RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317945.6

CCDC34-201, Transcript of coiled-coil domain containing 34, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC34, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34-201ENST00000317945 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.26■■□□□ 1.95
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CCDC34-201ENST00000317945 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.21■■□□□ 1.95
CCDC34-201ENST00000317945 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.17■■□□□ 1.94
CCDC34-201ENST00000317945 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.94
CCDC34-201ENST00000317945 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.15■■□□□ 1.94
CCDC34-201ENST00000317945 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.14■■□□□ 1.94
CCDC34-201ENST00000317945 ITGAEP38570 1179 aa27.14■■□□□ 1.93
CCDC34-201ENST00000317945 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.13■■□□□ 1.93
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CCDC34-201ENST00000317945 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.1■■□□□ 1.93
CCDC34-201ENST00000317945 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.09■■□□□ 1.93
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CCDC34-201ENST00000317945 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.09■■□□□ 1.93
CCDC34-201ENST00000317945 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.06■■□□□ 1.92
CCDC34-201ENST00000317945 CUL7Q14999 1698 aa27.03■■□□□ 1.92
CCDC34-201ENST00000317945 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CCDC34-201ENST00000317945 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
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CCDC34-201ENST00000317945 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.94■■□□□ 1.9
CCDC34-201ENST00000317945 FMN1Q68DA7 1419 aa26.94■■□□□ 1.9
CCDC34-201ENST00000317945 WDR97A6NE52 1622 aa26.93■■□□□ 1.9
CCDC34-201ENST00000317945 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.91■■□□□ 1.9
CCDC34-201ENST00000317945 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.91■■□□□ 1.9
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CCDC34-201ENST00000317945 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.85■■□□□ 1.89
CCDC34-201ENST00000317945 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
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CCDC34-201ENST00000317945 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
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CCDC34-201ENST00000317945 NESP48681 1621 aa26.78■■□□□ 1.88
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CCDC34-201ENST00000317945 HFM1A2PYH4 1435 aa26.78■■□□□ 1.88
CCDC34-201ENST00000317945 SAMD9Q5K651 1589 aa26.77■■□□□ 1.88
CCDC34-201ENST00000317945 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CCDC34-201ENST00000317945 UACAQ9BZF9 1416 aa26.75■■□□□ 1.87
CCDC34-201ENST00000317945 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.74■■□□□ 1.87
CCDC34-201ENST00000317945 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.73■■□□□ 1.87
CCDC34-201ENST00000317945 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.73■■□□□ 1.87
CCDC34-201ENST00000317945 KCNH8Q96L42 1107 aa26.71■■□□□ 1.87
CCDC34-201ENST00000317945 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.7■■□□□ 1.87
CCDC34-201ENST00000317945 GRIN2BQ13224 1484 aa26.68■■□□□ 1.86
CCDC34-201ENST00000317945 TONSLQ96HA7 1378 aa26.68■■□□□ 1.86
CCDC34-201ENST00000317945 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.68■■□□□ 1.86
CCDC34-201ENST00000317945 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.67■■□□□ 1.86
CCDC34-201ENST00000317945 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CCDC34-201ENST00000317945 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.65■■□□□ 1.86
CCDC34-201ENST00000317945 NCOA2Q15596 1464 aa26.64■■□□□ 1.86
CCDC34-201ENST00000317945 ANP32CO43423 234 aa26.64■■□□□ 1.86
CCDC34-201ENST00000317945 PTPRKQ15262 1439 aa26.63■■□□□ 1.85
CCDC34-201ENST00000317945 NAIPQ13075 1403 aa26.62■■□□□ 1.85
CCDC34-201ENST00000317945 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.62■■□□□ 1.85
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CCDC34-201ENST00000317945 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.62■■□□□ 1.85
CCDC34-201ENST00000317945 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.6■■□□□ 1.85
CCDC34-201ENST00000317945 ARHGEF11O15085 1522 aa26.59■■□□□ 1.85
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CCDC34-201ENST00000317945 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.56■■□□□ 1.84
CCDC34-201ENST00000317945 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.55■■□□□ 1.84
CCDC34-201ENST00000317945 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CCDC34-201ENST00000317945 AKNAQ7Z591 1439 aa26.53■■□□□ 1.84
CCDC34-201ENST00000317945 ERCC6Q03468 1493 aa26.53■■□□□ 1.84
CCDC34-201ENST00000317945 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CCDC34-201ENST00000317945 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.47■■□□□ 1.83
CCDC34-201ENST00000317945 NEFLP07196 543 aa26.47■■□□□ 1.83
CCDC34-201ENST00000317945 FKBP8Q14318 412 aa26.46■■□□□ 1.83
CCDC34-201ENST00000317945 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.43■■□□□ 1.82
CCDC34-201ENST00000317945 HECW1Q76N89 1606 aa26.43■■□□□ 1.82
CCDC34-201ENST00000317945 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CCDC34-201ENST00000317945 MIA2Q96PC5 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
CCDC34-201ENST00000317945 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CCDC34-201ENST00000317945 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.39■■□□□ 1.82
CCDC34-201ENST00000317945 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CCDC34-201ENST00000317945 IQGAP2Q13576 1575 aa26.32■■□□□ 1.8
CCDC34-201ENST00000317945 TRIM52Q96A61 297 aa26.31■■□□□ 1.8
CCDC34-201ENST00000317945 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CCDC34-201ENST00000317945 BCANQ96GW7 911 aa26.29■■□□□ 1.8
CCDC34-201ENST00000317945 PBRM1Q86U86 1689 aa26.26■■□□□ 1.79
CCDC34-201ENST00000317945 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.26■■□□□ 1.79
CCDC34-201ENST00000317945 WDR62O43379 1518 aa26.26■■□□□ 1.79
CCDC34-201ENST00000317945 ROCK1Q13464 1354 aa26.25■■□□□ 1.79
CCDC34-201ENST00000317945 ADAMTS12P58397 1594 aa26.25■■□□□ 1.79
CCDC34-201ENST00000317945 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.24■■□□□ 1.79
CCDC34-201ENST00000317945 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
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CCDC34-201ENST00000317945 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.18■■□□□ 1.78
CCDC34-201ENST00000317945 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.18■■□□□ 1.78
CCDC34-201ENST00000317945 KDM6BO15054 1643 aa26.17■■□□□ 1.78
CCDC34-201ENST00000317945 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.16■■□□□ 1.78
CCDC34-201ENST00000317945 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CCDC34-201ENST00000317945 NCOA1Q15788 1441 aa26.13■■□□□ 1.77
CCDC34-201ENST00000317945 DAPK1P53355 1430 aa26.13■■□□□ 1.77
CCDC34-201ENST00000317945 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CCDC34-201ENST00000317945 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
CCDC34-201ENST00000317945 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.12■■□□□ 1.77
CCDC34-201ENST00000317945 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.11■■□□□ 1.77
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