Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.96■■■■■ 5.59
Pde4dQ01063 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Pde4dQ01063 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Pde4dQ01063 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
Pde4dQ01063 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
Pde4dQ01063 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
Pde4dQ01063 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Pde4dQ01063 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Pde4dQ01063 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Pde4dQ01063 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
Pde4dQ01063 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Pde4dQ01063 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Pde4dQ01063 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Pde4dQ01063 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Pde4dQ01063 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Pde4dQ01063 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Pde4dQ01063 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Pde4dQ01063 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Pde4dQ01063 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Pde4dQ01063 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Pde4dQ01063 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Pde4dQ01063 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Pde4dQ01063 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Pde4dQ01063 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Pde4dQ01063 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
Pde4dQ01063 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Pde4dQ01063 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
Pde4dQ01063 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Pde4dQ01063 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Pde4dQ01063 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Pde4dQ01063 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Pde4dQ01063 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Pde4dQ01063 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
Pde4dQ01063 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Pde4dQ01063 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Pde4dQ01063 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Pde4dQ01063 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Pde4dQ01063 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Pde4dQ01063 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Pde4dQ01063 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Pde4dQ01063 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Pde4dQ01063 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Pde4dQ01063 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Pde4dQ01063 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Pde4dQ01063 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Pde4dQ01063 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Pde4dQ01063 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Pde4dQ01063 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Pde4dQ01063 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Pde4dQ01063 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Pde4dQ01063 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Pde4dQ01063 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Pde4dQ01063 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Pde4dQ01063 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Pde4dQ01063 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Pde4dQ01063 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Pde4dQ01063 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Pde4dQ01063 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Pde4dQ01063 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pde4dQ01063 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Pde4dQ01063 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Pde4dQ01063 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pde4dQ01063 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pde4dQ01063 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pde4dQ01063 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pde4dQ01063 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Pde4dQ01063 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Pde4dQ01063 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Pde4dQ01063 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Pde4dQ01063 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pde4dQ01063 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pde4dQ01063 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Pde4dQ01063 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Pde4dQ01063 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pde4dQ01063 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pde4dQ01063 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Pde4dQ01063 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pde4dQ01063 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pde4dQ01063 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pde4dQ01063 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pde4dQ01063 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pde4dQ01063 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pde4dQ01063 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Pde4dQ01063 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pde4dQ01063 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pde4dQ01063 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pde4dQ01063 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pde4dQ01063 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pde4dQ01063 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pde4dQ01063 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Pde4dQ01063 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Pde4dQ01063 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Pde4dQ01063 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Pde4dQ01063 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Pde4dQ01063 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Pde4dQ01063 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pde4dQ01063 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pde4dQ01063 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Pde4dQ01063 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Pde4dQ01063 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms