RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027351.12

Ccl20-201, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 1,417 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nkx1-1G3UXB3 402 aa14.24□□□□□ -0.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Unc13aQ4KUS2 1712 aa14.23□□□□□ -0.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa14.19□□□□□ -0.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Col17a1Q07563 1470 aa14.18□□□□□ -0.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 CftrP26361 1476 aa14.08□□□□□ -0.16
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa14.04□□□□□ -0.16
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lrrc43Q3V0L5 667 aa14.03□□□□□ -0.16
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cux2P70298 1426 aa13.99□□□□□ -0.17
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kcnn1Q9EQR3 537 aa13.98□□□□□ -0.17
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Spock2Q9ER58 423 aa13.96□□□□□ -0.18
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prr29B1ARI9 187 aa13.95□□□□□ -0.18
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Synj1Q8CHC4 1574 aa13.94□□□□□ -0.18
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kif21aQ9QXL2 1672 aa13.93□□□□□ -0.18
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MycnP03966 462 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Znf703P0CL69 594 aa13.92□□□□□ -0.18
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Top2bQ64511 1612 aa13.92□□□□□ -0.18
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kif15Q6P9L6 1387 aa13.86□□□□□ -0.19
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Jarid2Q62315 1234 aa13.85□□□□□ -0.19
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa13.84□□□□□ -0.19
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ildr2B5TVM2 661 aa13.77□□□□□ -0.21
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc24a1Q91WD8 1130 aa13.77□□□□□ -0.21
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Plb1Q3TTY0 1478 aa13.77□□□□□ -0.21
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Taok2Q6ZQ29 1240 aa13.76□□□□□ -0.21
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa13.76□□□□□ -0.21
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cep164Q5DU05 1446 aa13.71□□□□□ -0.21
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa13.7□□□□□ -0.22
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa13.68□□□□□ -0.22
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lamc3Q9R0B6 1581 aa13.67□□□□□ -0.22
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prdm16A2A935 1275 aa13.65□□□□□ -0.22
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pitpnm1O35954 1243 aa13.64□□□□□ -0.23
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cadps2Q8BYR5 1297 aa13.64□□□□□ -0.23
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ferd3lQ923Z4 168 aa13.62□□□□□ -0.23
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Il27Q8K3I6 234 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rusc2Q80U22 1514 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sra1Q80VJ2 232 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Adgrl3Q80TS3 1537 aa13.58□□□□□ -0.23
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ift140E9PY46 1464 aa13.57□□□□□ -0.24
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa13.57□□□□□ -0.24
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa13.57□□□□□ -0.24
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pip4p2Q9CZX7 257 aa13.56□□□□□ -0.24
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kank3Q9Z1P7 791 aa13.56□□□□□ -0.24
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Arid3aQ62431 601 aa13.56□□□□□ -0.24
Ccl20-201ENSMUST00000027351 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trim35Q8C006 501 aa13.55□□□□□ -0.24
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Clcn6O35454 870 aa13.53□□□□□ -0.24
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fam117bQ3U3E2 584 aa13.53□□□□□ -0.24
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nyap1Q6PFX7 833 aa13.53□□□□□ -0.24
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Crocc2F6XLV1 1638 aa13.52□□□□□ -0.24
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm156Q58A37 223 aa13.52□□□□□ -0.25
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rtl1Q7M732 1744 aa13.51□□□□□ -0.25
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PtprtQ99M80 1454 aa13.5□□□□□ -0.25
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Skap1Q3UUV5 355 aa13.5□□□□□ -0.25
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PtprkP35822 1457 aa13.5□□□□□ -0.25
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm13697A2AK42 830 aa13.49□□□□□ -0.25
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rsph6aQ8CDR2 708 aa13.49□□□□□ -0.25
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ccdc18Q640L5 1455 aa13.49□□□□□ -0.25
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pde4dQ01063 747 aa13.47□□□□□ -0.25
Ccl20-201ENSMUST00000027351 TimelessQ9R1X4 1197 aa13.47□□□□□ -0.25
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Repin1Q5U4E2 545 aa13.46□□□□□ -0.26
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cngb1E1AZ71 1325 aa13.44□□□□□ -0.26
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cep170Q6A065 1588 aa13.42□□□□□ -0.26
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Chrm1P12657 460 aa13.42□□□□□ -0.26
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Golga3P55937 1487 aa13.4□□□□□ -0.26
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa13.4□□□□□ -0.26
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zeb1Q64318 1117 aa13.39□□□□□ -0.27
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Disp1Q3TDN0 1521 aa13.39□□□□□ -0.27
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa13.39□□□□□ -0.27
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa13.38□□□□□ -0.27
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zbtb7bQ64321 544 aa13.37□□□□□ -0.27
Ccl20-201ENSMUST00000027351 P3h3Q8CG70 732 aa13.37□□□□□ -0.27
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
Ccl20-201ENSMUST00000027351 TnnQ80Z71 1560 aa13.34□□□□□ -0.27
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Camsap1A2AHC3 1581 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fgd6Q69ZL1 1399 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Duox2A2AQ99 1517 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccl20-201ENSMUST00000027351 SnphQ80U23 495 aa13.3□□□□□ -0.28
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pprc1Q6NZN1 1644 aa13.3□□□□□ -0.28
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rgl2Q61193 778 aa13.26□□□□□ -0.29
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Atad2Q8CDM1 1040 aa13.25□□□□□ -0.29
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa13.24□□□□□ -0.29
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fmn1Q05860 1466 aa13.23□□□□□ -0.29
Ccl20-201ENSMUST00000027351 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22 ms