RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000305476.9

SEMA4C-201, Transcript of semaphorin 4C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4C, Length 3,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4C-201ENST00000305476 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.2■■□□□ 1.3
SEMA4C-201ENST00000305476 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.18■■□□□ 1.3
SEMA4C-201ENST00000305476 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SEMA4C-201ENST00000305476 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.16■■□□□ 1.3
SEMA4C-201ENST00000305476 TRIM52Q96A61 297 aa23.15■■□□□ 1.3
SEMA4C-201ENST00000305476 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SEMA4C-201ENST00000305476 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SEMA4C-201ENST00000305476 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.14■■□□□ 1.29
SEMA4C-201ENST00000305476 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.13■■□□□ 1.29
SEMA4C-201ENST00000305476 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.11■■□□□ 1.29
SEMA4C-201ENST00000305476 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.07■■□□□ 1.28
SEMA4C-201ENST00000305476 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.03■■□□□ 1.28
SEMA4C-201ENST00000305476 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.03■■□□□ 1.28
SEMA4C-201ENST00000305476 MIER1Q8N108 512 aa23.02■■□□□ 1.28
SEMA4C-201ENST00000305476 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23■■□□□ 1.27
SEMA4C-201ENST00000305476 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.96■■□□□ 1.27
SEMA4C-201ENST00000305476 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.95■■□□□ 1.26
SEMA4C-201ENST00000305476 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SEMA4C-201ENST00000305476 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SEMA4C-201ENST00000305476 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SEMA4C-201ENST00000305476 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SEMA4C-201ENST00000305476 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.86■■□□□ 1.25
SEMA4C-201ENST00000305476 FMN1Q68DA7 1419 aa22.85■■□□□ 1.25
SEMA4C-201ENST00000305476 FOXD1Q16676 465 aa22.84■■□□□ 1.25
SEMA4C-201ENST00000305476 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.81■■□□□ 1.24
SEMA4C-201ENST00000305476 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.81■■□□□ 1.24
SEMA4C-201ENST00000305476 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SEMA4C-201ENST00000305476 JPH4Q96JJ6 628 aa22.8■■□□□ 1.24
SEMA4C-201ENST00000305476 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SEMA4C-201ENST00000305476 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.8■■□□□ 1.24
SEMA4C-201ENST00000305476 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SEMA4C-201ENST00000305476 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.78■■□□□ 1.24
SEMA4C-201ENST00000305476 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SEMA4C-201ENST00000305476 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SEMA4C-201ENST00000305476 KCNH8Q96L42 1107 aa22.76■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.75■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 TIAM1Q13009 1591 aa22.73■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.72■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 PRDM2Q13029 1718 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 GRIN2BQ13224 1484 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.7■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA4C-201ENST00000305476 TONSLQ96HA7 1378 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4C-201ENST00000305476 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4C-201ENST00000305476 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.61■■□□□ 1.21
SEMA4C-201ENST00000305476 IFT140Q96RY7 1462 aa22.6■■□□□ 1.21
SEMA4C-201ENST00000305476 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.59■■□□□ 1.21
SEMA4C-201ENST00000305476 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SEMA4C-201ENST00000305476 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SEMA4C-201ENST00000305476 NCOA2Q15596 1464 aa22.59■■□□□ 1.21
SEMA4C-201ENST00000305476 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4C-201ENST00000305476 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.23e-8■□□□□ 9.7
SEMA4C-201ENST00000305476 CUL7Q14999 1698 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4C-201ENST00000305476 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.52■■□□□ 1.2
SEMA4C-201ENST00000305476 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.5■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 PTPRKQ15262 1439 aa22.49■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.48■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 TSPY4P0CV99 314 aa22.48■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 TSPY10P0CW01 314 aa22.48■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.47■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.47■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 IQGAP2Q13576 1575 aa22.45■■□□□ 1.18
SEMA4C-201ENST00000305476 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.45■■□□□ 1.18
SEMA4C-201ENST00000305476 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.45■■□□□ 1.18
SEMA4C-201ENST00000305476 GRIN2AQ12879 1464 aa22.42■■□□□ 1.18
SEMA4C-201ENST00000305476 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.42■■□□□ 1.18
SEMA4C-201ENST00000305476 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SEMA4C-201ENST00000305476 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.4■■□□□ 1.18
SEMA4C-201ENST00000305476 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.38■■□□□ 1.17
SEMA4C-201ENST00000305476 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.37■■□□□ 1.17
SEMA4C-201ENST00000305476 ANP32CO43423 234 aa22.37■■□□□ 1.17
SEMA4C-201ENST00000305476 PTPRGP23470 1445 aa22.36■■□□□ 1.17
SEMA4C-201ENST00000305476 RGL3Q3MIN7 710 aa22.36■■□□□ 1.17
SEMA4C-201ENST00000305476 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.36■■□□□ 1.17
SEMA4C-201ENST00000305476 MAP3K1Q13233 1512 aa22.34■■□□□ 1.17
SEMA4C-201ENST00000305476 PKD2Q13563 968 aa22.32■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 BCANQ96GW7 911 aa22.32■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 ADAMTS12P58397 1594 aa22.31■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 NAIPQ13075 1403 aa22.29■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.29■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 SYNJ2O15056 1496 aa22.29■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 WDR62O43379 1518 aa22.28■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 PBRM1Q86U86 1689 aa22.27■■□□□ 1.15
SEMA4C-201ENST00000305476 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SEMA4C-201ENST00000305476 MAPKBP1O60336 1514 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA4C-201ENST00000305476 WDR97A6NE52 1622 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA4C-201ENST00000305476 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.155e-6■■□□□ 11.4
SEMA4C-201ENST00000305476 DISP1Q96F81 1524 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA4C-201ENST00000305476 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms