RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261980.2

VSX2-201, Transcript of visual system homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX2, Length 2,995 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2-201ENST00000261980 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
VSX2-201ENST00000261980 ANP32CO43423 234 aa23.15■■□□□ 1.3
VSX2-201ENST00000261980 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
VSX2-201ENST00000261980 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.14■■□□□ 1.3
VSX2-201ENST00000261980 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.13■■□□□ 1.29
VSX2-201ENST00000261980 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.08■■□□□ 1.29
VSX2-201ENST00000261980 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
VSX2-201ENST00000261980 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
VSX2-201ENST00000261980 EEA1Q15075 1411 aa23.03■■□□□ 1.28
VSX2-201ENST00000261980 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
VSX2-201ENST00000261980 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.02■■□□□ 1.28
VSX2-201ENST00000261980 IL27Q8NEV9 243 aa23■■□□□ 1.27
VSX2-201ENST00000261980 CUX1P39880 1505 aa23■■□□□ 1.27
VSX2-201ENST00000261980 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX2-201ENST00000261980 TOP2BQ02880 1626 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX2-201ENST00000261980 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX2-201ENST00000261980 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
VSX2-201ENST00000261980 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.93■■□□□ 1.26
VSX2-201ENST00000261980 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
VSX2-201ENST00000261980 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.91■■□□□ 1.26
VSX2-201ENST00000261980 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
VSX2-201ENST00000261980 KIF21BO75037 1637 aa22.9■■□□□ 1.26
VSX2-201ENST00000261980 WDR97A6NE52 1622 aa22.9■■□□□ 1.26
VSX2-201ENST00000261980 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.88■■□□□ 1.25
VSX2-201ENST00000261980 CCER2I3L3R5 266 aa22.86■■□□□ 1.25
VSX2-201ENST00000261980 ERCC6Q03468 1493 aa22.85■■□□□ 1.25
VSX2-201ENST00000261980 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.84■■□□□ 1.25
VSX2-201ENST00000261980 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
VSX2-201ENST00000261980 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
VSX2-201ENST00000261980 PRDM2Q13029 1718 aa22.83■■□□□ 1.25
VSX2-201ENST00000261980 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.83■■□□□ 1.24
VSX2-201ENST00000261980 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX2-201ENST00000261980 CCDC184Q52MB2 194 aa22.79■■□□□ 1.24
VSX2-201ENST00000261980 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.79■■□□□ 1.24
VSX2-201ENST00000261980 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
VSX2-201ENST00000261980 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.75■■□□□ 1.23
VSX2-201ENST00000261980 MAPKBP1O60336 1514 aa22.75■■□□□ 1.23
VSX2-201ENST00000261980 KIF27Q86VH2 1401 aa22.72■■□□□ 1.23
VSX2-201ENST00000261980 CUX2O14529 1486 aa22.71■■□□□ 1.23
VSX2-201ENST00000261980 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.71■■□□□ 1.23
VSX2-201ENST00000261980 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
VSX2-201ENST00000261980 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
VSX2-201ENST00000261980 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX2-201ENST00000261980 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX2-201ENST00000261980 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX2-201ENST00000261980 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VSX2-201ENST00000261980 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
VSX2-201ENST00000261980 TOPBP1Q92547 1522 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX2-201ENST00000261980 ARAP1Q96P48 1450 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX2-201ENST00000261980 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
VSX2-201ENST00000261980 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
VSX2-201ENST00000261980 P3H3Q8IVL6 736 aa22.61■■□□□ 1.21
VSX2-201ENST00000261980 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.6■■□□□ 1.21
VSX2-201ENST00000261980 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.6■■□□□ 1.21
VSX2-201ENST00000261980 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
VSX2-201ENST00000261980 TONSLQ96HA7 1378 aa22.58■■□□□ 1.21
VSX2-201ENST00000261980 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
VSX2-201ENST00000261980 PRXQ9BXM0 1461 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX2-201ENST00000261980 IGF1RP08069 1367 aa22.56■■□□□ 1.2
VSX2-201ENST00000261980 MRS2Q9HD23 443 aa22.55■■□□□ 1.2
VSX2-201ENST00000261980 NEFMP07197 916 aa22.53■■□□□ 1.2
VSX2-201ENST00000261980 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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VSX2-201ENST00000261980 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.5■■□□□ 1.19
VSX2-201ENST00000261980 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.47■■□□□ 1.19
VSX2-201ENST00000261980 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.47■■□□□ 1.19
VSX2-201ENST00000261980 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.46■■□□□ 1.19
VSX2-201ENST00000261980 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.45■■□□□ 1.18
VSX2-201ENST00000261980 AKNAQ7Z591 1439 aa22.44■■□□□ 1.18
VSX2-201ENST00000261980 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
VSX2-201ENST00000261980 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.42■■□□□ 1.18
VSX2-201ENST00000261980 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.41■■□□□ 1.18
VSX2-201ENST00000261980 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX2-201ENST00000261980 FBLN2P98095 1184 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX2-201ENST00000261980 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
VSX2-201ENST00000261980 SKAP1Q86WV1 359 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX2-201ENST00000261980 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX2-201ENST00000261980 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
VSX2-201ENST00000261980 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
VSX2-201ENST00000261980 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.32■■□□□ 1.16
VSX2-201ENST00000261980 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
VSX2-201ENST00000261980 SLC4A3P48751 1232 aa22.31■■□□□ 1.16
VSX2-201ENST00000261980 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.31■■□□□ 1.16
VSX2-201ENST00000261980 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.28■■□□□ 1.16
VSX2-201ENST00000261980 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.28■■□□□ 1.16
VSX2-201ENST00000261980 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
VSX2-201ENST00000261980 FOXD1Q16676 465 aa22.26■■□□□ 1.15
VSX2-201ENST00000261980 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.23■■□□□ 1.15
VSX2-201ENST00000261980 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
VSX2-201ENST00000261980 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
VSX2-201ENST00000261980 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.19■■□□□ 1.14
VSX2-201ENST00000261980 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.17■■□□□ 1.14
VSX2-201ENST00000261980 WDR62O43379 1518 aa22.16■■□□□ 1.14
VSX2-201ENST00000261980 PDE4AP27815 886 aa22.16■■□□□ 1.14
VSX2-201ENST00000261980 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.16■■□□□ 1.14
VSX2-201ENST00000261980 NUDCQ9Y266 331 aa22.14■■□□□ 1.13
VSX2-201ENST00000261980 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
VSX2-201ENST00000261980 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.12■■□□□ 1.13
VSX2-201ENST00000261980 GSE1Q14687 1217 aa22.11■■□□□ 1.13
VSX2-201ENST00000261980 CUL7Q14999 1698 aa22.1■■□□□ 1.13
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