RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292408.8

FGFR4-201, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGFR4, Length 3,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-201ENST00000292408 CUX2O14529 1486 aa23.32■■□□□ 1.32
FGFR4-201ENST00000292408 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.29■■□□□ 1.32
FGFR4-201ENST00000292408 IGF1RP08069 1367 aa23.27■■□□□ 1.32
FGFR4-201ENST00000292408 WDR97A6NE52 1622 aa23.27■■□□□ 1.32
FGFR4-201ENST00000292408 MAPKBP1O60336 1514 aa23.27■■□□□ 1.32
FGFR4-201ENST00000292408 NEFLP07196 543 aa23.26■■□□□ 1.31
FGFR4-201ENST00000292408 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
FGFR4-201ENST00000292408 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.25■■□□□ 1.31
FGFR4-201ENST00000292408 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.23■■□□□ 1.31
FGFR4-201ENST00000292408 ANP32CO43423 234 aa23.23■■□□□ 1.31
FGFR4-201ENST00000292408 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.23■■□□□ 1.31
FGFR4-201ENST00000292408 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
FGFR4-201ENST00000292408 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.14■■□□□ 1.29
FGFR4-201ENST00000292408 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.13■■□□□ 1.29
FGFR4-201ENST00000292408 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
FGFR4-201ENST00000292408 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
FGFR4-201ENST00000292408 CFTRP13569 1480 aa23.09■■□□□ 1.29
FGFR4-201ENST00000292408 ARID3CA6NKF2 412 aa23.09■■□□□ 1.29
FGFR4-201ENST00000292408 TIAM1Q13009 1591 aa23.09■■□□□ 1.29
FGFR4-201ENST00000292408 NCAPD3P42695 1498 aa23.09■■□□□ 1.29
FGFR4-201ENST00000292408 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.08■■□□□ 1.29
FGFR4-201ENST00000292408 TONSLQ96HA7 1378 aa23.08■■□□□ 1.28
FGFR4-201ENST00000292408 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.28
FGFR4-201ENST00000292408 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.02■■□□□ 1.28
FGFR4-201ENST00000292408 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.01■■□□□ 1.27
FGFR4-201ENST00000292408 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.97■■□□□ 1.27
FGFR4-201ENST00000292408 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.96■■□□□ 1.27
FGFR4-201ENST00000292408 CCER2I3L3R5 266 aa22.94■■□□□ 1.26
FGFR4-201ENST00000292408 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.94■■□□□ 1.26
FGFR4-201ENST00000292408 FOXD1Q16676 465 aa22.93■■□□□ 1.26
FGFR4-201ENST00000292408 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.93■■□□□ 1.26
FGFR4-201ENST00000292408 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.93■■□□□ 1.26
FGFR4-201ENST00000292408 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
FGFR4-201ENST00000292408 HMGXB3Q12766 1538 aa22.91■■□□□ 1.26
FGFR4-201ENST00000292408 CCDC184Q52MB2 194 aa22.9■■□□□ 1.26
FGFR4-201ENST00000292408 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.88■■□□□ 1.25
FGFR4-201ENST00000292408 PTPRKQ15262 1439 aa22.87■■□□□ 1.25
FGFR4-201ENST00000292408 MSH5O43196 834 aa22.86■■□□□ 1.25
FGFR4-201ENST00000292408 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
FGFR4-201ENST00000292408 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.85■■□□□ 1.25
FGFR4-201ENST00000292408 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.83■■□□□ 1.24
FGFR4-201ENST00000292408 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.82■■□□□ 1.24
FGFR4-201ENST00000292408 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.8■■□□□ 1.24
FGFR4-201ENST00000292408 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.247e-7■■■■■ 37
FGFR4-201ENST00000292408 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.79■■□□□ 1.24
FGFR4-201ENST00000292408 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
FGFR4-201ENST00000292408 MAP3K1Q13233 1512 aa22.77■■□□□ 1.24
FGFR4-201ENST00000292408 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
FGFR4-201ENST00000292408 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.75■■□□□ 1.23
FGFR4-201ENST00000292408 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.75■■□□□ 1.23
FGFR4-201ENST00000292408 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
FGFR4-201ENST00000292408 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.73■■□□□ 1.23
FGFR4-201ENST00000292408 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.72■■□□□ 1.23
FGFR4-201ENST00000292408 NESP48681 1621 aa22.71■■□□□ 1.23
FGFR4-201ENST00000292408 MRS2Q9HD23 443 aa22.7■■□□□ 1.22
FGFR4-201ENST00000292408 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.69■■□□□ 1.22
FGFR4-201ENST00000292408 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.229e-9■■■■■ 34.4
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FGFR4-201ENST00000292408 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
FGFR4-201ENST00000292408 NAIPQ13075 1403 aa22.67■■□□□ 1.22
FGFR4-201ENST00000292408 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.67■■□□□ 1.22
FGFR4-201ENST00000292408 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
FGFR4-201ENST00000292408 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.64■■□□□ 1.21
FGFR4-201ENST00000292408 HFM1A2PYH4 1435 aa22.64■■□□□ 1.21
FGFR4-201ENST00000292408 NCOA2Q15596 1464 aa22.63■■□□□ 1.21
FGFR4-201ENST00000292408 FMN1Q68DA7 1419 aa22.62■■□□□ 1.21
FGFR4-201ENST00000292408 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.62■■□□□ 1.21
FGFR4-201ENST00000292408 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.59■■□□□ 1.21
FGFR4-201ENST00000292408 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.57■■□□□ 1.2
FGFR4-201ENST00000292408 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.57■■□□□ 1.2
FGFR4-201ENST00000292408 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.57■■□□□ 1.2
FGFR4-201ENST00000292408 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
FGFR4-201ENST00000292408 TOPBP1Q92547 1522 aa22.55■■□□□ 1.2
FGFR4-201ENST00000292408 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.23e-6■□□□□ 9
FGFR4-201ENST00000292408 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
FGFR4-201ENST00000292408 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.53■■□□□ 1.2
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
FGFR4-201ENST00000292408 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.52■■□□□ 1.2
FGFR4-201ENST00000292408 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.5■■□□□ 1.19
FGFR4-201ENST00000292408 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
FGFR4-201ENST00000292408 NBR1Q14596 966 aa22.48■■□□□ 1.19
FGFR4-201ENST00000292408 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.47■■□□□ 1.19
FGFR4-201ENST00000292408 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.46■■□□□ 1.19
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
FGFR4-201ENST00000292408 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
FGFR4-201ENST00000292408 CCDC7Q96M83 1385 aa22.45■■□□□ 1.18
FGFR4-201ENST00000292408 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.44■■□□□ 1.18
FGFR4-201ENST00000292408 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.43■■□□□ 1.18
FGFR4-201ENST00000292408 KDM6BO15054 1643 aa22.43■■□□□ 1.18
FGFR4-201ENST00000292408 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.43■■□□□ 1.18
FGFR4-201ENST00000292408 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.43■■□□□ 1.18
FGFR4-201ENST00000292408 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
FGFR4-201ENST00000292408 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.42■■□□□ 1.18
FGFR4-201ENST00000292408 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.41■■□□□ 1.18
FGFR4-201ENST00000292408 PRDM2Q13029 1718 aa22.4■■□□□ 1.18
FGFR4-201ENST00000292408 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.38■■□□□ 1.17
FGFR4-201ENST00000292408 GRIN2BQ13224 1484 aa22.37■■□□□ 1.17
FGFR4-201ENST00000292408 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
FGFR4-201ENST00000292408 AKNAQ7Z591 1439 aa22.37■■□□□ 1.17
FGFR4-201ENST00000292408 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
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