RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 ARID3CA6NKF2 412 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-201ENST00000075430 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDP1-201ENST00000075430 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDP1-201ENST00000075430 ARAP1Q96P48 1450 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDP1-201ENST00000075430 CUX1P39880 1505 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDP1-201ENST00000075430 NCAPD3P42695 1498 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDP1-201ENST00000075430 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDP1-201ENST00000075430 TOP2BQ02880 1626 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDP1-201ENST00000075430 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-201ENST00000075430 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-201ENST00000075430 MSH5O43196 834 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-201ENST00000075430 PRXQ9BXM0 1461 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDP1-201ENST00000075430 NBR1Q14596 966 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDP1-201ENST00000075430 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDP1-201ENST00000075430 IGF1RP08069 1367 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDP1-201ENST00000075430 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDP1-201ENST00000075430 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CTDP1-201ENST00000075430 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDP1-201ENST00000075430 TONSLQ96HA7 1378 aa23.33■■□□□ 1.32
CTDP1-201ENST00000075430 WDR97A6NE52 1622 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDP1-201ENST00000075430 CFTRP13569 1480 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDP1-201ENST00000075430 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDP1-201ENST00000075430 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDP1-201ENST00000075430 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDP1-201ENST00000075430 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDP1-201ENST00000075430 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDP1-201ENST00000075430 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDP1-201ENST00000075430 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDP1-201ENST00000075430 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC184Q52MB2 194 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDP1-201ENST00000075430 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CTDP1-201ENST00000075430 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDP1-201ENST00000075430 FOXD1Q16676 465 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDP1-201ENST00000075430 HMGXB3Q12766 1538 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDP1-201ENST00000075430 NESP48681 1621 aa23.17■■□□□ 1.3
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CTDP1-201ENST00000075430 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDP1-201ENST00000075430 CCER2I3L3R5 266 aa23.14■■□□□ 1.29
CTDP1-201ENST00000075430 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-201ENST00000075430 MAPKBP1O60336 1514 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-201ENST00000075430 MRS2Q9HD23 443 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-201ENST00000075430 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDP1-201ENST00000075430 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-201ENST00000075430 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CTDP1-201ENST00000075430 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CTDP1-201ENST00000075430 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CTDP1-201ENST00000075430 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CTDP1-201ENST00000075430 FBLN2P98095 1184 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDP1-201ENST00000075430 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23■■□□□ 1.27
CTDP1-201ENST00000075430 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDP1-201ENST00000075430 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CTDP1-201ENST00000075430 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDP1-201ENST00000075430 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-201ENST00000075430 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-201ENST00000075430 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
CTDP1-201ENST00000075430 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDP1-201ENST00000075430 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDP1-201ENST00000075430 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CTDP1-201ENST00000075430 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDP1-201ENST00000075430 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDP1-201ENST00000075430 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-201ENST00000075430 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-201ENST00000075430 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDP1-201ENST00000075430 TIAM1Q13009 1591 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDP1-201ENST00000075430 TOPBP1Q92547 1522 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDP1-201ENST00000075430 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CTDP1-201ENST00000075430 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CTDP1-201ENST00000075430 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDP1-201ENST00000075430 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CTDP1-201ENST00000075430 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CTDP1-201ENST00000075430 FMN1Q68DA7 1419 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-201ENST00000075430 PTPRKQ15262 1439 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDP1-201ENST00000075430 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
CTDP1-201ENST00000075430 AKNAQ7Z591 1439 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 TMC1Q8TDI8 760 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 SKAP1Q86WV1 359 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.64■■□□□ 1.22
CTDP1-201ENST00000075430 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-201ENST00000075430 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CTDP1-201ENST00000075430 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CTDP1-201ENST00000075430 IL27Q8NEV9 243 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-201ENST00000075430 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDP1-201ENST00000075430 UACAQ9BZF9 1416 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDP1-201ENST00000075430 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-201ENST00000075430 NCOA2Q15596 1464 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-201ENST00000075430 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.56■■□□□ 1.2
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