RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294309.7

TPCN2-201, Transcript of two pore segment channel 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPCN2, Length 2,931 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN2-201ENST00000294309 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.14■■□□□ 1.94
TPCN2-201ENST00000294309 P3H3Q8IVL6 736 aa27.14■■□□□ 1.94
TPCN2-201ENST00000294309 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
TPCN2-201ENST00000294309 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TPCN2-201ENST00000294309 MAP3K1Q13233 1512 aa27.13■■□□□ 1.93
TPCN2-201ENST00000294309 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.08■■□□□ 1.93
TPCN2-201ENST00000294309 WDR97A6NE52 1622 aa27.07■■□□□ 1.92
TPCN2-201ENST00000294309 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.05■■□□□ 1.92
TPCN2-201ENST00000294309 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.02■■□□□ 1.92
TPCN2-201ENST00000294309 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.02■■□□□ 1.92
TPCN2-201ENST00000294309 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
TPCN2-201ENST00000294309 BCANQ96GW7 911 aa27■■□□□ 1.91
TPCN2-201ENST00000294309 PRDM2Q13029 1718 aa26.99■■□□□ 1.91
TPCN2-201ENST00000294309 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
TPCN2-201ENST00000294309 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TPCN2-201ENST00000294309 FKBP8Q14318 412 aa26.93■■□□□ 1.9
TPCN2-201ENST00000294309 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.92■■□□□ 1.9
TPCN2-201ENST00000294309 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.91■■□□□ 1.9
TPCN2-201ENST00000294309 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.9■■□□□ 1.9
TPCN2-201ENST00000294309 TRIM52Q96A61 297 aa26.82■■□□□ 1.88
TPCN2-201ENST00000294309 ANP32CO43423 234 aa26.82■■□□□ 1.88
TPCN2-201ENST00000294309 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.8■■□□□ 1.88
TPCN2-201ENST00000294309 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.79■■□□□ 1.88
TPCN2-201ENST00000294309 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.77■■□□□ 1.88
TPCN2-201ENST00000294309 CCER2I3L3R5 266 aa26.77■■□□□ 1.88
TPCN2-201ENST00000294309 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.77■■□□□ 1.88
TPCN2-201ENST00000294309 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
TPCN2-201ENST00000294309 NEFLP07196 543 aa26.75■■□□□ 1.87
TPCN2-201ENST00000294309 TONSLQ96HA7 1378 aa26.75■■□□□ 1.87
TPCN2-201ENST00000294309 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.72■■□□□ 1.87
TPCN2-201ENST00000294309 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.71■■□□□ 1.87
TPCN2-201ENST00000294309 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.7■■□□□ 1.87
TPCN2-201ENST00000294309 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.862e-7■■■■■ 35
TPCN2-201ENST00000294309 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.67■■□□□ 1.86
TPCN2-201ENST00000294309 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.67■■□□□ 1.86
TPCN2-201ENST00000294309 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.67■■□□□ 1.86
TPCN2-201ENST00000294309 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
TPCN2-201ENST00000294309 PTPRKQ15262 1439 aa26.65■■□□□ 1.86
TPCN2-201ENST00000294309 FMN1Q68DA7 1419 aa26.64■■□□□ 1.86
TPCN2-201ENST00000294309 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.63■■□□□ 1.85
TPCN2-201ENST00000294309 TOPBP1Q92547 1522 aa26.62■■□□□ 1.85
TPCN2-201ENST00000294309 UACAQ9BZF9 1416 aa26.61■■□□□ 1.85
TPCN2-201ENST00000294309 HFM1A2PYH4 1435 aa26.6■■□□□ 1.85
TPCN2-201ENST00000294309 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.58■■□□□ 1.85
TPCN2-201ENST00000294309 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.57■■□□□ 1.84
TPCN2-201ENST00000294309 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.56■■□□□ 1.84
TPCN2-201ENST00000294309 CUL7Q14999 1698 aa26.55■■□□□ 1.84
TPCN2-201ENST00000294309 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.54■■□□□ 1.84
TPCN2-201ENST00000294309 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
TPCN2-201ENST00000294309 NAIPQ13075 1403 aa26.54■■□□□ 1.84
TPCN2-201ENST00000294309 NESP48681 1621 aa26.53■■□□□ 1.84
TPCN2-201ENST00000294309 NCOA2Q15596 1464 aa26.51■■□□□ 1.83
TPCN2-201ENST00000294309 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.49■■□□□ 1.83
TPCN2-201ENST00000294309 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
TPCN2-201ENST00000294309 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TPCN2-201ENST00000294309 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.46■■□□□ 1.83
TPCN2-201ENST00000294309 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.45■■□□□ 1.82
TPCN2-201ENST00000294309 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.42■■□□□ 1.82
TPCN2-201ENST00000294309 GRIN2BQ13224 1484 aa26.41■■□□□ 1.82
TPCN2-201ENST00000294309 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.41■■□□□ 1.82
TPCN2-201ENST00000294309 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
TPCN2-201ENST00000294309 SAMD9Q5K651 1589 aa26.38■■□□□ 1.81
TPCN2-201ENST00000294309 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.38■■□□□ 1.81
TPCN2-201ENST00000294309 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
TPCN2-201ENST00000294309 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
TPCN2-201ENST00000294309 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
TPCN2-201ENST00000294309 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.34■■□□□ 1.81
TPCN2-201ENST00000294309 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.33■■□□□ 1.8
TPCN2-201ENST00000294309 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.31■■□□□ 1.8
TPCN2-201ENST00000294309 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.83e-7■■■■■ 46
TPCN2-201ENST00000294309 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.29■■□□□ 1.8
TPCN2-201ENST00000294309 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
TPCN2-201ENST00000294309 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TPCN2-201ENST00000294309 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.26■■□□□ 1.79
TPCN2-201ENST00000294309 CCDC184Q52MB2 194 aa26.26■■□□□ 1.79
TPCN2-201ENST00000294309 FOXD1Q16676 465 aa26.25■■□□□ 1.79
TPCN2-201ENST00000294309 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.25■■□□□ 1.79
TPCN2-201ENST00000294309 ARHGEF11O15085 1522 aa26.24■■□□□ 1.79
TPCN2-201ENST00000294309 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.24■■□□□ 1.79
TPCN2-201ENST00000294309 ARID3CA6NKF2 412 aa26.23■■□□□ 1.79
TPCN2-201ENST00000294309 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
TPCN2-201ENST00000294309 KDM6BO15054 1643 aa26.2■■□□□ 1.79
TPCN2-201ENST00000294309 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
TPCN2-201ENST00000294309 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
TPCN2-201ENST00000294309 MSH5O43196 834 aa26.2■■□□□ 1.78
TPCN2-201ENST00000294309 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.18■■□□□ 1.78
TPCN2-201ENST00000294309 HECW1Q76N89 1606 aa26.17■■□□□ 1.78
TPCN2-201ENST00000294309 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.17■■□□□ 1.78
TPCN2-201ENST00000294309 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.16■■□□□ 1.78
TPCN2-201ENST00000294309 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.15■■□□□ 1.78
TPCN2-201ENST00000294309 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
TPCN2-201ENST00000294309 AKNAQ7Z591 1439 aa26.12■■□□□ 1.77
TPCN2-201ENST00000294309 CCDC7Q96M83 1385 aa26.12■■□□□ 1.77
TPCN2-201ENST00000294309 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
TPCN2-201ENST00000294309 MRS2Q9HD23 443 aa26.11■■□□□ 1.77
TPCN2-201ENST00000294309 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
TPCN2-201ENST00000294309 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.1■■□□□ 1.77
TPCN2-201ENST00000294309 NCOA1Q15788 1441 aa26.09■■□□□ 1.77
TPCN2-201ENST00000294309 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.08■■□□□ 1.76
TPCN2-201ENST00000294309 MIA2Q96PC5 1412 aa26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms