RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310032.12

TSPAN17-202, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TSPAN17-202ENST00000310032 ITGAEP38570 1179 aa28.9■■■□□ 2.22
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TSPAN17-202ENST00000310032 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.64■■■□□ 2.17
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TSPAN17-202ENST00000310032 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.6■■■□□ 2.17
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TSPAN17-202ENST00000310032 SAMD9Q5K651 1589 aa28.39■■■□□ 2.14
TSPAN17-202ENST00000310032 PBRM1Q86U86 1689 aa28.37■■■□□ 2.13
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TSPAN17-202ENST00000310032 FKBP8Q14318 412 aa28.33■■■□□ 2.13
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TSPAN17-202ENST00000310032 ERCC6Q03468 1493 aa28.24■■■□□ 2.11
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TSPAN17-202ENST00000310032 IFT140Q96RY7 1462 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPAN17-202ENST00000310032 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.21■■■□□ 2.11
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TSPAN17-202ENST00000310032 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TSPAN17-202ENST00000310032 GRIN2AQ12879 1464 aa28.03■■■□□ 2.08
TSPAN17-202ENST00000310032 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.02■■■□□ 2.08
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TSPAN17-202ENST00000310032 DISP1Q96F81 1524 aa28.01■■■□□ 2.07
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TSPAN17-202ENST00000310032 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
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TSPAN17-202ENST00000310032 HECW1Q76N89 1606 aa27.98■■■□□ 2.07
TSPAN17-202ENST00000310032 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.98■■■□□ 2.07
TSPAN17-202ENST00000310032 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.95■■■□□ 2.07
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TSPAN17-202ENST00000310032 HFM1A2PYH4 1435 aa27.9■■■□□ 2.06
TSPAN17-202ENST00000310032 CEP170Q5SW79 1584 aa27.89■■■□□ 2.06
TSPAN17-202ENST00000310032 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
TSPAN17-202ENST00000310032 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
TSPAN17-202ENST00000310032 SYNJ2O15056 1496 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPAN17-202ENST00000310032 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TSPAN17-202ENST00000310032 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPAN17-202ENST00000310032 MSH5O43196 834 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPAN17-202ENST00000310032 JPH4Q96JJ6 628 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPAN17-202ENST00000310032 UACAQ9BZF9 1416 aa27.77■■■□□ 2.04
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