RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258530.7

APPL2-201, Transcript of adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APPL2, Length 3,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2-201ENST00000258530 NCAPD3P42695 1498 aa29.52■■■□□ 2.32
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APPL2-201ENST00000258530 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.47■■■□□ 2.31
APPL2-201ENST00000258530 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.46■■■□□ 2.31
APPL2-201ENST00000258530 MAPKBP1O60336 1514 aa29.4■■■□□ 2.3
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APPL2-201ENST00000258530 ARID3CA6NKF2 412 aa29.28■■■□□ 2.28
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APPL2-201ENST00000258530 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.24■■■□□ 2.27
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APPL2-201ENST00000258530 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.91■■■□□ 2.22
APPL2-201ENST00000258530 CCER2I3L3R5 266 aa28.9■■■□□ 2.22
APPL2-201ENST00000258530 BCL11AQ9H165 835 aa28.9■■■□□ 2.22
APPL2-201ENST00000258530 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
APPL2-201ENST00000258530 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.87■■■□□ 2.21
APPL2-201ENST00000258530 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.86■■■□□ 2.21
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APPL2-201ENST00000258530 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.2
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APPL2-201ENST00000258530 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.8■■■□□ 2.2
APPL2-201ENST00000258530 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
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APPL2-201ENST00000258530 FMN1Q68DA7 1419 aa28.79■■■□□ 2.2
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APPL2-201ENST00000258530 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.77■■■□□ 2.2
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APPL2-201ENST00000258530 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.66■■■□□ 2.18
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APPL2-201ENST00000258530 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.63■■■□□ 2.17
APPL2-201ENST00000258530 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.63■■■□□ 2.17
APPL2-201ENST00000258530 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.62■■■□□ 2.17
APPL2-201ENST00000258530 MRS2Q9HD23 443 aa28.61■■■□□ 2.17
APPL2-201ENST00000258530 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.61■■■□□ 2.17
APPL2-201ENST00000258530 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.61■■■□□ 2.17
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APPL2-201ENST00000258530 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.54■■■□□ 2.16
APPL2-201ENST00000258530 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
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APPL2-201ENST00000258530 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
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APPL2-201ENST00000258530 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
APPL2-201ENST00000258530 KDM6BO15054 1643 aa28.4■■■□□ 2.14
APPL2-201ENST00000258530 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.4■■■□□ 2.14
APPL2-201ENST00000258530 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.38■■■□□ 2.13
APPL2-201ENST00000258530 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
APPL2-201ENST00000258530 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
APPL2-201ENST00000258530 CCDC7Q96M83 1385 aa28.34■■■□□ 2.13
APPL2-201ENST00000258530 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.33■■■□□ 2.13
APPL2-201ENST00000258530 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.32■■■□□ 2.12
APPL2-201ENST00000258530 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.32■■■□□ 2.12
APPL2-201ENST00000258530 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.31■■■□□ 2.12
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