RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000166468.1

Ptprk-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene Ptprk, Length 6,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Synj1Q8CHC4 1574 aa19.06■□□□□ 0.64
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa19.05■□□□□ 0.64
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Zbtb4Q5F293 982 aa19.05■□□□□ 0.64
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Clstn2Q9ER65 966 aa19.01■□□□□ 0.63
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Anks4bQ8K3X6 423 aa19.01■□□□□ 0.63
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa18.99■□□□□ 0.63
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Nlrp6Q91WS2 869 aa18.99■□□□□ 0.63
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Arhgap27A2AB59 869 aa18.98■□□□□ 0.63
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Sall2Q9QX96 1004 aa18.97■□□□□ 0.63
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa18.96■□□□□ 0.63
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Cep162Q6ZQ06 1403 aa18.92■□□□□ 0.62
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Gm13695A2AK44 830 aa18.91■□□□□ 0.62
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Bcl11aQ9QYE3 773 aa18.87■□□□□ 0.61
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Csrnp3P59055 597 aa18.81■□□□□ 0.6
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Cux2P70298 1426 aa18.8■□□□□ 0.6
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa18.79■□□□□ 0.6
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa18.79■□□□□ 0.6
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Mia2Q91ZV0 1396 aa18.77■□□□□ 0.6
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Mtus2Q3UHD3 1353 aa18.76■□□□□ 0.59
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Baz1bQ9Z277 1479 aa18.75■□□□□ 0.59
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Plppr3Q7TPB0 716 aa18.74■□□□□ 0.59
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Kif27Q7M6Z4 1394 aa18.71■□□□□ 0.59
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Rgl3Q3UYI5 709 aa18.68■□□□□ 0.58
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Rpap1Q80TE0 1409 aa18.66■□□□□ 0.58
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Polr3glQ8R0C0 218 aa18.63■□□□□ 0.57
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Aebp1Q640N1 1128 aa18.63■□□□□ 0.57
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa18.63■□□□□ 0.57
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Fyco1Q8VDC1 1437 aa18.63■□□□□ 0.57
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
Ptprk-201ENSMUST00000166468 CntlnA2AM05 1397 aa18.61■□□□□ 0.57
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Carmil1Q6EDY6 1374 aa18.59■□□□□ 0.57
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa18.58■□□□□ 0.56
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Arhgap35Q91YM2 1499 aa18.57■□□□□ 0.56
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Mrs2Q5NCE8 434 aa18.56■□□□□ 0.56
Ptprk-201ENSMUST00000166468 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa18.55■□□□□ 0.56
Ptprk-201ENSMUST00000166468 AknaQ80VW7 1404 aa18.54■□□□□ 0.56
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Gm38655A0A286YDK6 273 aa18.52■□□□□ 0.56
Ptprk-201ENSMUST00000166468 P3h3Q8CG70 732 aa18.51■□□□□ 0.55
Ptprk-201ENSMUST00000166468 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Card11Q8CIS0 1159 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Ptprk-201ENSMUST00000166468 IqubQ8CDK3 788 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Calr4Q3TQS0 420 aa18.47■□□□□ 0.55
Ptprk-201ENSMUST00000166468 CatipB9EKE5 520 aa18.46■□□□□ 0.55
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Kdm2aP59997 1161 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Gm20521D3Z5F7 333 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Map4P27546 1125 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Irx3P81067 507 aa18.35■□□□□ 0.53
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Stk24Q99KH8 431 aa18.35■□□□□ 0.53
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Plekhh2Q8C115 1491 aa18.34■□□□□ 0.53
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Shroom4Q1W617 1475 aa18.34■□□□□ 0.53
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Pkd2O35245 966 aa18.33■□□□□ 0.53
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Ccdc27Q3V036 639 aa18.32■□□□□ 0.52
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Cabp1Q9JLK7 227 aa18.3■□□□□ 0.52
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Lmod3E9QA62 571 aa18.3■□□□□ 0.52
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa18.3■□□□□ 0.52
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa18.29■□□□□ 0.52
Ptprk-201ENSMUST00000166468 BicraF8VPZ9 1578 aa18.29■□□□□ 0.52
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Mphosph9A6H5Y1 991 aa18.29■□□□□ 0.52
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Fam71e1A1L3C1 212 aa18.28■□□□□ 0.52
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Ccnb3Q810T2 1396 aa18.28■□□□□ 0.52
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Stag3O70576 1240 aa18.26■□□□□ 0.51
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Cux1P53564 1515 aa18.25■□□□□ 0.51
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Efcab5A0JP43 1406 aa18.25■□□□□ 0.51
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Ofd1Q80Z25 1017 aa18.24■□□□□ 0.51
Ptprk-201ENSMUST00000166468 UacaQ8CGB3 1411 aa18.24■□□□□ 0.51
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Arid3cA6PWV5 409 aa18.23■□□□□ 0.51
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Lemd3Q9WU40 921 aa18.23■□□□□ 0.51
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Trim44Q9QXA7 346 aa18.22■□□□□ 0.51
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Ncoa2Q61026 1462 aa18.21■□□□□ 0.51
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Ptprk-201ENSMUST00000166468 NrkQ9R0G8 1455 aa18.21■□□□□ 0.51
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Frmpd1A2AKB4 1549 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Trak1Q6PD31 939 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Rundc1Q0VDN7 615 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprk-201ENSMUST00000166468 WrnO09053 1401 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Top2bQ64511 1612 aa18.18■□□□□ 0.5
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Fhad1A6PWD2 1420 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Tnnt2P50752 301 aa18.15■□□□□ 0.5
Ptprk-201ENSMUST00000166468 ArxO35085 564 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptprk-201ENSMUST00000166468 Trim26Q99PN3 545 aa18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 161.9 ms