RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
POP4-201ENST00000221770 P3H3Q8IVL6 736 aa23.09■■□□□ 1.29
POP4-201ENST00000221770 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.09■■□□□ 1.29
POP4-201ENST00000221770 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.08■■□□□ 1.29
POP4-201ENST00000221770 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
POP4-201ENST00000221770 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.04■■□□□ 1.28
POP4-201ENST00000221770 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
POP4-201ENST00000221770 ITGAEP38570 1179 aa23.03■■□□□ 1.28
POP4-201ENST00000221770 BCL11AQ9H165 835 aa23.03■■□□□ 1.28
POP4-201ENST00000221770 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.01■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 WDR97A6NE52 1622 aa23■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 NEUROD1Q13562 356 aa22.98■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.272e-8■■■■■ 42.3
POP4-201ENST00000221770 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.97■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.97■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.97■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.97■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.97■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.96■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.96■■□□□ 1.27
POP4-201ENST00000221770 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.94■■□□□ 1.26
POP4-201ENST00000221770 FMN1Q68DA7 1419 aa22.92■■□□□ 1.26
POP4-201ENST00000221770 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.92■■□□□ 1.26
POP4-201ENST00000221770 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.9■■□□□ 1.26
POP4-201ENST00000221770 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
POP4-201ENST00000221770 MIER1Q8N108 512 aa22.9■■□□□ 1.26
POP4-201ENST00000221770 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.89■■□□□ 1.26
POP4-201ENST00000221770 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.85■■□□□ 1.25
POP4-201ENST00000221770 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
POP4-201ENST00000221770 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.8■■□□□ 1.24
POP4-201ENST00000221770 SAMD9Q5K651 1589 aa22.8■■□□□ 1.24
POP4-201ENST00000221770 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
POP4-201ENST00000221770 MAPKBP1O60336 1514 aa22.75■■□□□ 1.23
POP4-201ENST00000221770 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.75■■□□□ 1.23
POP4-201ENST00000221770 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
POP4-201ENST00000221770 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.71■■□□□ 1.23
POP4-201ENST00000221770 GRIN2BQ13224 1484 aa22.71■■□□□ 1.23
POP4-201ENST00000221770 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.7■■□□□ 1.22
POP4-201ENST00000221770 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
POP4-201ENST00000221770 PBRM1Q86U86 1689 aa22.64■■□□□ 1.22
POP4-201ENST00000221770 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.64■■□□□ 1.21
POP4-201ENST00000221770 NCOA2Q15596 1464 aa22.62■■□□□ 1.21
POP4-201ENST00000221770 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.61■■□□□ 1.21
POP4-201ENST00000221770 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.61■■□□□ 1.21
POP4-201ENST00000221770 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.6■■□□□ 1.21
POP4-201ENST00000221770 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.59■■□□□ 1.21
POP4-201ENST00000221770 ADAMTS12P58397 1594 aa22.59■■□□□ 1.21
POP4-201ENST00000221770 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.58■■□□□ 1.21
POP4-201ENST00000221770 IQGAP2Q13576 1575 aa22.58■■□□□ 1.2
POP4-201ENST00000221770 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
POP4-201ENST00000221770 IFT140Q96RY7 1462 aa22.57■■□□□ 1.2
POP4-201ENST00000221770 HFM1A2PYH4 1435 aa22.54■■□□□ 1.2
POP4-201ENST00000221770 PTPRKQ15262 1439 aa22.54■■□□□ 1.2
POP4-201ENST00000221770 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.52■■□□□ 1.2
POP4-201ENST00000221770 HECW1Q76N89 1606 aa22.51■■□□□ 1.19
POP4-201ENST00000221770 ARHGEF11O15085 1522 aa22.51■■□□□ 1.19
POP4-201ENST00000221770 WDR62O43379 1518 aa22.5■■□□□ 1.19
POP4-201ENST00000221770 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.48■■□□□ 1.19
POP4-201ENST00000221770 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
POP4-201ENST00000221770 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
POP4-201ENST00000221770 UACAQ9BZF9 1416 aa22.47■■□□□ 1.19
POP4-201ENST00000221770 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
POP4-201ENST00000221770 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.46■■□□□ 1.19
POP4-201ENST00000221770 NAIPQ13075 1403 aa22.46■■□□□ 1.19
POP4-201ENST00000221770 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.43■■□□□ 1.18
POP4-201ENST00000221770 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
POP4-201ENST00000221770 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.4■■□□□ 1.18
POP4-201ENST00000221770 MIA2Q96PC5 1412 aa22.38■■□□□ 1.17
POP4-201ENST00000221770 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
POP4-201ENST00000221770 TONSLQ96HA7 1378 aa22.37■■□□□ 1.17
POP4-201ENST00000221770 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.35■■□□□ 1.17
POP4-201ENST00000221770 GRIN2AQ12879 1464 aa22.35■■□□□ 1.17
POP4-201ENST00000221770 DISP1Q96F81 1524 aa22.34■■□□□ 1.17
POP4-201ENST00000221770 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.34■■□□□ 1.17
POP4-201ENST00000221770 ERCC6Q03468 1493 aa22.33■■□□□ 1.17
POP4-201ENST00000221770 ARID3CA6NKF2 412 aa22.33■■□□□ 1.17
POP4-201ENST00000221770 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.33■■□□□ 1.17
POP4-201ENST00000221770 KIAA0556O60303 1618 aa22.33■■□□□ 1.16
POP4-201ENST00000221770 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
POP4-201ENST00000221770 AKNAQ7Z591 1439 aa22.32■■□□□ 1.16
POP4-201ENST00000221770 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
POP4-201ENST00000221770 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
POP4-201ENST00000221770 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
POP4-201ENST00000221770 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
POP4-201ENST00000221770 TRIM52Q96A61 297 aa22.25■■□□□ 1.15
POP4-201ENST00000221770 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.25■■□□□ 1.15
POP4-201ENST00000221770 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
POP4-201ENST00000221770 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.23■■□□□ 1.15
POP4-201ENST00000221770 SYNJ2O15056 1496 aa22.22■■□□□ 1.15
POP4-201ENST00000221770 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
POP4-201ENST00000221770 ROCK1Q13464 1354 aa22.19■■□□□ 1.14
POP4-201ENST00000221770 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.18■■□□□ 1.14
POP4-201ENST00000221770 DAPK1P53355 1430 aa22.18■■□□□ 1.14
POP4-201ENST00000221770 FBLN2P98095 1184 aa22.17■■□□□ 1.14
POP4-201ENST00000221770 KCNH8Q96L42 1107 aa22.17■■□□□ 1.14
POP4-201ENST00000221770 CEP170Q5SW79 1584 aa22.16■■□□□ 1.14
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