RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDP1-201ENST00000075430 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDP1-201ENST00000075430 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CTDP1-201ENST00000075430 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.66■■■□□ 2.18
CTDP1-201ENST00000075430 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDP1-201ENST00000075430 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CTDP1-201ENST00000075430 HRCP23327 699 aa27.85■■■□□ 2.05
CTDP1-201ENST00000075430 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.6■■■□□ 2.01
CTDP1-201ENST00000075430 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.48■■□□□ 1.99
CTDP1-201ENST00000075430 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.47■■□□□ 1.99
CTDP1-201ENST00000075430 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDP1-201ENST00000075430 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CTDP1-201ENST00000075430 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDP1-201ENST00000075430 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CTDP1-201ENST00000075430 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CTDP1-201ENST00000075430 TRIM41Q8WV44 630 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDP1-201ENST00000075430 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CTDP1-201ENST00000075430 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDP1-201ENST00000075430 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CTDP1-201ENST00000075430 ABCC9O60706 1549 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDP1-201ENST00000075430 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CTDP1-201ENST00000075430 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDP1-201ENST00000075430 SCRIBQ14160 1630 aa26.08■■□□□ 1.76
CTDP1-201ENST00000075430 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CTDP1-201ENST00000075430 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CTDP1-201ENST00000075430 NEUROD1Q13562 356 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDP1-201ENST00000075430 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.83■■□□□ 1.73
CTDP1-201ENST00000075430 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CTDP1-201ENST00000075430 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CTDP1-201ENST00000075430 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
CTDP1-201ENST00000075430 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
CTDP1-201ENST00000075430 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDP1-201ENST00000075430 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
CTDP1-201ENST00000075430 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.68
CTDP1-201ENST00000075430 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDP1-201ENST00000075430 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CTDP1-201ENST00000075430 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CTDP1-201ENST00000075430 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDP1-201ENST00000075430 NACADO15069 1562 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDP1-201ENST00000075430 MIER1Q8N108 512 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CTDP1-201ENST00000075430 WIZO95785 1651 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDP1-201ENST00000075430 APLP2Q06481 763 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDP1-201ENST00000075430 ABCC8Q09428 1581 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDP1-201ENST00000075430 CEP162Q5TB80 1403 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDP1-201ENST00000075430 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDP1-201ENST00000075430 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CTDP1-201ENST00000075430 ITGAEP38570 1179 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDP1-201ENST00000075430 SOGA1O94964 1423 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDP1-201ENST00000075430 BCANQ96GW7 911 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDP1-201ENST00000075430 MYT1Q01538 1121 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDP1-201ENST00000075430 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDP1-201ENST00000075430 SMARCA4P51532 1647 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDP1-201ENST00000075430 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
CTDP1-201ENST00000075430 KCNH8Q96L42 1107 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDP1-201ENST00000075430 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CTDP1-201ENST00000075430 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDP1-201ENST00000075430 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.492e-8■■■■■ 75.2
CTDP1-201ENST00000075430 SMARCA2P51531 1590 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDP1-201ENST00000075430 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDP1-201ENST00000075430 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CTDP1-201ENST00000075430 CLIP1P30622 1438 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDP1-201ENST00000075430 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CTDP1-201ENST00000075430 FKBP8Q14318 412 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDP1-201ENST00000075430 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDP1-201ENST00000075430 GOLGA3Q08378 1498 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDP1-201ENST00000075430 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CTDP1-201ENST00000075430 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CTDP1-201ENST00000075430 TRIM52Q96A61 297 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDP1-201ENST00000075430 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.13■■□□□ 1.45
CTDP1-201ENST00000075430 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDP1-201ENST00000075430 EEA1Q15075 1411 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDP1-201ENST00000075430 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDP1-201ENST00000075430 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CTDP1-201ENST00000075430 P3H3Q8IVL6 736 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDP1-201ENST00000075430 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDP1-201ENST00000075430 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDP1-201ENST00000075430 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDP1-201ENST00000075430 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CTDP1-201ENST00000075430 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDP1-201ENST00000075430 NEFLP07196 543 aa23.97■■□□□ 1.43
CTDP1-201ENST00000075430 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CTDP1-201ENST00000075430 SYNJ1O43426 1573 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDP1-201ENST00000075430 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CTDP1-201ENST00000075430 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CTDP1-201ENST00000075430 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.91■■□□□ 1.42
CTDP1-201ENST00000075430 BCL11AQ9H165 835 aa23.84■■□□□ 1.41
CTDP1-201ENST00000075430 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CTDP1-201ENST00000075430 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDP1-201ENST00000075430 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDP1-201ENST00000075430 ANP32CO43423 234 aa23.67■■□□□ 1.38
CTDP1-201ENST00000075430 KIF27Q86VH2 1401 aa23.64■■□□□ 1.38
CTDP1-201ENST00000075430 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDP1-201ENST00000075430 KIF21BO75037 1637 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDP1-201ENST00000075430 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
CTDP1-201ENST00000075430 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDP1-201ENST00000075430 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDP1-201ENST00000075430 CUX2O14529 1486 aa23.56■■□□□ 1.36
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