RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246662.8

KRT9-201, Transcript of keratin 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRT9, Length 2,290 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9-201ENST00000246662 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
KRT9-201ENST00000246662 TIAM1Q13009 1591 aa28.03■■■□□ 2.08
KRT9-201ENST00000246662 MAP3K1Q13233 1512 aa28.02■■■□□ 2.08
KRT9-201ENST00000246662 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.01■■■□□ 2.07
KRT9-201ENST00000246662 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
KRT9-201ENST00000246662 ITGAEP38570 1179 aa27.97■■■□□ 2.07
KRT9-201ENST00000246662 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.93■■■□□ 2.06
KRT9-201ENST00000246662 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.91■■■□□ 2.06
KRT9-201ENST00000246662 MAPKBP1O60336 1514 aa27.9■■■□□ 2.06
KRT9-201ENST00000246662 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.9■■■□□ 2.06
KRT9-201ENST00000246662 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.89■■■□□ 2.06
KRT9-201ENST00000246662 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.86■■■□□ 2.05
KRT9-201ENST00000246662 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.85■■■□□ 2.05
KRT9-201ENST00000246662 WDR97A6NE52 1622 aa27.83■■■□□ 2.05
KRT9-201ENST00000246662 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.83■■■□□ 2.04
KRT9-201ENST00000246662 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.81■■■□□ 2.04
KRT9-201ENST00000246662 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
KRT9-201ENST00000246662 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.81■■■□□ 2.04
KRT9-201ENST00000246662 WDR62O43379 1518 aa27.74■■■□□ 2.03
KRT9-201ENST00000246662 ERCC6Q03468 1493 aa27.73■■■□□ 2.03
KRT9-201ENST00000246662 P3H3Q8IVL6 736 aa27.72■■■□□ 2.03
KRT9-201ENST00000246662 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
KRT9-201ENST00000246662 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
KRT9-201ENST00000246662 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.69■■■□□ 2.02
KRT9-201ENST00000246662 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.69■■■□□ 2.02
KRT9-201ENST00000246662 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.66■■■□□ 2.02
KRT9-201ENST00000246662 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.65■■■□□ 2.02
KRT9-201ENST00000246662 CUL7Q14999 1698 aa27.64■■■□□ 2.02
KRT9-201ENST00000246662 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
KRT9-201ENST00000246662 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.61■■■□□ 2.01
KRT9-201ENST00000246662 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.61■■■□□ 2.01
KRT9-201ENST00000246662 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
KRT9-201ENST00000246662 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.6■■■□□ 2.01
KRT9-201ENST00000246662 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.59■■■□□ 2.01
KRT9-201ENST00000246662 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
KRT9-201ENST00000246662 IFT140Q96RY7 1462 aa27.57■■■□□ 2
KRT9-201ENST00000246662 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
KRT9-201ENST00000246662 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.56■■■□□ 2
KRT9-201ENST00000246662 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.55■■■□□ 2
KRT9-201ENST00000246662 KCNH8Q96L42 1107 aa27.53■■■□□ 2
KRT9-201ENST00000246662 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.48■■□□□ 1.99
KRT9-201ENST00000246662 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.48■■□□□ 1.99
KRT9-201ENST00000246662 PBRM1Q86U86 1689 aa27.47■■□□□ 1.99
KRT9-201ENST00000246662 FMN1Q68DA7 1419 aa27.46■■□□□ 1.99
KRT9-201ENST00000246662 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.45■■□□□ 1.99
KRT9-201ENST00000246662 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
KRT9-201ENST00000246662 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
KRT9-201ENST00000246662 MYT1Q01538 1121 aa27.39■■□□□ 1.98
KRT9-201ENST00000246662 GRIN2BQ13224 1484 aa27.38■■□□□ 1.97
KRT9-201ENST00000246662 SAMD9Q5K651 1589 aa27.38■■□□□ 1.97
KRT9-201ENST00000246662 PTPRKQ15262 1439 aa27.35■■□□□ 1.97
KRT9-201ENST00000246662 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.35■■□□□ 1.97
KRT9-201ENST00000246662 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.35■■□□□ 1.97
KRT9-201ENST00000246662 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
KRT9-201ENST00000246662 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.34■■□□□ 1.97
KRT9-201ENST00000246662 ADAMTS12P58397 1594 aa27.33■■□□□ 1.96
KRT9-201ENST00000246662 HFM1A2PYH4 1435 aa27.32■■□□□ 1.96
KRT9-201ENST00000246662 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
KRT9-201ENST00000246662 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.29■■□□□ 1.96
KRT9-201ENST00000246662 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
KRT9-201ENST00000246662 UACAQ9BZF9 1416 aa27.28■■□□□ 1.96
KRT9-201ENST00000246662 NCOA2Q15596 1464 aa27.27■■□□□ 1.96
KRT9-201ENST00000246662 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.25■■□□□ 1.95
KRT9-201ENST00000246662 TONSLQ96HA7 1378 aa27.24■■□□□ 1.95
KRT9-201ENST00000246662 NAIPQ13075 1403 aa27.23■■□□□ 1.95
KRT9-201ENST00000246662 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
KRT9-201ENST00000246662 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.2■■□□□ 1.94
KRT9-201ENST00000246662 CCER2I3L3R5 266 aa27.18■■□□□ 1.94
KRT9-201ENST00000246662 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.16■■□□□ 1.94
KRT9-201ENST00000246662 ARHGEF11O15085 1522 aa27.15■■□□□ 1.94
KRT9-201ENST00000246662 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.15■■□□□ 1.94
KRT9-201ENST00000246662 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
KRT9-201ENST00000246662 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.14■■□□□ 1.94
KRT9-201ENST00000246662 ANP32CO43423 234 aa27.13■■□□□ 1.93
KRT9-201ENST00000246662 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.12■■□□□ 1.93
KRT9-201ENST00000246662 FKBP8Q14318 412 aa27.05■■□□□ 1.92
KRT9-201ENST00000246662 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
KRT9-201ENST00000246662 GRIN2AQ12879 1464 aa27.04■■□□□ 1.92
KRT9-201ENST00000246662 BCANQ96GW7 911 aa27.04■■□□□ 1.92
KRT9-201ENST00000246662 IQGAP2Q13576 1575 aa27.03■■□□□ 1.92
KRT9-201ENST00000246662 SYNJ2O15056 1496 aa27.03■■□□□ 1.92
KRT9-201ENST00000246662 TRIM52Q96A61 297 aa27.02■■□□□ 1.92
KRT9-201ENST00000246662 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
KRT9-201ENST00000246662 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27■■□□□ 1.91
KRT9-201ENST00000246662 HECW1Q76N89 1606 aa27■■□□□ 1.91
KRT9-201ENST00000246662 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27■■□□□ 1.91
KRT9-201ENST00000246662 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
KRT9-201ENST00000246662 AKNAQ7Z591 1439 aa26.96■■□□□ 1.91
KRT9-201ENST00000246662 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.96■■□□□ 1.91
KRT9-201ENST00000246662 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.94■■□□□ 1.9
KRT9-201ENST00000246662 KDM6BO15054 1643 aa26.94■■□□□ 1.9
KRT9-201ENST00000246662 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
KRT9-201ENST00000246662 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
KRT9-201ENST00000246662 MIA2Q96PC5 1412 aa26.89■■□□□ 1.89
KRT9-201ENST00000246662 NEFLP07196 543 aa26.88■■□□□ 1.89
KRT9-201ENST00000246662 CEP170Q5SW79 1584 aa26.86■■□□□ 1.89
KRT9-201ENST00000246662 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.85■■□□□ 1.89
KRT9-201ENST00000246662 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
KRT9-201ENST00000246662 NUP160Q12769 1436 aa26.84■■□□□ 1.89
KRT9-201ENST00000246662 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms