RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299563.4

RNF169-201, Transcript of ring finger protein 169, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF169, Length 7,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169-201ENST00000299563 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.94■■□□□ 1.26
RNF169-201ENST00000299563 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.261e-6■■□□□ 13
RNF169-201ENST00000299563 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
RNF169-201ENST00000299563 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
RNF169-201ENST00000299563 NPHP1O15259 732 aa22.88■■□□□ 1.25
RNF169-201ENST00000299563 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
RNF169-201ENST00000299563 NRDCO43847 1150 aa22.83■■□□□ 1.25
RNF169-201ENST00000299563 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.8■■□□□ 1.24
RNF169-201ENST00000299563 PLCB2Q00722 1185 aa22.8■■□□□ 1.24
RNF169-201ENST00000299563 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.8■■□□□ 1.24
RNF169-201ENST00000299563 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
RNF169-201ENST00000299563 MRS2Q9HD23 443 aa22.79■■□□□ 1.24
RNF169-201ENST00000299563 CLSTN1O94985 981 aa22.78■■□□□ 1.24
RNF169-201ENST00000299563 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.76■■□□□ 1.23
RNF169-201ENST00000299563 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RNF169-201ENST00000299563 FGD1P98174 961 aa22.73■■□□□ 1.23
RNF169-201ENST00000299563 GOLGA2Q08379 1002 aa22.72■■□□□ 1.23
RNF169-201ENST00000299563 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RNF169-201ENST00000299563 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RNF169-201ENST00000299563 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
RNF169-201ENST00000299563 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RNF169-201ENST00000299563 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RNF169-201ENST00000299563 KCNJ4P48050 445 aa22.63■■□□□ 1.21
RNF169-201ENST00000299563 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RNF169-201ENST00000299563 CFAP53Q96M91 514 aa22.62■■□□□ 1.21
RNF169-201ENST00000299563 TSPY4P0CV99 314 aa22.62■■□□□ 1.21
RNF169-201ENST00000299563 TSPY10P0CW01 314 aa22.62■■□□□ 1.21
RNF169-201ENST00000299563 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.61■■□□□ 1.21
RNF169-201ENST00000299563 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
RNF169-201ENST00000299563 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.6■■□□□ 1.21
RNF169-201ENST00000299563 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
RNF169-201ENST00000299563 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
RNF169-201ENST00000299563 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.58■■□□□ 1.21
RNF169-201ENST00000299563 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.58■■□□□ 1.21
RNF169-201ENST00000299563 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
RNF169-201ENST00000299563 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RNF169-201ENST00000299563 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
RNF169-201ENST00000299563 DRC7Q8IY82 874 aa22.55■■□□□ 1.2
RNF169-201ENST00000299563 ABCC9O60706 1549 aa22.52■■□□□ 1.2
RNF169-201ENST00000299563 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
RNF169-201ENST00000299563 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RNF169-201ENST00000299563 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
RNF169-201ENST00000299563 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RNF169-201ENST00000299563 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.47■■□□□ 1.19
RNF169-201ENST00000299563 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.198e-7■■■□□ 16.1
RNF169-201ENST00000299563 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.44■■□□□ 1.18
RNF169-201ENST00000299563 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
RNF169-201ENST00000299563 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.44■■□□□ 1.18
RNF169-201ENST00000299563 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.43■■□□□ 1.18
RNF169-201ENST00000299563 CDCA8Q53HL2 280 aa22.43■■□□□ 1.18
RNF169-201ENST00000299563 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RNF169-201ENST00000299563 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
RNF169-201ENST00000299563 MCCP23508 829 aa22.39■■□□□ 1.17
RNF169-201ENST00000299563 NUDCQ9Y266 331 aa22.36■■□□□ 1.17
RNF169-201ENST00000299563 MS4A1P11836 297 aa22.35■■□□□ 1.17
RNF169-201ENST00000299563 HSCBQ8IWL3 235 aa22.35■■□□□ 1.17
RNF169-201ENST00000299563 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
RNF169-201ENST00000299563 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.34■■□□□ 1.17
RNF169-201ENST00000299563 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
RNF169-201ENST00000299563 NEUROD2Q15784 382 aa22.32■■□□□ 1.16
RNF169-201ENST00000299563 RGS3P49796 1198 aa22.3■■□□□ 1.16
RNF169-201ENST00000299563 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RNF169-201ENST00000299563 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RNF169-201ENST00000299563 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.27■■□□□ 1.16
RNF169-201ENST00000299563 RGL3Q3MIN7 710 aa22.27■■□□□ 1.16
RNF169-201ENST00000299563 CFAP44Q96MT7 982 aa22.26■■□□□ 1.15
RNF169-201ENST00000299563 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RNF169-201ENST00000299563 POGKQ9P215 609 aa22.23■■□□□ 1.15
RNF169-201ENST00000299563 USP35Q9P2H5 1018 aa22.22■■□□□ 1.15
RNF169-201ENST00000299563 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RNF169-201ENST00000299563 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RNF169-201ENST00000299563 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.2■■□□□ 1.14
RNF169-201ENST00000299563 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RNF169-201ENST00000299563 TPM4P67936 248 aa22.19■■□□□ 1.14
RNF169-201ENST00000299563 KCNH8Q96L42 1107 aa22.18■■□□□ 1.14
RNF169-201ENST00000299563 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.17■■□□□ 1.14
RNF169-201ENST00000299563 MIER1Q8N108 512 aa22.17■■□□□ 1.14
RNF169-201ENST00000299563 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RNF169-201ENST00000299563 PDE4CQ08493 712 aa22.16■■□□□ 1.14
RNF169-201ENST00000299563 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.15■■□□□ 1.14
RNF169-201ENST00000299563 PTMSP20962 102 aa22.15■■□□□ 1.14
RNF169-201ENST00000299563 CEP89Q96ST8 783 aa22.15■■□□□ 1.14
RNF169-201ENST00000299563 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RNF169-201ENST00000299563 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.14■■□□□ 1.13
RNF169-201ENST00000299563 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF169-201ENST00000299563 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RNF169-201ENST00000299563 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RNF169-201ENST00000299563 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.08■■□□□ 1.13
RNF169-201ENST00000299563 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RNF169-201ENST00000299563 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.07■■□□□ 1.12
RNF169-201ENST00000299563 ARID3AQ99856 593 aa22.06■■□□□ 1.12
RNF169-201ENST00000299563 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RNF169-201ENST00000299563 GBP4Q96PP9 640 aa22.05■■□□□ 1.12
RNF169-201ENST00000299563 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RNF169-201ENST00000299563 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RNF169-201ENST00000299563 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.01■■□□□ 1.11
RNF169-201ENST00000299563 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22■■□□□ 1.11
RNF169-201ENST00000299563 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22■■□□□ 1.11
RNF169-201ENST00000299563 G3V3G9 751 aa21.99■■□□□ 1.11
RNF169-201ENST00000299563 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.99■■□□□ 1.11
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