RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032414.10

Ttll3-201, Transcript of Tubulin monoglycylase TTLL3, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttll3, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Pak3Q61036 559 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Irx3P81067 507 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Ercc6F8VPZ5 1481 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Ccdc27Q3V036 639 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Wdr62Q3U3T8 1523 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa20.62■□□□□ 0.89
Ttll3-201ENSMUST00000032414 4933416C03RikQ3V063 378 aa20.56■□□□□ 0.88
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Npm2Q80W85 207 aa20.56■□□□□ 0.88
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Kif15Q6P9L6 1387 aa20.54■□□□□ 0.88
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Rpap1Q80TE0 1409 aa20.54■□□□□ 0.88
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
Ttll3-201ENSMUST00000032414 NclP09405 707 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Slc4a3P16283 1227 aa20.44■□□□□ 0.86
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Liat1Q810M6 228 aa20.43■□□□□ 0.86
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Ubl4bQ9CQ84 188 aa20.42■□□□□ 0.86
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa20.41■□□□□ 0.86
Ttll3-201ENSMUST00000032414 DaxxO35613 739 aa20.41■□□□□ 0.86
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Ipo4Q8VI75 1082 aa20.41■□□□□ 0.86
Ttll3-201ENSMUST00000032414 P3h3Q8CG70 732 aa20.4■□□□□ 0.86
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Unc13aQ4KUS2 1712 aa20.4■□□□□ 0.86
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Egfem1Q8C088 590 aa20.4■□□□□ 0.86
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Ccer2J3QPU5 274 aa20.39■□□□□ 0.85
Ttll3-201ENSMUST00000032414 TnnQ80Z71 1560 aa20.38■□□□□ 0.85
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Washc2Q6PGL7 1334 aa20.37■□□□□ 0.85
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Lamc3Q9R0B6 1581 aa20.35■□□□□ 0.85
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Cep162Q6ZQ06 1403 aa20.34■□□□□ 0.85
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa20.29■□□□□ 0.84
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Ipo9Q91YE6 1041 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttll3-201ENSMUST00000032414 PtprkP35822 1457 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Cux2P70298 1426 aa20.24■□□□□ 0.83
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Clip1Q922J3 1391 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Camsap1A2AHC3 1581 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Ccdc18Q640L5 1455 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Taok2Q6ZQ29 1240 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Znf692Q3U381 531 aa20.14■□□□□ 0.81
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Iqcf3Q9D498 203 aa20.14■□□□□ 0.81
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Zfp777B9EKF4 885 aa20.13■□□□□ 0.81
Ttll3-201ENSMUST00000032414 ChgaP26339 463 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Kcnn1Q9EQR3 537 aa20.12■□□□□ 0.81
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Fam135aQ6NS59 1506 aa20.11■□□□□ 0.81
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Zbtb4Q5F293 982 aa20.09■□□□□ 0.81
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Arhgap27A2AB59 869 aa20.07■□□□□ 0.8
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Arhgap35Q91YM2 1499 aa20.07■□□□□ 0.8
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Grin2bQ01097 1482 aa20.07■□□□□ 0.8
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Shroom4Q1W617 1475 aa20.06■□□□□ 0.8
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Mrs2Q5NCE8 434 aa20.05■□□□□ 0.8
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Kcnh8P59111 1102 aa20.03■□□□□ 0.8
Ttll3-201ENSMUST00000032414 NrkQ9R0G8 1455 aa20.03■□□□□ 0.8
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
Ttll3-201ENSMUST00000032414 AampJ3QN89 436 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Gm13697A2AK42 830 aa20■□□□□ 0.79
Ttll3-201ENSMUST00000032414 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Baz1bQ9Z277 1479 aa19.96■□□□□ 0.79
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa19.95■□□□□ 0.78
Ttll3-201ENSMUST00000032414 NeflP08551 543 aa19.93■□□□□ 0.78
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Pdcl3Q8BVF2 240 aa19.89■□□□□ 0.77
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Kdm5bQ80Y84 1544 aa19.88■□□□□ 0.77
Ttll3-201ENSMUST00000032414 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Duox2A2AQ99 1517 aa19.88■□□□□ 0.77
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa19.88■□□□□ 0.77
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Setd5Q5XJV7 1441 aa19.87■□□□□ 0.77
Ttll3-201ENSMUST00000032414 NgefQ8CHT1 710 aa19.86■□□□□ 0.77
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa19.86■□□□□ 0.77
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Eea1Q8BL66 1411 aa19.85■□□□□ 0.77
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Efcab5A0JP43 1406 aa19.83■□□□□ 0.76
Ttll3-201ENSMUST00000032414 CanxP35564 591 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Mrc2Q64449 1479 aa19.82■□□□□ 0.76
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Map3k1P53349 1493 aa19.8■□□□□ 0.76
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Arap1Q4LDD4 1452 aa19.8■□□□□ 0.76
Ttll3-201ENSMUST00000032414 DmtnQ9WV69 405 aa19.77■□□□□ 0.76
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Exoc6Q8R313 802 aa19.75■□□□□ 0.75
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Rad54l2Q99NG0 1466 aa19.75■□□□□ 0.75
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Gtf2a1Q99PM3 378 aa19.75■□□□□ 0.75
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Kif21aQ9QXL2 1672 aa19.73■□□□□ 0.75
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Ofd1Q80Z25 1017 aa19.73■□□□□ 0.75
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Samd9lQ69Z37 1561 aa19.72■□□□□ 0.75
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Ube2uB1AUC4 352 aa19.72■□□□□ 0.75
Ttll3-201ENSMUST00000032414 AU015836B2RUM3 263 aa19.71■□□□□ 0.75
Ttll3-201ENSMUST00000032414 UacaQ8CGB3 1411 aa19.7■□□□□ 0.74
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Lmod2Q3UHZ5 550 aa19.7■□□□□ 0.74
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Armcx1Q9CX83 456 aa19.7■□□□□ 0.74
Ttll3-201ENSMUST00000032414 Carmil1Q6EDY6 1374 aa19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.8 ms