RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222250.4

ARRDC2-201, Transcript of arrestin domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC2, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC2-201ENST00000222250 TIAM1Q13009 1591 aa28.13■■■□□ 2.09
ARRDC2-201ENST00000222250 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.12■■■□□ 2.09
ARRDC2-201ENST00000222250 P3H3Q8IVL6 736 aa28.11■■■□□ 2.09
ARRDC2-201ENST00000222250 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
ARRDC2-201ENST00000222250 TOPBP1Q92547 1522 aa28.1■■■□□ 2.09
ARRDC2-201ENST00000222250 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.07■■■□□ 2.08
ARRDC2-201ENST00000222250 MAP3K1Q13233 1512 aa28.06■■■□□ 2.08
ARRDC2-201ENST00000222250 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.04■■■□□ 2.08
ARRDC2-201ENST00000222250 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.01■■■□□ 2.07
ARRDC2-201ENST00000222250 KCNH8Q96L42 1107 aa28■■■□□ 2.07
ARRDC2-201ENST00000222250 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
ARRDC2-201ENST00000222250 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.99■■■□□ 2.07
ARRDC2-201ENST00000222250 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
ARRDC2-201ENST00000222250 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.98■■■□□ 2.07
ARRDC2-201ENST00000222250 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.98■■■□□ 2.07
ARRDC2-201ENST00000222250 BCANQ96GW7 911 aa27.98■■■□□ 2.07
ARRDC2-201ENST00000222250 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.96■■■□□ 2.07
ARRDC2-201ENST00000222250 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
ARRDC2-201ENST00000222250 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
ARRDC2-201ENST00000222250 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.89■■■□□ 2.06
ARRDC2-201ENST00000222250 CUL7Q14999 1698 aa27.87■■■□□ 2.05
ARRDC2-201ENST00000222250 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.85■■■□□ 2.05
ARRDC2-201ENST00000222250 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.85■■■□□ 2.05
ARRDC2-201ENST00000222250 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.83■■■□□ 2.05
ARRDC2-201ENST00000222250 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.83■■■□□ 2.05
ARRDC2-201ENST00000222250 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
ARRDC2-201ENST00000222250 MAPKBP1O60336 1514 aa27.82■■■□□ 2.04
ARRDC2-201ENST00000222250 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.81■■■□□ 2.04
ARRDC2-201ENST00000222250 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.81■■■□□ 2.04
ARRDC2-201ENST00000222250 FKBP8Q14318 412 aa27.81■■■□□ 2.04
ARRDC2-201ENST00000222250 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.79■■■□□ 2.04
ARRDC2-201ENST00000222250 WDR97A6NE52 1622 aa27.77■■■□□ 2.04
ARRDC2-201ENST00000222250 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.038e-8■■■■■ 39.5
ARRDC2-201ENST00000222250 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
ARRDC2-201ENST00000222250 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.71■■■□□ 2.03
ARRDC2-201ENST00000222250 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.71■■■□□ 2.03
ARRDC2-201ENST00000222250 FMN1Q68DA7 1419 aa27.7■■■□□ 2.03
ARRDC2-201ENST00000222250 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.7■■■□□ 2.03
ARRDC2-201ENST00000222250 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.68■■■□□ 2.02
ARRDC2-201ENST00000222250 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.65■■■□□ 2.02
ARRDC2-201ENST00000222250 BCL11AQ9H165 835 aa27.63■■■□□ 2.01
ARRDC2-201ENST00000222250 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.6■■■□□ 2.01
ARRDC2-201ENST00000222250 NEFLP07196 543 aa27.6■■■□□ 2.01
ARRDC2-201ENST00000222250 SAMD9Q5K651 1589 aa27.59■■■□□ 2.01
ARRDC2-201ENST00000222250 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.59■■■□□ 2.01
ARRDC2-201ENST00000222250 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.59■■■□□ 2.01
ARRDC2-201ENST00000222250 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
ARRDC2-201ENST00000222250 TRIM52Q96A61 297 aa27.56■■■□□ 2
ARRDC2-201ENST00000222250 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
ARRDC2-201ENST00000222250 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
ARRDC2-201ENST00000222250 GRIN2BQ13224 1484 aa27.51■■□□□ 1.99
ARRDC2-201ENST00000222250 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
ARRDC2-201ENST00000222250 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.5■■□□□ 1.99
ARRDC2-201ENST00000222250 PTPRKQ15262 1439 aa27.47■■□□□ 1.99
ARRDC2-201ENST00000222250 NCOA2Q15596 1464 aa27.46■■□□□ 1.99
ARRDC2-201ENST00000222250 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
ARRDC2-201ENST00000222250 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.42■■□□□ 1.98
ARRDC2-201ENST00000222250 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.41■■□□□ 1.98
ARRDC2-201ENST00000222250 ANP32CO43423 234 aa27.4■■□□□ 1.98
ARRDC2-201ENST00000222250 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
ARRDC2-201ENST00000222250 HFM1A2PYH4 1435 aa27.38■■□□□ 1.97
ARRDC2-201ENST00000222250 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.38■■□□□ 1.97
ARRDC2-201ENST00000222250 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.37■■□□□ 1.97
ARRDC2-201ENST00000222250 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.35■■□□□ 1.97
ARRDC2-201ENST00000222250 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
ARRDC2-201ENST00000222250 PBRM1Q86U86 1689 aa27.34■■□□□ 1.97
ARRDC2-201ENST00000222250 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.34■■□□□ 1.97
ARRDC2-201ENST00000222250 NAIPQ13075 1403 aa27.32■■□□□ 1.96
ARRDC2-201ENST00000222250 CCER2I3L3R5 266 aa27.31■■□□□ 1.96
ARRDC2-201ENST00000222250 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.31■■□□□ 1.96
ARRDC2-201ENST00000222250 UACAQ9BZF9 1416 aa27.31■■□□□ 1.96
ARRDC2-201ENST00000222250 IQGAP2Q13576 1575 aa27.3■■□□□ 1.96
ARRDC2-201ENST00000222250 ADAMTS12P58397 1594 aa27.29■■□□□ 1.96
ARRDC2-201ENST00000222250 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.29■■□□□ 1.96
ARRDC2-201ENST00000222250 ARHGEF11O15085 1522 aa27.27■■□□□ 1.96
ARRDC2-201ENST00000222250 TONSLQ96HA7 1378 aa27.26■■□□□ 1.96
ARRDC2-201ENST00000222250 ARID3CA6NKF2 412 aa27.26■■□□□ 1.95
ARRDC2-201ENST00000222250 HECW1Q76N89 1606 aa27.24■■□□□ 1.95
ARRDC2-201ENST00000222250 MSH5O43196 834 aa27.24■■□□□ 1.95
ARRDC2-201ENST00000222250 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.22■■□□□ 1.95
ARRDC2-201ENST00000222250 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
ARRDC2-201ENST00000222250 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.22■■□□□ 1.95
ARRDC2-201ENST00000222250 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
ARRDC2-201ENST00000222250 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
ARRDC2-201ENST00000222250 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
ARRDC2-201ENST00000222250 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
ARRDC2-201ENST00000222250 WDR62O43379 1518 aa27.15■■□□□ 1.94
ARRDC2-201ENST00000222250 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.13■■□□□ 1.93
ARRDC2-201ENST00000222250 IFT140Q96RY7 1462 aa27.12■■□□□ 1.93
ARRDC2-201ENST00000222250 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
ARRDC2-201ENST00000222250 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.09■■□□□ 1.93
ARRDC2-201ENST00000222250 MIA2Q96PC5 1412 aa27.05■■□□□ 1.92
ARRDC2-201ENST00000222250 KDM6BO15054 1643 aa27.04■■□□□ 1.92
ARRDC2-201ENST00000222250 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.04■■□□□ 1.92
ARRDC2-201ENST00000222250 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.03■■□□□ 1.92
ARRDC2-201ENST00000222250 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
ARRDC2-201ENST00000222250 DISP1Q96F81 1524 aa27.03■■□□□ 1.92
ARRDC2-201ENST00000222250 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.03■■□□□ 1.92
ARRDC2-201ENST00000222250 AKNAQ7Z591 1439 aa27.01■■□□□ 1.91
ARRDC2-201ENST00000222250 KIAA0556O60303 1618 aa27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms