RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291592.5

LRRC3-201, Transcript of leucine rich repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC3, Length 5,869 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3-201ENST00000291592 TSPY4P0CV99 314 aa22.23■■□□□ 1.15
LRRC3-201ENST00000291592 TSPY10P0CW01 314 aa22.23■■□□□ 1.15
LRRC3-201ENST00000291592 KIF27Q86VH2 1401 aa22.2■■□□□ 1.14
LRRC3-201ENST00000291592 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.2■■□□□ 1.14
LRRC3-201ENST00000291592 TMC1Q8TDI8 760 aa22.17■■□□□ 1.14
LRRC3-201ENST00000291592 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRC3-201ENST00000291592 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.15■■□□□ 1.14
LRRC3-201ENST00000291592 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LRRC3-201ENST00000291592 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC3-201ENST00000291592 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
LRRC3-201ENST00000291592 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.09■■□□□ 1.13
LRRC3-201ENST00000291592 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LRRC3-201ENST00000291592 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRC3-201ENST00000291592 MRS2Q9HD23 443 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRC3-201ENST00000291592 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LRRC3-201ENST00000291592 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.04■■□□□ 1.12
LRRC3-201ENST00000291592 KCNH8Q96L42 1107 aa22.02■■□□□ 1.12
LRRC3-201ENST00000291592 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.02■■□□□ 1.12
LRRC3-201ENST00000291592 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.01■■□□□ 1.11
LRRC3-201ENST00000291592 BECN1Q14457 450 aa22.01■■□□□ 1.11
LRRC3-201ENST00000291592 NCLP19338 710 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
LRRC3-201ENST00000291592 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
LRRC3-201ENST00000291592 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
LRRC3-201ENST00000291592 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.99■■□□□ 1.11
LRRC3-201ENST00000291592 MIER1Q8N108 512 aa21.99■■□□□ 1.11
LRRC3-201ENST00000291592 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.99■■□□□ 1.11
LRRC3-201ENST00000291592 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.95■■□□□ 1.1
LRRC3-201ENST00000291592 ERCC6Q03468 1493 aa21.94■■□□□ 1.1
LRRC3-201ENST00000291592 SOGA1O94964 1423 aa21.93■■□□□ 1.1
LRRC3-201ENST00000291592 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
LRRC3-201ENST00000291592 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.91■■□□□ 1.1
LRRC3-201ENST00000291592 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
LRRC3-201ENST00000291592 CUX2O14529 1486 aa21.88■■□□□ 1.09
LRRC3-201ENST00000291592 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC3-201ENST00000291592 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
LRRC3-201ENST00000291592 ABCC8Q09428 1581 aa21.82■■□□□ 1.08
LRRC3-201ENST00000291592 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.81■■□□□ 1.08
LRRC3-201ENST00000291592 SMARCA2P51531 1590 aa21.8■■□□□ 1.08
LRRC3-201ENST00000291592 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
LRRC3-201ENST00000291592 RGL3Q3MIN7 710 aa21.79■■□□□ 1.08
LRRC3-201ENST00000291592 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.78■■□□□ 1.08
LRRC3-201ENST00000291592 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LRRC3-201ENST00000291592 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LRRC3-201ENST00000291592 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
LRRC3-201ENST00000291592 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
LRRC3-201ENST00000291592 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.72■■□□□ 1.07
LRRC3-201ENST00000291592 WIZO95785 1651 aa21.71■■□□□ 1.07
LRRC3-201ENST00000291592 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.7■■□□□ 1.06
LRRC3-201ENST00000291592 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
LRRC3-201ENST00000291592 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.69■■□□□ 1.06
LRRC3-201ENST00000291592 A0A0G2JS52 829 aa21.69■■□□□ 1.06
LRRC3-201ENST00000291592 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
LRRC3-201ENST00000291592 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
LRRC3-201ENST00000291592 CASC1Q6TDU7 716 aa21.67■■□□□ 1.06
LRRC3-201ENST00000291592 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
LRRC3-201ENST00000291592 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.64■■□□□ 1.05
LRRC3-201ENST00000291592 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.64■■□□□ 1.05
LRRC3-201ENST00000291592 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.61■■□□□ 1.05
LRRC3-201ENST00000291592 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
LRRC3-201ENST00000291592 PLCB2Q00722 1185 aa21.6■■□□□ 1.05
LRRC3-201ENST00000291592 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.59■■□□□ 1.05
LRRC3-201ENST00000291592 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.56■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 CDCA8Q53HL2 280 aa21.56■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 CFAP53Q96M91 514 aa21.55■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 C14orf37Q86TY3 774 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 PLEKHG5O94827 1062 aa21.53■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.53■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.52■■□□□ 1.04
LRRC3-201ENST00000291592 RGS3P49796 1198 aa21.5■■□□□ 1.03
LRRC3-201ENST00000291592 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.5■■□□□ 1.03
LRRC3-201ENST00000291592 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC3-201ENST00000291592 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LRRC3-201ENST00000291592 NRDCO43847 1150 aa21.46■■□□□ 1.03
LRRC3-201ENST00000291592 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC3-201ENST00000291592 SMARCA4P51532 1647 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC3-201ENST00000291592 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC3-201ENST00000291592 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC3-201ENST00000291592 FMN1Q68DA7 1419 aa21.42■■□□□ 1.02
LRRC3-201ENST00000291592 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
LRRC3-201ENST00000291592 NEUROD2Q15784 382 aa21.42■■□□□ 1.02
LRRC3-201ENST00000291592 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.42■■□□□ 1.02
LRRC3-201ENST00000291592 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC3-201ENST00000291592 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC3-201ENST00000291592 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
LRRC3-201ENST00000291592 KANK1Q14678 1352 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC3-201ENST00000291592 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC3-201ENST00000291592 FGD1P98174 961 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC3-201ENST00000291592 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LRRC3-201ENST00000291592 POGKQ9P215 609 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC3-201ENST00000291592 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC3-201ENST00000291592 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
LRRC3-201ENST00000291592 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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