RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.63□□□□□ -0.39
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GINS1-201ENST00000262460 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
GINS1-201ENST00000262460 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
GINS1-201ENST00000262460 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa12.58□□□□□ -0.4
GINS1-201ENST00000262460 BCANQ96GW7 911 aa12.57□□□□□ -0.4
GINS1-201ENST00000262460 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
GINS1-201ENST00000262460 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.57□□□□□ -0.4
GINS1-201ENST00000262460 CHIC2Q9UKJ5 165 aa12.55□□□□□ -0.4
GINS1-201ENST00000262460 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
GINS1-201ENST00000262460 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.5□□□□□ -0.41
GINS1-201ENST00000262460 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
GINS1-201ENST00000262460 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa12.49□□□□□ -0.41
GINS1-201ENST00000262460 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
GINS1-201ENST00000262460 TIAM1Q13009 1591 aa12.48□□□□□ -0.41
GINS1-201ENST00000262460 TRIM52Q96A61 297 aa12.48□□□□□ -0.41
GINS1-201ENST00000262460 MAPKBP1O60336 1514 aa12.48□□□□□ -0.41
GINS1-201ENST00000262460 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.48□□□□□ -0.41
GINS1-201ENST00000262460 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
GINS1-201ENST00000262460 FOXD1Q16676 465 aa12.47□□□□□ -0.41
GINS1-201ENST00000262460 WDR97A6NE52 1622 aa12.46□□□□□ -0.41
GINS1-201ENST00000262460 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
GINS1-201ENST00000262460 TOPBP1Q92547 1522 aa12.44□□□□□ -0.42
GINS1-201ENST00000262460 CLSPNQ9HAW4 1339 aa12.43□□□□□ -0.42
GINS1-201ENST00000262460 MTUS2Q5JR59 1369 aa12.42□□□□□ -0.42
GINS1-201ENST00000262460 PTPRKQ15262 1439 aa12.42□□□□□ -0.42
GINS1-201ENST00000262460 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa12.41□□□□□ -0.42
GINS1-201ENST00000262460 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.43
GINS1-201ENST00000262460 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.38□□□□□ -0.43
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GINS1-201ENST00000262460 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.36□□□□□ -0.43
GINS1-201ENST00000262460 FKBP8Q14318 412 aa12.35□□□□□ -0.43
GINS1-201ENST00000262460 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
GINS1-201ENST00000262460 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.34□□□□□ -0.43
GINS1-201ENST00000262460 FBLN2P98095 1184 aa12.34□□□□□ -0.43
GINS1-201ENST00000262460 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.34□□□□□ -0.43
GINS1-201ENST00000262460 TONSLQ96HA7 1378 aa12.33□□□□□ -0.44
GINS1-201ENST00000262460 PRDM2Q13029 1718 aa12.33□□□□□ -0.44
GINS1-201ENST00000262460 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
GINS1-201ENST00000262460 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.32□□□□□ -0.44
GINS1-201ENST00000262460 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.31□□□□□ -0.44
GINS1-201ENST00000262460 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.31□□□□□ -0.44
GINS1-201ENST00000262460 POLR3GLQ9BT43 218 aa12.29□□□□□ -0.44
GINS1-201ENST00000262460 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.29□□□□□ -0.44
GINS1-201ENST00000262460 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.29□□□□□ -0.44
GINS1-201ENST00000262460 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
GINS1-201ENST00000262460 NCOA2Q15596 1464 aa12.28□□□□□ -0.44
GINS1-201ENST00000262460 FYCO1Q9BQS8 1478 aa12.27□□□□□ -0.44
GINS1-201ENST00000262460 ANP32CO43423 234 aa12.27□□□□□ -0.44
GINS1-201ENST00000262460 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.27□□□□□ -0.45
GINS1-201ENST00000262460 CCDC184Q52MB2 194 aa12.27□□□□□ -0.45
GINS1-201ENST00000262460 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
GINS1-201ENST00000262460 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
GINS1-201ENST00000262460 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa12.26□□□□□ -0.45
GINS1-201ENST00000262460 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.25□□□□□ -0.45
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GINS1-201ENST00000262460 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.25□□□□□ -0.45
GINS1-201ENST00000262460 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa12.25□□□□□ -0.45
GINS1-201ENST00000262460 SLC24A1O60721 1099 aa12.24□□□□□ -0.45
GINS1-201ENST00000262460 NAIPQ13075 1403 aa12.24□□□□□ -0.45
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GINS1-201ENST00000262460 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
GINS1-201ENST00000262460 MAP3K1Q13233 1512 aa12.23□□□□□ -0.45
GINS1-201ENST00000262460 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.22□□□□□ -0.45
GINS1-201ENST00000262460 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
GINS1-201ENST00000262460 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
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GINS1-201ENST00000262460 KDM6BO15054 1643 aa12.21□□□□□ -0.46
GINS1-201ENST00000262460 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.2□□□□□ -0.46
GINS1-201ENST00000262460 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.2□□□□□ -0.46
GINS1-201ENST00000262460 WASHC2AQ641Q2 1341 aa12.19□□□□□ -0.46
GINS1-201ENST00000262460 FAM9BQ8IZU0 186 aa12.18□□□□□ -0.46
GINS1-201ENST00000262460 GRIN2BQ13224 1484 aa12.18□□□□□ -0.46
GINS1-201ENST00000262460 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.18□□□□□ -0.46
GINS1-201ENST00000262460 HFM1A2PYH4 1435 aa12.18□□□□□ -0.46
GINS1-201ENST00000262460 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.17□□□□□ -0.46
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GINS1-201ENST00000262460 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
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GINS1-201ENST00000262460 NEFLP07196 543 aa12.12□□□□□ -0.47
GINS1-201ENST00000262460 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
GINS1-201ENST00000262460 SAMD9Q5K651 1589 aa12.11□□□□□ -0.47
GINS1-201ENST00000262460 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
GINS1-201ENST00000262460 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.11□□□□□ -0.47
GINS1-201ENST00000262460 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
GINS1-201ENST00000262460 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP12.1□□□□□ -0.47
GINS1-201ENST00000262460 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
GINS1-201ENST00000262460 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
GINS1-201ENST00000262460 UGGT2Q9NYU1 1516 aa12.08□□□□□ -0.47
GINS1-201ENST00000262460 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
GINS1-201ENST00000262460 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa12.08□□□□□ -0.48
GINS1-201ENST00000262460 KDM5BQ9UGL1 1544 aa12.08□□□□□ -0.48
GINS1-201ENST00000262460 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
GINS1-201ENST00000262460 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.07□□□□□ -0.48
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