RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272421.10

ANKRD53-201, Transcript of ankyrin repeat domain 53, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD53, Length 2,185 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53-201ENST00000272421 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.9■■■■□ 3.34
ANKRD53-201ENST00000272421 CUL7Q14999 1698 aa35.87■■■■□ 3.33
ANKRD53-201ENST00000272421 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.83■■■■□ 3.33
ANKRD53-201ENST00000272421 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.82■■■■□ 3.33
ANKRD53-201ENST00000272421 WDR97A6NE52 1622 aa35.82■■■■□ 3.32
ANKRD53-201ENST00000272421 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.78■■■■□ 3.32
ANKRD53-201ENST00000272421 MIER1Q8N108 512 aa35.78■■■■□ 3.32
ANKRD53-201ENST00000272421 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.78■■■■□ 3.32
ANKRD53-201ENST00000272421 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.77■■■■□ 3.32
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ANKRD53-201ENST00000272421 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
ANKRD53-201ENST00000272421 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.74■■■■□ 3.31
ANKRD53-201ENST00000272421 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
ANKRD53-201ENST00000272421 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.71■■■■□ 3.31
ANKRD53-201ENST00000272421 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.64■■■■□ 3.3
ANKRD53-201ENST00000272421 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.64■■■■□ 3.3
ANKRD53-201ENST00000272421 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.63■■■■□ 3.29
ANKRD53-201ENST00000272421 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.62■■■■□ 3.29
ANKRD53-201ENST00000272421 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.59■■■■□ 3.29
ANKRD53-201ENST00000272421 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.58■■■■□ 3.29
ANKRD53-201ENST00000272421 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.57■■■■□ 3.28
ANKRD53-201ENST00000272421 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.51■■■■□ 3.27
ANKRD53-201ENST00000272421 P3H3Q8IVL6 736 aa35.49■■■■□ 3.27
ANKRD53-201ENST00000272421 ITGAEP38570 1179 aa35.45■■■■□ 3.27
ANKRD53-201ENST00000272421 SAMD9Q5K651 1589 aa35.45■■■■□ 3.27
ANKRD53-201ENST00000272421 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.45■■■■□ 3.27
ANKRD53-201ENST00000272421 FMN1Q68DA7 1419 aa35.45■■■■□ 3.26
ANKRD53-201ENST00000272421 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.44■■■■□ 3.26
ANKRD53-201ENST00000272421 MAPKBP1O60336 1514 aa35.43■■■■□ 3.26
ANKRD53-201ENST00000272421 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.42■■■■□ 3.26
ANKRD53-201ENST00000272421 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
ANKRD53-201ENST00000272421 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.38■■■■□ 3.25
ANKRD53-201ENST00000272421 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
ANKRD53-201ENST00000272421 MYT1Q01538 1121 aa35.34■■■■□ 3.25
ANKRD53-201ENST00000272421 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
ANKRD53-201ENST00000272421 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
ANKRD53-201ENST00000272421 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
ANKRD53-201ENST00000272421 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.25■■■■□ 3.23
ANKRD53-201ENST00000272421 GRIN2BQ13224 1484 aa35.22■■■■□ 3.23
ANKRD53-201ENST00000272421 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.21■■■■□ 3.23
ANKRD53-201ENST00000272421 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.19■■■■□ 3.22
ANKRD53-201ENST00000272421 PBRM1Q86U86 1689 aa35.18■■■■□ 3.22
ANKRD53-201ENST00000272421 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.11■■■■□ 3.21
ANKRD53-201ENST00000272421 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.08■■■■□ 3.21
ANKRD53-201ENST00000272421 ADAMTS12P58397 1594 aa35.06■■■■□ 3.2
ANKRD53-201ENST00000272421 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
ANKRD53-201ENST00000272421 NCOA2Q15596 1464 aa35.04■■■■□ 3.2
ANKRD53-201ENST00000272421 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.01■■■■□ 3.2
ANKRD53-201ENST00000272421 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.99■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 IQGAP2Q13576 1575 aa34.99■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 ARHGEF11O15085 1522 aa34.99■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 WDR62O43379 1518 aa34.99■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.98■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.96■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 HFM1A2PYH4 1435 aa34.96■■■■□ 3.19
ANKRD53-201ENST00000272421 HECW1Q76N89 1606 aa34.95■■■■□ 3.18
ANKRD53-201ENST00000272421 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.93■■■■□ 3.18
ANKRD53-201ENST00000272421 PTPRKQ15262 1439 aa34.93■■■■□ 3.18
ANKRD53-201ENST00000272421 IFT140Q96RY7 1462 aa34.92■■■■□ 3.18
ANKRD53-201ENST00000272421 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.92■■■■□ 3.18
ANKRD53-201ENST00000272421 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.91■■■■□ 3.18
ANKRD53-201ENST00000272421 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
ANKRD53-201ENST00000272421 UACAQ9BZF9 1416 aa34.84■■■■□ 3.17
ANKRD53-201ENST00000272421 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
ANKRD53-201ENST00000272421 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
ANKRD53-201ENST00000272421 NAIPQ13075 1403 aa34.81■■■■□ 3.16
ANKRD53-201ENST00000272421 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
ANKRD53-201ENST00000272421 ERCC6Q03468 1493 aa34.75■■■■□ 3.15
ANKRD53-201ENST00000272421 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
ANKRD53-201ENST00000272421 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.71■■■■□ 3.15
ANKRD53-201ENST00000272421 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
ANKRD53-201ENST00000272421 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
ANKRD53-201ENST00000272421 AKNAQ7Z591 1439 aa34.66■■■■□ 3.14
ANKRD53-201ENST00000272421 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.65■■■■□ 3.14
ANKRD53-201ENST00000272421 MIA2Q96PC5 1412 aa34.65■■■■□ 3.14
ANKRD53-201ENST00000272421 KIAA0556O60303 1618 aa34.64■■■■□ 3.14
ANKRD53-201ENST00000272421 DISP1Q96F81 1524 aa34.6■■■■□ 3.13
ANKRD53-201ENST00000272421 TONSLQ96HA7 1378 aa34.59■■■■□ 3.13
ANKRD53-201ENST00000272421 GRIN2AQ12879 1464 aa34.56■■■■□ 3.12
ANKRD53-201ENST00000272421 KCNH8Q96L42 1107 aa34.53■■■■□ 3.12
ANKRD53-201ENST00000272421 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.5■■■■□ 3.11
ANKRD53-201ENST00000272421 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.48■■■■□ 3.11
ANKRD53-201ENST00000272421 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
ANKRD53-201ENST00000272421 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
ANKRD53-201ENST00000272421 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
ANKRD53-201ENST00000272421 KDM6BO15054 1643 aa34.45■■■■□ 3.11
ANKRD53-201ENST00000272421 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.1
ANKRD53-201ENST00000272421 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.42■■■■□ 3.1
ANKRD53-201ENST00000272421 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa34.41■■■■□ 3.1
ANKRD53-201ENST00000272421 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
ANKRD53-201ENST00000272421 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.38■■■■□ 3.09
ANKRD53-201ENST00000272421 SYNJ2O15056 1496 aa34.36■■■■□ 3.09
ANKRD53-201ENST00000272421 ROCK1Q13464 1354 aa34.35■■■■□ 3.09
ANKRD53-201ENST00000272421 DAPK1P53355 1430 aa34.34■■■■□ 3.09
ANKRD53-201ENST00000272421 CEP170Q5SW79 1584 aa34.34■■■■□ 3.09
ANKRD53-201ENST00000272421 ARID3CA6NKF2 412 aa34.31■■■■□ 3.08
ANKRD53-201ENST00000272421 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
ANKRD53-201ENST00000272421 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
ANKRD53-201ENST00000272421 ABCC5O15440 1437 aa34.27■■■■□ 3.08
ANKRD53-201ENST00000272421 CCER2I3L3R5 266 aa34.24■■■■□ 3.07
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