RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219070.8

MMP2-201, Transcript of matrix metallopeptidase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP2, Length 3,741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP2-201ENST00000219070 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
MMP2-201ENST00000219070 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.46■■□□□ 1.35
MMP2-201ENST00000219070 TRIM52Q96A61 297 aa23.44■■□□□ 1.34
MMP2-201ENST00000219070 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
MMP2-201ENST00000219070 BCL11AQ9H165 835 aa23.4■■□□□ 1.34
MMP2-201ENST00000219070 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.36■■□□□ 1.33
MMP2-201ENST00000219070 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.35■■□□□ 1.33
MMP2-201ENST00000219070 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.35■■□□□ 1.33
MMP2-201ENST00000219070 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.33■■□□□ 1.32
MMP2-201ENST00000219070 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
MMP2-201ENST00000219070 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
MMP2-201ENST00000219070 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.3■■□□□ 1.32
MMP2-201ENST00000219070 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
MMP2-201ENST00000219070 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
MMP2-201ENST00000219070 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.25■■□□□ 1.31
MMP2-201ENST00000219070 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.25■■□□□ 1.31
MMP2-201ENST00000219070 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.24■■□□□ 1.31
MMP2-201ENST00000219070 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.22■■□□□ 1.31
MMP2-201ENST00000219070 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
MMP2-201ENST00000219070 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.21■■□□□ 1.31
MMP2-201ENST00000219070 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.16■■□□□ 1.3
MMP2-201ENST00000219070 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.16■■□□□ 1.3
MMP2-201ENST00000219070 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.14■■□□□ 1.29
MMP2-201ENST00000219070 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.13■■□□□ 1.29
MMP2-201ENST00000219070 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
MMP2-201ENST00000219070 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
MMP2-201ENST00000219070 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
MMP2-201ENST00000219070 KCNH8Q96L42 1107 aa23.1■■□□□ 1.29
MMP2-201ENST00000219070 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.1■■□□□ 1.29
MMP2-201ENST00000219070 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.09■■□□□ 1.29
MMP2-201ENST00000219070 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.06■■□□□ 1.28
MMP2-201ENST00000219070 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.06■■□□□ 1.28
MMP2-201ENST00000219070 FMN1Q68DA7 1419 aa23.05■■□□□ 1.28
MMP2-201ENST00000219070 JPH4Q96JJ6 628 aa23.04■■□□□ 1.28
MMP2-201ENST00000219070 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.02■■□□□ 1.28
MMP2-201ENST00000219070 MIER1Q8N108 512 aa23.02■■□□□ 1.28
MMP2-201ENST00000219070 FOXD1Q16676 465 aa23■■□□□ 1.27
MMP2-201ENST00000219070 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
MMP2-201ENST00000219070 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
MMP2-201ENST00000219070 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.96■■□□□ 1.27
MMP2-201ENST00000219070 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.95■■□□□ 1.26
MMP2-201ENST00000219070 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
MMP2-201ENST00000219070 GRIN2BQ13224 1484 aa22.93■■□□□ 1.26
MMP2-201ENST00000219070 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
MMP2-201ENST00000219070 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
MMP2-201ENST00000219070 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.92■■□□□ 1.26
MMP2-201ENST00000219070 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.9■■□□□ 1.26
MMP2-201ENST00000219070 TONSLQ96HA7 1378 aa22.89■■□□□ 1.26
MMP2-201ENST00000219070 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
MMP2-201ENST00000219070 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
MMP2-201ENST00000219070 PRDM2Q13029 1718 aa22.86■■□□□ 1.25
MMP2-201ENST00000219070 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.83■■□□□ 1.24
MMP2-201ENST00000219070 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
MMP2-201ENST00000219070 TIAM1Q13009 1591 aa22.82■■□□□ 1.24
MMP2-201ENST00000219070 IFT140Q96RY7 1462 aa22.82■■□□□ 1.24
MMP2-201ENST00000219070 TSPY4P0CV99 314 aa22.78■■□□□ 1.24
MMP2-201ENST00000219070 TSPY10P0CW01 314 aa22.78■■□□□ 1.24
MMP2-201ENST00000219070 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
MMP2-201ENST00000219070 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
MMP2-201ENST00000219070 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.74■■□□□ 1.23
MMP2-201ENST00000219070 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.73■■□□□ 1.23
MMP2-201ENST00000219070 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.73■■□□□ 1.23
MMP2-201ENST00000219070 CUL7Q14999 1698 aa22.73■■□□□ 1.23
MMP2-201ENST00000219070 NCOA2Q15596 1464 aa22.72■■□□□ 1.23
MMP2-201ENST00000219070 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.72■■□□□ 1.23
MMP2-201ENST00000219070 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
MMP2-201ENST00000219070 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.66■■□□□ 1.22
MMP2-201ENST00000219070 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
MMP2-201ENST00000219070 IQGAP2Q13576 1575 aa22.64■■□□□ 1.22
MMP2-201ENST00000219070 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
MMP2-201ENST00000219070 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.63■■□□□ 1.21
MMP2-201ENST00000219070 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.62■■□□□ 1.21
MMP2-201ENST00000219070 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.62■■□□□ 1.21
MMP2-201ENST00000219070 RGL3Q3MIN7 710 aa22.62■■□□□ 1.21
MMP2-201ENST00000219070 PTPRGP23470 1445 aa22.62■■□□□ 1.21
MMP2-201ENST00000219070 GRIN2AQ12879 1464 aa22.62■■□□□ 1.21
MMP2-201ENST00000219070 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.6■■□□□ 1.21
MMP2-201ENST00000219070 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.58■■□□□ 1.21
MMP2-201ENST00000219070 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.58■■□□□ 1.21
MMP2-201ENST00000219070 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.57■■□□□ 1.2
MMP2-201ENST00000219070 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
MMP2-201ENST00000219070 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.56■■□□□ 1.2
MMP2-201ENST00000219070 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
MMP2-201ENST00000219070 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
MMP2-201ENST00000219070 ANP32CO43423 234 aa22.55■■□□□ 1.2
MMP2-201ENST00000219070 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.53■■□□□ 1.2
MMP2-201ENST00000219070 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
MMP2-201ENST00000219070 PKD2Q13563 968 aa22.51■■□□□ 1.19
MMP2-201ENST00000219070 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
MMP2-201ENST00000219070 SYNJ2O15056 1496 aa22.5■■□□□ 1.19
MMP2-201ENST00000219070 PTPRKQ15262 1439 aa22.49■■□□□ 1.19
MMP2-201ENST00000219070 ADAMTS12P58397 1594 aa22.48■■□□□ 1.19
MMP2-201ENST00000219070 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.47■■□□□ 1.19
MMP2-201ENST00000219070 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.46■■□□□ 1.19
MMP2-201ENST00000219070 BCANQ96GW7 911 aa22.46■■□□□ 1.19
MMP2-201ENST00000219070 PBRM1Q86U86 1689 aa22.45■■□□□ 1.18
MMP2-201ENST00000219070 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
MMP2-201ENST00000219070 WDR62O43379 1518 aa22.45■■□□□ 1.18
MMP2-201ENST00000219070 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
MMP2-201ENST00000219070 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
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