RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000105256.9

Ctdsp2-202, Transcript of Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdsp2, Length 4,817 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Polr3glQ8R0C0 218 aa23.11■■□□□ 1.29
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ccer2J3QPU5 274 aa23.09■■□□□ 1.29
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Chic2Q9D9G3 165 aa23.03■■□□□ 1.28
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa23.01■■□□□ 1.27
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gm13697A2AK42 830 aa22.98■■□□□ 1.27
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Baz1aO88379 1555 aa22.97■■□□□ 1.27
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 BlmO88700 1416 aa22.97■■□□□ 1.27
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Htatsf1Q8BGC0 757 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Atp1b4Q99ME6 356 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Golga3P55937 1487 aa22.89■■□□□ 1.26
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Setd5Q5XJV7 1441 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Vsig10D3YX43 558 aa22.85■■□□□ 1.25
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Trim30dE9PWL0 497 aa22.84■■□□□ 1.25
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 AU015836B2RUM3 263 aa22.83■■□□□ 1.24
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ppm1gQ61074 542 aa22.78■■□□□ 1.24
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Kif15Q6P9L6 1387 aa22.78■■□□□ 1.24
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 P3h3Q8CG70 732 aa22.76■■□□□ 1.23
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ofd1Q80Z25 1017 aa22.73■■□□□ 1.23
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 PtmaP26350 111 aa22.7■■□□□ 1.22
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Kdm5dQ62240 1548 aa22.7■■□□□ 1.22
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Plcb2A3KGF7 1181 aa22.67■■□□□ 1.22
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa22.66■■□□□ 1.22
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Tnnt2P50752 301 aa22.65■■□□□ 1.22
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gm13695A2AK44 830 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Plppr3Q7TPB0 716 aa22.63■■□□□ 1.21
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Supt16hQ920B9 1047 aa22.56■■□□□ 1.2
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Eea1Q8BL66 1411 aa22.54■■□□□ 1.2
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rgl3Q3UYI5 709 aa22.52■■□□□ 1.2
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa22.52■■□□□ 1.2
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Spryd3E9Q9B3 442 aa22.5■■□□□ 1.19
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Clstn2Q9ER65 966 aa22.5■■□□□ 1.19
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Adam1bQ8R534 806 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ccdc18Q640L5 1455 aa22.43■■□□□ 1.18
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Pknox2Q8BG99 474 aa22.43■■□□□ 1.18
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ipo9Q91YE6 1041 aa22.43■■□□□ 1.18
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa22.43■■□□□ 1.18
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Slc4a3P16283 1227 aa22.42■■□□□ 1.18
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Taok2Q6ZQ29 1240 aa22.4■■□□□ 1.18
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Arhgap27A2AB59 869 aa22.39■■□□□ 1.18
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 PrkcshO08795 521 aa22.39■■□□□ 1.18
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ercc6F8VPZ5 1481 aa22.39■■□□□ 1.17
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Dbr1Q923B1 550 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Fgd1P52734 960 aa22.35■■□□□ 1.17
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Dnai1Q8C0M8 701 aa22.35■■□□□ 1.17
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 B4galnt3Q6L8S8 986 aa22.34■■□□□ 1.17
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Trim26Q99PN3 545 aa22.33■■□□□ 1.17
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Apbb1Q9QXJ1 710 aa22.31■■□□□ 1.16
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 MsnP26041 577 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Znf316Q6PGE4 1016 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Erich6bQ9D4S6 220 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Casc1Q6TDU8 730 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Kdm2aP59997 1161 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Map7O88735 730 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Chmp5Q9D7S9 219 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Cep162Q6ZQ06 1403 aa22.19■■□□□ 1.14
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Card11Q8CIS0 1159 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa22.14■■□□□ 1.14
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ddrgk1Q80WW9 315 aa22.14■■□□□ 1.14
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa22.12■■□□□ 1.13
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 EspnQ9ET47 871 aa22.12■■□□□ 1.13
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Mtus2Q3UHD3 1353 aa22.12■■□□□ 1.13
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rwdd1Q9CQK7 243 aa22.11■■□□□ 1.13
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Neurod2Q62414 383 aa22.11■■□□□ 1.13
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Fmn1Q05860 1466 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Sycp2Q9CUU3 1500 aa22.07■■□□□ 1.12
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Calcoco2A2A6M5 331 aa22.06■■□□□ 1.12
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Mia2Q91ZV0 1396 aa22.06■■□□□ 1.12
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Armcx1Q9CX83 456 aa22.05■■□□□ 1.12
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Crybg2B7ZCC2 1516 aa22.05■■□□□ 1.12
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa22.04■■□□□ 1.12
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Aebp1Q640N1 1128 aa22.03■■□□□ 1.12
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 VgfQ0VGU4 617 aa22.03■■□□□ 1.12
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gm20521D3Z5F7 333 aa22.01■■□□□ 1.11
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ipo8Q7TMY7 1010 aa22■■□□□ 1.11
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 CftrP26361 1476 aa22■■□□□ 1.11
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Kif27Q7M6Z4 1394 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.8 ms