RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249923.7

COPB1-201, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPB1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1-201ENST00000249923 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
COPB1-201ENST00000249923 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.94□□□□□ -0.02
COPB1-201ENST00000249923 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.94□□□□□ -0.02
COPB1-201ENST00000249923 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.94□□□□□ -0.02
COPB1-201ENST00000249923 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.93□□□□□ -0.02
COPB1-201ENST00000249923 TOPBP1Q92547 1522 aa14.93□□□□□ -0.02
COPB1-201ENST00000249923 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.92□□□□□ -0.02
COPB1-201ENST00000249923 ITGAEP38570 1179 aa14.9□□□□□ -0.02
COPB1-201ENST00000249923 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.9□□□□□ -0.02
COPB1-201ENST00000249923 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.88□□□□□ -0.03
COPB1-201ENST00000249923 WDR97A6NE52 1622 aa14.88□□□□□ -0.03
COPB1-201ENST00000249923 P3H3Q8IVL6 736 aa14.87□□□□□ -0.03
COPB1-201ENST00000249923 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
COPB1-201ENST00000249923 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.84□□□□□ -0.03
COPB1-201ENST00000249923 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.84□□□□□ -0.03
COPB1-201ENST00000249923 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.83□□□□□ -0.04
COPB1-201ENST00000249923 CUL7Q14999 1698 aa14.82□□□□□ -0.04
COPB1-201ENST00000249923 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.81□□□□□ -0.04
COPB1-201ENST00000249923 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.8□□□□□ -0.04
COPB1-201ENST00000249923 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.8□□□□□ -0.04
COPB1-201ENST00000249923 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.79□□□□□ -0.04
COPB1-201ENST00000249923 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.79□□□□□ -0.04
COPB1-201ENST00000249923 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.79□□□□□ -0.04
COPB1-201ENST00000249923 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.78□□□□□ -0.04
COPB1-201ENST00000249923 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.76□□□□□ -0.05
COPB1-201ENST00000249923 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.056e-7■■■■□ 26.6
COPB1-201ENST00000249923 SAMD9Q5K651 1589 aa14.75□□□□□ -0.05
COPB1-201ENST00000249923 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
COPB1-201ENST00000249923 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
COPB1-201ENST00000249923 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.73□□□□□ -0.05
COPB1-201ENST00000249923 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.73□□□□□ -0.05
COPB1-201ENST00000249923 PTPRKQ15262 1439 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB1-201ENST00000249923 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COPB1-201ENST00000249923 KCNH8Q96L42 1107 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-201ENST00000249923 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
COPB1-201ENST00000249923 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-201ENST00000249923 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-201ENST00000249923 GRIN2BQ13224 1484 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-201ENST00000249923 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-201ENST00000249923 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.063e-9■■□□□ 11.4
COPB1-201ENST00000249923 FMN1Q68DA7 1419 aa14.66□□□□□ -0.06
COPB1-201ENST00000249923 MYT1Q01538 1121 aa14.63□□□□□ -0.07
COPB1-201ENST00000249923 BCANQ96GW7 911 aa14.62□□□□□ -0.07
COPB1-201ENST00000249923 NCOA2Q15596 1464 aa14.61□□□□□ -0.07
COPB1-201ENST00000249923 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.61□□□□□ -0.07
COPB1-201ENST00000249923 ARHGEF11O15085 1522 aa14.6□□□□□ -0.07
COPB1-201ENST00000249923 PBRM1Q86U86 1689 aa14.59□□□□□ -0.07
COPB1-201ENST00000249923 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.59□□□□□ -0.07
COPB1-201ENST00000249923 HFM1A2PYH4 1435 aa14.59□□□□□ -0.07
COPB1-201ENST00000249923 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.59□□□□□ -0.07
COPB1-201ENST00000249923 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.58□□□□□ -0.07
COPB1-201ENST00000249923 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.58□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 NAIPQ13075 1403 aa14.57□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.57□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.57□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.55□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 KDM6BO15054 1643 aa14.54□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 ADAMTS12P58397 1594 aa14.53□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 UACAQ9BZF9 1416 aa14.53□□□□□ -0.08
COPB1-201ENST00000249923 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
COPB1-201ENST00000249923 IQGAP2Q13576 1575 aa14.5□□□□□ -0.09
COPB1-201ENST00000249923 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.49□□□□□ -0.09
COPB1-201ENST00000249923 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
COPB1-201ENST00000249923 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
COPB1-201ENST00000249923 WDR62O43379 1518 aa14.48□□□□□ -0.09
COPB1-201ENST00000249923 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
COPB1-201ENST00000249923 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.47□□□□□ -0.09
COPB1-201ENST00000249923 HECW1Q76N89 1606 aa14.47□□□□□ -0.09
COPB1-201ENST00000249923 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.43□□□□□ -0.1
COPB1-201ENST00000249923 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.42□□□□□ -0.1
COPB1-201ENST00000249923 ARID3CA6NKF2 412 aa14.42□□□□□ -0.1
COPB1-201ENST00000249923 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.42□□□□□ -0.1
COPB1-201ENST00000249923 TONSLQ96HA7 1378 aa14.42□□□□□ -0.1
COPB1-201ENST00000249923 DISP1Q96F81 1524 aa14.41□□□□□ -0.1
COPB1-201ENST00000249923 KIAA0556O60303 1618 aa14.38□□□□□ -0.11
COPB1-201ENST00000249923 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
COPB1-201ENST00000249923 AKNAQ7Z591 1439 aa14.37□□□□□ -0.11
COPB1-201ENST00000249923 MIA2Q96PC5 1412 aa14.35□□□□□ -0.11
COPB1-201ENST00000249923 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
COPB1-201ENST00000249923 FOXD1Q16676 465 aa14.34□□□□□ -0.11
COPB1-201ENST00000249923 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 IFT140Q96RY7 1462 aa14.33□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.32□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 DAPK1P53355 1430 aa14.31□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 GRIN2AQ12879 1464 aa14.31□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 ABCC5O15440 1437 aa14.31□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.31□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 CCER2I3L3R5 266 aa14.31□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 TRIM52Q96A61 297 aa14.31□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.3□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.29□□□□□ -0.12
COPB1-201ENST00000249923 CEP170Q5SW79 1584 aa14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms