Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX7

Pip4p2, Type 2 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p2Q9CZX7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Pip4p2Q9CZX7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Pip4p2Q9CZX7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pip4p2Q9CZX7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Pip4p2Q9CZX7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Pip4p2Q9CZX7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pip4p2Q9CZX7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Pip4p2Q9CZX7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pip4p2Q9CZX7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pip4p2Q9CZX7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pip4p2Q9CZX7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pip4p2Q9CZX7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Pip4p2Q9CZX7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pip4p2Q9CZX7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pip4p2Q9CZX7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pip4p2Q9CZX7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pip4p2Q9CZX7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Pip4p2Q9CZX7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pip4p2Q9CZX7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Pip4p2Q9CZX7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pip4p2Q9CZX7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pip4p2Q9CZX7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pip4p2Q9CZX7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pip4p2Q9CZX7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pip4p2Q9CZX7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pip4p2Q9CZX7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pip4p2Q9CZX7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pip4p2Q9CZX7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pip4p2Q9CZX7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pip4p2Q9CZX7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Pip4p2Q9CZX7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pip4p2Q9CZX7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pip4p2Q9CZX7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Pip4p2Q9CZX7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Pip4p2Q9CZX7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pip4p2Q9CZX7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pip4p2Q9CZX7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pip4p2Q9CZX7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pip4p2Q9CZX7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pip4p2Q9CZX7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pip4p2Q9CZX7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pip4p2Q9CZX7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pip4p2Q9CZX7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pip4p2Q9CZX7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pip4p2Q9CZX7 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pip4p2Q9CZX7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pip4p2Q9CZX7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pip4p2Q9CZX7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pip4p2Q9CZX7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pip4p2Q9CZX7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pip4p2Q9CZX7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pip4p2Q9CZX7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pip4p2Q9CZX7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pip4p2Q9CZX7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pip4p2Q9CZX7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pip4p2Q9CZX7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pip4p2Q9CZX7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pip4p2Q9CZX7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pip4p2Q9CZX7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pip4p2Q9CZX7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pip4p2Q9CZX7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pip4p2Q9CZX7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pip4p2Q9CZX7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pip4p2Q9CZX7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pip4p2Q9CZX7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pip4p2Q9CZX7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pip4p2Q9CZX7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pip4p2Q9CZX7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pip4p2Q9CZX7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pip4p2Q9CZX7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pip4p2Q9CZX7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pip4p2Q9CZX7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pip4p2Q9CZX7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pip4p2Q9CZX7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pip4p2Q9CZX7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pip4p2Q9CZX7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pip4p2Q9CZX7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pip4p2Q9CZX7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pip4p2Q9CZX7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pip4p2Q9CZX7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pip4p2Q9CZX7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pip4p2Q9CZX7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pip4p2Q9CZX7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pip4p2Q9CZX7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pip4p2Q9CZX7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pip4p2Q9CZX7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pip4p2Q9CZX7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pip4p2Q9CZX7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pip4p2Q9CZX7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pip4p2Q9CZX7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pip4p2Q9CZX7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pip4p2Q9CZX7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pip4p2Q9CZX7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pip4p2Q9CZX7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pip4p2Q9CZX7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pip4p2Q9CZX7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pip4p2Q9CZX7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pip4p2Q9CZX7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pip4p2Q9CZX7 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pip4p2Q9CZX7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms