RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216121.11

NIPSNAP1-201, Transcript of nipsnap homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP1, Length 2,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CUL7Q14999 1698 aa32.54■■■□□ 2.8
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.52■■■□□ 2.8
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.46■■■□□ 2.79
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.45■■■□□ 2.79
NIPSNAP1-201ENST00000216121 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
NIPSNAP1-201ENST00000216121 WDR97A6NE52 1622 aa32.44■■■□□ 2.78
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.4■■■□□ 2.78
NIPSNAP1-201ENST00000216121 P3H3Q8IVL6 736 aa32.36■■■□□ 2.77
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.36■■■□□ 2.77
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.36■■■□□ 2.77
NIPSNAP1-201ENST00000216121 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.36■■■□□ 2.773e-8■■■■■ 30.4
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.36■■■□□ 2.77
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MIER1Q8N108 512 aa32.35■■■□□ 2.77
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ITGAEP38570 1179 aa32.34■■■□□ 2.77
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.32■■■□□ 2.76
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.32■■■□□ 2.76
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.31■■■□□ 2.76
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.31■■■□□ 2.76
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.24■■■□□ 2.75
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.23■■■□□ 2.75
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FMN1Q68DA7 1419 aa32.22■■■□□ 2.75
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa32.2■■■□□ 2.75
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MAPKBP1O60336 1514 aa32.18■■■□□ 2.74
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.16■■■□□ 2.74
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.16■■■□□ 2.741e-7■■■□□ 19.2
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 SAMD9Q5K651 1589 aa32.15■■■□□ 2.74
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.15■■■□□ 2.74
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.14■■■□□ 2.73
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
NIPSNAP1-201ENST00000216121 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.99■■■□□ 2.71
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GRIN2BQ13224 1484 aa31.98■■■□□ 2.71
NIPSNAP1-201ENST00000216121 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.97■■■□□ 2.71
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.96■■■□□ 2.71
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PBRM1Q86U86 1689 aa31.9■■■□□ 2.7
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.87■■■□□ 2.69
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NCOA2Q15596 1464 aa31.85■■■□□ 2.69
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.83■■■□□ 2.69
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.83■■■□□ 2.69
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.82■■■□□ 2.68
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.81■■■□□ 2.68
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ADAMTS12P58397 1594 aa31.79■■■□□ 2.68
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HFM1A2PYH4 1435 aa31.77■■■□□ 2.68
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.77■■■□□ 2.68
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PTPRKQ15262 1439 aa31.77■■■□□ 2.68
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IQGAP2Q13576 1575 aa31.77■■■□□ 2.68
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARHGEF11O15085 1522 aa31.75■■■□□ 2.67
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.74■■■□□ 2.67
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.71■■■□□ 2.67
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HECW1Q76N89 1606 aa31.7■■■□□ 2.67
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.7■■■□□ 2.67
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UACAQ9BZF9 1416 aa31.68■■■□□ 2.66
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NAIPQ13075 1403 aa31.66■■■□□ 2.66
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IFT140Q96RY7 1462 aa31.64■■■□□ 2.66
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
NIPSNAP1-201ENST00000216121 WDR62O43379 1518 aa31.59■■■□□ 2.65
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TONSLQ96HA7 1378 aa31.49■■■□□ 2.63
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MIA2Q96PC5 1412 aa31.49■■■□□ 2.63
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.49■■■□□ 2.63
NIPSNAP1-201ENST00000216121 AKNAQ7Z591 1439 aa31.47■■■□□ 2.63
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.46■■■□□ 2.63
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIAA0556O60303 1618 aa31.43■■■□□ 2.62
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DISP1Q96F81 1524 aa31.42■■■□□ 2.62
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GRIN2AQ12879 1464 aa31.38■■■□□ 2.61
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.38■■■□□ 2.61
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.35■■■□□ 2.61
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KCNH8Q96L42 1107 aa31.32■■■□□ 2.6
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.32■■■□□ 2.6
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.3■■■□□ 2.6
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARID3CA6NKF2 412 aa31.29■■■□□ 2.6
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KDM6BO15054 1643 aa31.28■■■□□ 2.6
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ROCK1Q13464 1354 aa31.23■■■□□ 2.59
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ERCC6Q03468 1493 aa31.22■■■□□ 2.59
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TRIM52Q96A61 297 aa31.22■■■□□ 2.59
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DAPK1P53355 1430 aa31.21■■■□□ 2.59
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.58
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCER2I3L3R5 266 aa31.19■■■□□ 2.58
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SYNJ2O15056 1496 aa31.18■■■□□ 2.58
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.18■■■□□ 2.58
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CEP170Q5SW79 1584 aa31.16■■■□□ 2.58
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ABCC5O15440 1437 aa31.16■■■□□ 2.58
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
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