RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272421.10

ANKRD53-201, Transcript of ankyrin repeat domain 53, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD53, Length 2,185 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53-201ENST00000272421 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.9■■■■□ 3.34
ANKRD53-201ENST00000272421 CUL7Q14999 1698 aa35.87■■■■□ 3.33
ANKRD53-201ENST00000272421 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.83■■■■□ 3.33
ANKRD53-201ENST00000272421 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.82■■■■□ 3.33
ANKRD53-201ENST00000272421 WDR97A6NE52 1622 aa35.82■■■■□ 3.32
ANKRD53-201ENST00000272421 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.78■■■■□ 3.32
ANKRD53-201ENST00000272421 MIER1Q8N108 512 aa35.78■■■■□ 3.32
ANKRD53-201ENST00000272421 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.78■■■■□ 3.32
ANKRD53-201ENST00000272421 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.77■■■■□ 3.32
ANKRD53-201ENST00000272421 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
ANKRD53-201ENST00000272421 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
ANKRD53-201ENST00000272421 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.74■■■■□ 3.31
ANKRD53-201ENST00000272421 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
ANKRD53-201ENST00000272421 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.71■■■■□ 3.31
ANKRD53-201ENST00000272421 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.64■■■■□ 3.3
ANKRD53-201ENST00000272421 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.64■■■■□ 3.3
ANKRD53-201ENST00000272421 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.63■■■■□ 3.29
ANKRD53-201ENST00000272421 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.62■■■■□ 3.29
ANKRD53-201ENST00000272421 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.59■■■■□ 3.29
ANKRD53-201ENST00000272421 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.58■■■■□ 3.29
ANKRD53-201ENST00000272421 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.57■■■■□ 3.28
ANKRD53-201ENST00000272421 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.51■■■■□ 3.27
ANKRD53-201ENST00000272421 P3H3Q8IVL6 736 aa35.49■■■■□ 3.27
ANKRD53-201ENST00000272421 ITGAEP38570 1179 aa35.45■■■■□ 3.27
ANKRD53-201ENST00000272421 SAMD9Q5K651 1589 aa35.45■■■■□ 3.27
ANKRD53-201ENST00000272421 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.45■■■■□ 3.27
ANKRD53-201ENST00000272421 FMN1Q68DA7 1419 aa35.45■■■■□ 3.26
ANKRD53-201ENST00000272421 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.44■■■■□ 3.26
ANKRD53-201ENST00000272421 MAPKBP1O60336 1514 aa35.43■■■■□ 3.26
ANKRD53-201ENST00000272421 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.42■■■■□ 3.26
ANKRD53-201ENST00000272421 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
ANKRD53-201ENST00000272421 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.38■■■■□ 3.25
ANKRD53-201ENST00000272421 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
ANKRD53-201ENST00000272421 MYT1Q01538 1121 aa35.34■■■■□ 3.25
ANKRD53-201ENST00000272421 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
ANKRD53-201ENST00000272421 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
ANKRD53-201ENST00000272421 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
ANKRD53-201ENST00000272421 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.25■■■■□ 3.23
ANKRD53-201ENST00000272421 GRIN2BQ13224 1484 aa35.22■■■■□ 3.23
ANKRD53-201ENST00000272421 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.21■■■■□ 3.23
ANKRD53-201ENST00000272421 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.19■■■■□ 3.22
ANKRD53-201ENST00000272421 PBRM1Q86U86 1689 aa35.18■■■■□ 3.22
ANKRD53-201ENST00000272421 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.11■■■■□ 3.21
ANKRD53-201ENST00000272421 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.08■■■■□ 3.21
ANKRD53-201ENST00000272421 ADAMTS12P58397 1594 aa35.06■■■■□ 3.2
ANKRD53-201ENST00000272421 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
ANKRD53-201ENST00000272421 NCOA2Q15596 1464 aa35.04■■■■□ 3.2
ANKRD53-201ENST00000272421 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.01■■■■□ 3.2
ANKRD53-201ENST00000272421 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.99■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 IQGAP2Q13576 1575 aa34.99■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 ARHGEF11O15085 1522 aa34.99■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 WDR62O43379 1518 aa34.99■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.98■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.96■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 HFM1A2PYH4 1435 aa34.96■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 HECW1Q76N89 1606 aa34.95■■■■□ 3.18
ANKRD53-201ENST00000272421 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.93■■■■□ 3.18
ANKRD53-201ENST00000272421 PTPRKQ15262 1439 aa34.93■■■■□ 3.18
ANKRD53-201ENST00000272421 IFT140Q96RY7 1462 aa34.92■■■■□ 3.18
ANKRD53-201ENST00000272421 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.92■■■■□ 3.18
ANKRD53-201ENST00000272421 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.91■■■■□ 3.18
ANKRD53-201ENST00000272421 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
ANKRD53-201ENST00000272421 UACAQ9BZF9 1416 aa34.84■■■■□ 3.17
ANKRD53-201ENST00000272421 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
ANKRD53-201ENST00000272421 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
ANKRD53-201ENST00000272421 NAIPQ13075 1403 aa34.81■■■■□ 3.16
ANKRD53-201ENST00000272421 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
ANKRD53-201ENST00000272421 ERCC6Q03468 1493 aa34.75■■■■□ 3.15
ANKRD53-201ENST00000272421 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
ANKRD53-201ENST00000272421 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.71■■■■□ 3.15
ANKRD53-201ENST00000272421 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
ANKRD53-201ENST00000272421 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
ANKRD53-201ENST00000272421 AKNAQ7Z591 1439 aa34.66■■■■□ 3.14
ANKRD53-201ENST00000272421 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.65■■■■□ 3.14
ANKRD53-201ENST00000272421 MIA2Q96PC5 1412 aa34.65■■■■□ 3.14
ANKRD53-201ENST00000272421 KIAA0556O60303 1618 aa34.64■■■■□ 3.14
ANKRD53-201ENST00000272421 DISP1Q96F81 1524 aa34.6■■■■□ 3.13
ANKRD53-201ENST00000272421 TONSLQ96HA7 1378 aa34.59■■■■□ 3.13
ANKRD53-201ENST00000272421 GRIN2AQ12879 1464 aa34.56■■■■□ 3.12
ANKRD53-201ENST00000272421 KCNH8Q96L42 1107 aa34.53■■■■□ 3.12
ANKRD53-201ENST00000272421 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.5■■■■□ 3.11
ANKRD53-201ENST00000272421 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.48■■■■□ 3.11
ANKRD53-201ENST00000272421 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
ANKRD53-201ENST00000272421 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
ANKRD53-201ENST00000272421 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
ANKRD53-201ENST00000272421 KDM6BO15054 1643 aa34.45■■■■□ 3.11
ANKRD53-201ENST00000272421 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.1
ANKRD53-201ENST00000272421 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.42■■■■□ 3.1
ANKRD53-201ENST00000272421 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa34.41■■■■□ 3.1
ANKRD53-201ENST00000272421 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
ANKRD53-201ENST00000272421 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.38■■■■□ 3.09
ANKRD53-201ENST00000272421 SYNJ2O15056 1496 aa34.36■■■■□ 3.09
ANKRD53-201ENST00000272421 ROCK1Q13464 1354 aa34.35■■■■□ 3.09
ANKRD53-201ENST00000272421 DAPK1P53355 1430 aa34.34■■■■□ 3.09
ANKRD53-201ENST00000272421 CEP170Q5SW79 1584 aa34.34■■■■□ 3.09
ANKRD53-201ENST00000272421 ARID3CA6NKF2 412 aa34.31■■■■□ 3.08
ANKRD53-201ENST00000272421 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
ANKRD53-201ENST00000272421 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
ANKRD53-201ENST00000272421 ABCC5O15440 1437 aa34.27■■■■□ 3.08
ANKRD53-201ENST00000272421 CCER2I3L3R5 266 aa34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms