Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Calcoco2A2A6M5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Calcoco2A2A6M5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Calcoco2A2A6M5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Calcoco2A2A6M5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Calcoco2A2A6M5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Calcoco2A2A6M5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Calcoco2A2A6M5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Calcoco2A2A6M5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Calcoco2A2A6M5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Calcoco2A2A6M5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Calcoco2A2A6M5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Calcoco2A2A6M5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Calcoco2A2A6M5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Calcoco2A2A6M5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Calcoco2A2A6M5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Calcoco2A2A6M5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Calcoco2A2A6M5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Calcoco2A2A6M5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Calcoco2A2A6M5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Calcoco2A2A6M5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Calcoco2A2A6M5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Calcoco2A2A6M5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Calcoco2A2A6M5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Calcoco2A2A6M5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Calcoco2A2A6M5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Calcoco2A2A6M5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Calcoco2A2A6M5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Calcoco2A2A6M5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Calcoco2A2A6M5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Calcoco2A2A6M5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Calcoco2A2A6M5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Calcoco2A2A6M5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Calcoco2A2A6M5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Calcoco2A2A6M5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Calcoco2A2A6M5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Calcoco2A2A6M5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Calcoco2A2A6M5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Calcoco2A2A6M5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Calcoco2A2A6M5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Calcoco2A2A6M5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Calcoco2A2A6M5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Calcoco2A2A6M5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Calcoco2A2A6M5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Calcoco2A2A6M5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Calcoco2A2A6M5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Calcoco2A2A6M5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Calcoco2A2A6M5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Calcoco2A2A6M5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Calcoco2A2A6M5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Calcoco2A2A6M5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Calcoco2A2A6M5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Calcoco2A2A6M5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Calcoco2A2A6M5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Calcoco2A2A6M5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Calcoco2A2A6M5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Calcoco2A2A6M5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Calcoco2A2A6M5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Calcoco2A2A6M5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Calcoco2A2A6M5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Calcoco2A2A6M5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Calcoco2A2A6M5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Calcoco2A2A6M5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Calcoco2A2A6M5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Calcoco2A2A6M5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Calcoco2A2A6M5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Calcoco2A2A6M5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Calcoco2A2A6M5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Calcoco2A2A6M5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Calcoco2A2A6M5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Calcoco2A2A6M5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Calcoco2A2A6M5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Calcoco2A2A6M5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Calcoco2A2A6M5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Calcoco2A2A6M5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Calcoco2A2A6M5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Calcoco2A2A6M5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Calcoco2A2A6M5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Calcoco2A2A6M5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Calcoco2A2A6M5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Calcoco2A2A6M5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Calcoco2A2A6M5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Calcoco2A2A6M5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Calcoco2A2A6M5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Calcoco2A2A6M5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Calcoco2A2A6M5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Calcoco2A2A6M5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Calcoco2A2A6M5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Calcoco2A2A6M5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Calcoco2A2A6M5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Calcoco2A2A6M5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Calcoco2A2A6M5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Calcoco2A2A6M5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Calcoco2A2A6M5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Calcoco2A2A6M5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Calcoco2A2A6M5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Calcoco2A2A6M5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Calcoco2A2A6M5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms