RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273062.6

CTDSP1-201, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP1, Length 2,638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-201ENST00000273062 KCNH8Q96L42 1107 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDSP1-201ENST00000273062 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CTDSP1-201ENST00000273062 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CTDSP1-201ENST00000273062 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDSP1-201ENST00000273062 IGF1RP08069 1367 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP1-201ENST00000273062 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CTDSP1-201ENST00000273062 ARAP1Q96P48 1450 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDSP1-201ENST00000273062 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP1-201ENST00000273062 TOPBP1Q92547 1522 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP1-201ENST00000273062 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP1-201ENST00000273062 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CTDSP1-201ENST00000273062 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDSP1-201ENST00000273062 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP1-201ENST00000273062 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP1-201ENST00000273062 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CTDSP1-201ENST00000273062 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CTDSP1-201ENST00000273062 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDSP1-201ENST00000273062 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP1-201ENST00000273062 NEFLP07196 543 aa22.27■■□□□ 1.15
CTDSP1-201ENST00000273062 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDSP1-201ENST00000273062 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP1-201ENST00000273062 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP1-201ENST00000273062 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP1-201ENST00000273062 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDSP1-201ENST00000273062 P3H3Q8IVL6 736 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP1-201ENST00000273062 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP1-201ENST00000273062 NBR1Q14596 966 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP1-201ENST00000273062 IL27Q8NEV9 243 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP1-201ENST00000273062 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTDSP1-201ENST00000273062 WDR97A6NE52 1622 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP1-201ENST00000273062 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP1-201ENST00000273062 TRIM52Q96A61 297 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-201ENST00000273062 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-201ENST00000273062 CUL7Q14999 1698 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-201ENST00000273062 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-201ENST00000273062 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-201ENST00000273062 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-201ENST00000273062 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDSP1-201ENST00000273062 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDSP1-201ENST00000273062 TIAM1Q13009 1591 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP1-201ENST00000273062 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CTDSP1-201ENST00000273062 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTDSP1-201ENST00000273062 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CTDSP1-201ENST00000273062 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDSP1-201ENST00000273062 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDSP1-201ENST00000273062 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22■■□□□ 1.11
CTDSP1-201ENST00000273062 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDSP1-201ENST00000273062 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDSP1-201ENST00000273062 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDSP1-201ENST00000273062 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.16e-12■■■■■ 82.1
CTDSP1-201ENST00000273062 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTDSP1-201ENST00000273062 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDSP1-201ENST00000273062 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CTDSP1-201ENST00000273062 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDSP1-201ENST00000273062 MAP3K1Q13233 1512 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDSP1-201ENST00000273062 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDSP1-201ENST00000273062 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDSP1-201ENST00000273062 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDSP1-201ENST00000273062 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDSP1-201ENST00000273062 PBRM1Q86U86 1689 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP1-201ENST00000273062 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDSP1-201ENST00000273062 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP1-201ENST00000273062 SAMD9Q5K651 1589 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP1-201ENST00000273062 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CTDSP1-201ENST00000273062 FMN1Q68DA7 1419 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP1-201ENST00000273062 ADAMTS12P58397 1594 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP1-201ENST00000273062 WDR62O43379 1518 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP1-201ENST00000273062 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CTDSP1-201ENST00000273062 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP1-201ENST00000273062 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDSP1-201ENST00000273062 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP1-201ENST00000273062 GRIN2BQ13224 1484 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP1-201ENST00000273062 ERCC6Q03468 1493 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDSP1-201ENST00000273062 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDSP1-201ENST00000273062 IFT140Q96RY7 1462 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDSP1-201ENST00000273062 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CTDSP1-201ENST00000273062 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.7■■□□□ 1.06
CTDSP1-201ENST00000273062 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CTDSP1-201ENST00000273062 IQGAP2Q13576 1575 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDSP1-201ENST00000273062 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDSP1-201ENST00000273062 CCER2I3L3R5 266 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDSP1-201ENST00000273062 ARID3CA6NKF2 412 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDSP1-201ENST00000273062 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
CTDSP1-201ENST00000273062 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDSP1-201ENST00000273062 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDSP1-201ENST00000273062 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CTDSP1-201ENST00000273062 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
CTDSP1-201ENST00000273062 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP1-201ENST00000273062 ANP32CO43423 234 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDSP1-201ENST00000273062 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDSP1-201ENST00000273062 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDSP1-201ENST00000273062 MAPKBP1O60336 1514 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDSP1-201ENST00000273062 NCOA2Q15596 1464 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDSP1-201ENST00000273062 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CTDSP1-201ENST00000273062 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDSP1-201ENST00000273062 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDSP1-201ENST00000273062 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CTDSP1-201ENST00000273062 GRIN2AQ12879 1464 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDSP1-201ENST00000273062 PTPRKQ15262 1439 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDSP1-201ENST00000273062 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms