RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312210.9

MINDY1-201, Transcript of MINDY lysine 48 deubiquitinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MINDY1, Length 2,400 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1-201ENST00000312210 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
MINDY1-201ENST00000312210 MAP3K1Q13233 1512 aa23.45■■□□□ 1.34
MINDY1-201ENST00000312210 P3H3Q8IVL6 736 aa23.45■■□□□ 1.34
MINDY1-201ENST00000312210 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.44■■□□□ 1.34
MINDY1-201ENST00000312210 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.42■■□□□ 1.34
MINDY1-201ENST00000312210 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
MINDY1-201ENST00000312210 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.4■■□□□ 1.34
MINDY1-201ENST00000312210 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
MINDY1-201ENST00000312210 WDR97A6NE52 1622 aa23.39■■□□□ 1.34
MINDY1-201ENST00000312210 PRDM2Q13029 1718 aa23.39■■□□□ 1.33
MINDY1-201ENST00000312210 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.36■■□□□ 1.33
MINDY1-201ENST00000312210 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.34■■□□□ 1.33
MINDY1-201ENST00000312210 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
MINDY1-201ENST00000312210 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
MINDY1-201ENST00000312210 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.29■■□□□ 1.32
MINDY1-201ENST00000312210 BCANQ96GW7 911 aa23.29■■□□□ 1.32
MINDY1-201ENST00000312210 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
MINDY1-201ENST00000312210 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.27■■□□□ 1.32
MINDY1-201ENST00000312210 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.21■■□□□ 1.31
MINDY1-201ENST00000312210 FKBP8Q14318 412 aa23.21■■□□□ 1.31
MINDY1-201ENST00000312210 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.2■■□□□ 1.3
MINDY1-201ENST00000312210 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.2■■□□□ 1.3
MINDY1-201ENST00000312210 NESP48681 1621 aa23.17■■□□□ 1.3
MINDY1-201ENST00000312210 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.16■■□□□ 1.3
MINDY1-201ENST00000312210 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.15■■□□□ 1.3
MINDY1-201ENST00000312210 TRIM52Q96A61 297 aa23.14■■□□□ 1.3
MINDY1-201ENST00000312210 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
MINDY1-201ENST00000312210 ANP32CO43423 234 aa23.11■■□□□ 1.29
MINDY1-201ENST00000312210 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.1■■□□□ 1.29
MINDY1-201ENST00000312210 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.09■■□□□ 1.29
MINDY1-201ENST00000312210 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
MINDY1-201ENST00000312210 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.09■■□□□ 1.29
MINDY1-201ENST00000312210 CCER2I3L3R5 266 aa23.08■■□□□ 1.29
MINDY1-201ENST00000312210 TONSLQ96HA7 1378 aa23.08■■□□□ 1.29
MINDY1-201ENST00000312210 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
MINDY1-201ENST00000312210 PTPRKQ15262 1439 aa23.07■■□□□ 1.28
MINDY1-201ENST00000312210 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.06■■□□□ 1.28
MINDY1-201ENST00000312210 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.05■■□□□ 1.28
MINDY1-201ENST00000312210 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.04■■□□□ 1.28
MINDY1-201ENST00000312210 TOPBP1Q92547 1522 aa23.04■■□□□ 1.28
MINDY1-201ENST00000312210 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.03■■□□□ 1.28
MINDY1-201ENST00000312210 FMN1Q68DA7 1419 aa23.02■■□□□ 1.28
MINDY1-201ENST00000312210 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.02■■□□□ 1.27
MINDY1-201ENST00000312210 NEFLP07196 543 aa23.01■■□□□ 1.27
MINDY1-201ENST00000312210 ANP32EQ9BTT0 268 aa23■■□□□ 1.27
MINDY1-201ENST00000312210 HFM1A2PYH4 1435 aa22.99■■□□□ 1.27
MINDY1-201ENST00000312210 UACAQ9BZF9 1416 aa22.99■■□□□ 1.27
MINDY1-201ENST00000312210 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.97■■□□□ 1.27
MINDY1-201ENST00000312210 CUL7Q14999 1698 aa22.96■■□□□ 1.27
MINDY1-201ENST00000312210 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.95■■□□□ 1.26
MINDY1-201ENST00000312210 NAIPQ13075 1403 aa22.94■■□□□ 1.26
MINDY1-201ENST00000312210 NCOA2Q15596 1464 aa22.92■■□□□ 1.26
MINDY1-201ENST00000312210 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
MINDY1-201ENST00000312210 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.9■■□□□ 1.26
MINDY1-201ENST00000312210 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
MINDY1-201ENST00000312210 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
MINDY1-201ENST00000312210 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.87■■□□□ 1.25
MINDY1-201ENST00000312210 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.87■■□□□ 1.25
MINDY1-201ENST00000312210 GRIN2BQ13224 1484 aa22.86■■□□□ 1.25
MINDY1-201ENST00000312210 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.86■■□□□ 1.25
MINDY1-201ENST00000312210 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.85■■□□□ 1.25
MINDY1-201ENST00000312210 SAMD9Q5K651 1589 aa22.84■■□□□ 1.25
MINDY1-201ENST00000312210 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.84■■□□□ 1.25
MINDY1-201ENST00000312210 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
MINDY1-201ENST00000312210 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.8■■□□□ 1.24
MINDY1-201ENST00000312210 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
MINDY1-201ENST00000312210 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
MINDY1-201ENST00000312210 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.78■■□□□ 1.24
MINDY1-201ENST00000312210 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.78■■□□□ 1.24
MINDY1-201ENST00000312210 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.77■■□□□ 1.24
MINDY1-201ENST00000312210 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
MINDY1-201ENST00000312210 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.76■■□□□ 1.23
MINDY1-201ENST00000312210 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
MINDY1-201ENST00000312210 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.75■■□□□ 1.23
MINDY1-201ENST00000312210 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.74■■□□□ 1.23
MINDY1-201ENST00000312210 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
MINDY1-201ENST00000312210 ARHGEF11O15085 1522 aa22.72■■□□□ 1.23
MINDY1-201ENST00000312210 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.71■■□□□ 1.23
MINDY1-201ENST00000312210 CCDC184Q52MB2 194 aa22.7■■□□□ 1.22
MINDY1-201ENST00000312210 FOXD1Q16676 465 aa22.69■■□□□ 1.22
MINDY1-201ENST00000312210 KDM6BO15054 1643 aa22.69■■□□□ 1.22
MINDY1-201ENST00000312210 ARID3CA6NKF2 412 aa22.68■■□□□ 1.22
MINDY1-201ENST00000312210 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
MINDY1-201ENST00000312210 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.67■■□□□ 1.22
MINDY1-201ENST00000312210 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
MINDY1-201ENST00000312210 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.66■■□□□ 1.22
MINDY1-201ENST00000312210 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
MINDY1-201ENST00000312210 HECW1Q76N89 1606 aa22.63■■□□□ 1.21
MINDY1-201ENST00000312210 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.62■■□□□ 1.21
MINDY1-201ENST00000312210 MSH5O43196 834 aa22.62■■□□□ 1.21
MINDY1-201ENST00000312210 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.61■■□□□ 1.21
MINDY1-201ENST00000312210 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
MINDY1-201ENST00000312210 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
MINDY1-201ENST00000312210 AKNAQ7Z591 1439 aa22.59■■□□□ 1.21
MINDY1-201ENST00000312210 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
MINDY1-201ENST00000312210 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.57■■□□□ 1.2
MINDY1-201ENST00000312210 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
MINDY1-201ENST00000312210 CCDC7Q96M83 1385 aa22.56■■□□□ 1.2
MINDY1-201ENST00000312210 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
MINDY1-201ENST00000312210 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.55■■□□□ 1.2
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