Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
Skap1Q3UUV5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Skap1Q3UUV5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Skap1Q3UUV5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Skap1Q3UUV5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Skap1Q3UUV5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Skap1Q3UUV5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Skap1Q3UUV5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Skap1Q3UUV5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Skap1Q3UUV5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Skap1Q3UUV5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Skap1Q3UUV5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Skap1Q3UUV5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Skap1Q3UUV5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Skap1Q3UUV5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Skap1Q3UUV5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Skap1Q3UUV5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Skap1Q3UUV5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Skap1Q3UUV5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Skap1Q3UUV5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Skap1Q3UUV5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Skap1Q3UUV5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Skap1Q3UUV5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Skap1Q3UUV5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Skap1Q3UUV5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Skap1Q3UUV5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Skap1Q3UUV5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Skap1Q3UUV5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Skap1Q3UUV5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Skap1Q3UUV5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Skap1Q3UUV5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Skap1Q3UUV5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Skap1Q3UUV5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Skap1Q3UUV5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Skap1Q3UUV5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Skap1Q3UUV5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Skap1Q3UUV5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Skap1Q3UUV5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Skap1Q3UUV5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Skap1Q3UUV5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Skap1Q3UUV5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Skap1Q3UUV5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Skap1Q3UUV5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Skap1Q3UUV5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Skap1Q3UUV5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Skap1Q3UUV5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Skap1Q3UUV5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Skap1Q3UUV5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Skap1Q3UUV5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Skap1Q3UUV5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Skap1Q3UUV5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Skap1Q3UUV5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Skap1Q3UUV5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Skap1Q3UUV5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Skap1Q3UUV5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Skap1Q3UUV5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Skap1Q3UUV5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Skap1Q3UUV5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Skap1Q3UUV5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Skap1Q3UUV5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Skap1Q3UUV5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Skap1Q3UUV5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Skap1Q3UUV5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Skap1Q3UUV5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Skap1Q3UUV5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Skap1Q3UUV5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Skap1Q3UUV5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Skap1Q3UUV5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Skap1Q3UUV5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Skap1Q3UUV5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Skap1Q3UUV5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Skap1Q3UUV5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Skap1Q3UUV5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Skap1Q3UUV5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Skap1Q3UUV5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Skap1Q3UUV5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Skap1Q3UUV5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Skap1Q3UUV5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Skap1Q3UUV5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Skap1Q3UUV5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Skap1Q3UUV5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Skap1Q3UUV5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Skap1Q3UUV5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Skap1Q3UUV5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Skap1Q3UUV5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Skap1Q3UUV5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Skap1Q3UUV5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Skap1Q3UUV5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Skap1Q3UUV5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Skap1Q3UUV5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Skap1Q3UUV5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Skap1Q3UUV5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Skap1Q3UUV5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Skap1Q3UUV5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Skap1Q3UUV5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Skap1Q3UUV5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Skap1Q3UUV5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Skap1Q3UUV5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Skap1Q3UUV5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Skap1Q3UUV5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms