Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
4933416C03RikQ3V063 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
4933416C03RikQ3V063 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
4933416C03RikQ3V063 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
4933416C03RikQ3V063 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
4933416C03RikQ3V063 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
4933416C03RikQ3V063 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
4933416C03RikQ3V063 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
4933416C03RikQ3V063 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
4933416C03RikQ3V063 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
4933416C03RikQ3V063 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
4933416C03RikQ3V063 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
4933416C03RikQ3V063 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
4933416C03RikQ3V063 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
4933416C03RikQ3V063 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
4933416C03RikQ3V063 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
4933416C03RikQ3V063 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
4933416C03RikQ3V063 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
4933416C03RikQ3V063 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
4933416C03RikQ3V063 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
4933416C03RikQ3V063 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
4933416C03RikQ3V063 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
4933416C03RikQ3V063 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
4933416C03RikQ3V063 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
4933416C03RikQ3V063 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
4933416C03RikQ3V063 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
4933416C03RikQ3V063 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
4933416C03RikQ3V063 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
4933416C03RikQ3V063 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
4933416C03RikQ3V063 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
4933416C03RikQ3V063 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
4933416C03RikQ3V063 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
4933416C03RikQ3V063 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
4933416C03RikQ3V063 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
4933416C03RikQ3V063 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
4933416C03RikQ3V063 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
4933416C03RikQ3V063 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
4933416C03RikQ3V063 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
4933416C03RikQ3V063 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
4933416C03RikQ3V063 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
4933416C03RikQ3V063 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
4933416C03RikQ3V063 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
4933416C03RikQ3V063 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
4933416C03RikQ3V063 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
4933416C03RikQ3V063 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
4933416C03RikQ3V063 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
4933416C03RikQ3V063 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
4933416C03RikQ3V063 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
4933416C03RikQ3V063 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
4933416C03RikQ3V063 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
4933416C03RikQ3V063 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
4933416C03RikQ3V063 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
4933416C03RikQ3V063 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
4933416C03RikQ3V063 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
4933416C03RikQ3V063 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
4933416C03RikQ3V063 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
4933416C03RikQ3V063 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
4933416C03RikQ3V063 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
4933416C03RikQ3V063 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
4933416C03RikQ3V063 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
4933416C03RikQ3V063 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
4933416C03RikQ3V063 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
4933416C03RikQ3V063 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
4933416C03RikQ3V063 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
4933416C03RikQ3V063 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
4933416C03RikQ3V063 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
4933416C03RikQ3V063 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
4933416C03RikQ3V063 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
4933416C03RikQ3V063 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
4933416C03RikQ3V063 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
4933416C03RikQ3V063 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
4933416C03RikQ3V063 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
4933416C03RikQ3V063 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
4933416C03RikQ3V063 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
4933416C03RikQ3V063 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
4933416C03RikQ3V063 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
4933416C03RikQ3V063 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
4933416C03RikQ3V063 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
4933416C03RikQ3V063 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
4933416C03RikQ3V063 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
4933416C03RikQ3V063 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
4933416C03RikQ3V063 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
4933416C03RikQ3V063 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
4933416C03RikQ3V063 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
4933416C03RikQ3V063 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
4933416C03RikQ3V063 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
4933416C03RikQ3V063 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
4933416C03RikQ3V063 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
4933416C03RikQ3V063 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
4933416C03RikQ3V063 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
4933416C03RikQ3V063 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
4933416C03RikQ3V063 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
4933416C03RikQ3V063 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
4933416C03RikQ3V063 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
4933416C03RikQ3V063 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
4933416C03RikQ3V063 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
4933416C03RikQ3V063 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
4933416C03RikQ3V063 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms