194 aa22.39■■□□□ 1.17
CHID1-201ENST00000323578 FBLN2P98095 1184 aa22.38■■□□□ 1.17
CHID1-201ENST00000323578 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CHID1-201ENST00000323578 TOPBP1Q92547 1522 aa22.36■■□□□ 1.17
CHID1-201ENST00000323578 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.36■■□□□ 1.17
CHID1-201ENST00000323578 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.35■■□□□ 1.17
CHID1-201ENST00000323578 FMN1Q68DA7 1419 aa22.34■■□□□ 1.17
CHID1-201ENST00000323578 CCER2I3L3R5 266 aa22.34■■□□□ 1.17
CHID1-201ENST00000323578 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.34■■□□□ 1.17
CHID1-201ENST00000323578 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 31.4
CHID1-201ENST00000323578 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.168e-8■■■■■ 31.9
CHID1-201ENST00000323578 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.32■■□□□ 1.16
CHID1-201ENST00000323578 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CHID1-201ENST00000323578 MRS2Q9HD23 443 aa22.3■■□□□ 1.16
CHID1-201ENST00000323578 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.3■■□□□ 1.16
CHID1-201ENST00000323578 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.29■■□□□ 1.16
CHID1-201ENST00000323578 NCOA2Q15596 1464 aa22.28■■□□□ 1.16
CHID1-201ENST00000323578 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.28■■□□□ 1.16
CHID1-201ENST00000323578 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CHID1-201ENST00000323578 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CHID1-201ENST00000323578 MAP3K1Q13233 1512 aa22.25■■□□□ 1.15
CHID1-201ENST00000323578 NAIPQ13075 1403 aa22.24■■□□□ 1.15
CHID1-201ENST00000323578 UACAQ9BZF9 1416 aa22.23■■□□□ 1.15
CHID1-201ENST00000323578 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.23■■□□□ 1.15
CHID1-201ENST00000323578 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.22■■□□□ 1.15
CHID1-201ENST00000323578 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.22■■□□□ 1.15
CHID1-201ENST00000323578 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.21■■□□□ 1.15
CHID1-201ENST00000323578 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.21■■□□□ 1.15
CHID1-201ENST00000323578 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CHID1-201ENST00000323578 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.19■■□□□ 1.14
CHID1-201ENST00000323578 HFM1A2PYH4 1435 aa22.18■■□□□ 1.14
CHID1-201ENST00000323578 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CHID1-201ENST00000323578 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CHID1-201ENST00000323578 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.17■■□□□ 1.14
CHID1-201ENST00000323578 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.17■■□□□ 1.14
CHID1-201ENST00000323578 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.13■■□□□ 1.13
CHID1-201ENST00000323578 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.11■■□□□ 1.13
CHID1-201ENST00000323578 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.11■■□□□ 1.13
CHID1-201ENST00000323578 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CHID1-201ENST00000323578 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.1■■□□□ 1.13
CHID1-201ENST00000323578 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.09■■□□□ 1.13
CHID1-201ENST00000323578 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CHID1-201ENST00000323578 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CHID1-201ENST00000323578 PRDM2Q13029 1718 aa22.05■■□□□ 1.12
CHID1-201ENST00000323578 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.126e-6■■■□□ 18
CHID1-201ENST00000323578 MSH5O43196 834 aa22.02■■□□□ 1.12
CHID1-201ENST00000323578 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.02■■□□□ 1.12
CHID1-201ENST00000323578 PKD2Q13563 968 aa21.99■■□□□ 1.11
CHID1-201ENST00000323578 GRIN2BQ13224 1484 aa21.99■■□□□ 1.11
CHID1-201ENST00000323578 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.99■■□□□ 1.11
CHID1-201ENST00000323578 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CHID1-201ENST00000323578 KDM6BO15054 1643 aa21.97■■□□□ 1.11
CHID1-201ENST00000323578 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.97■■□□□ 1.11
CHID1-201ENST00000323578 CCDC7Q96M83 1385 aa21.97■■□□□ 1.11
CHID1-201ENST00000323578 CUL7Q14999 1698 aa21.96■■□□□ 1.11
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