RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020657.12

Ube2b-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2b, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa31.7■■■□□ 2.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pcf11G3X9Z4 1553 aa31.69■■■□□ 2.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cux1P53564 1515 aa31.67■■■□□ 2.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rpap1Q80TE0 1409 aa31.64■■■□□ 2.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Naip1Q9QWK5 1403 aa31.63■■■□□ 2.65
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fyco1Q8VDC1 1437 aa31.63■■■□□ 2.65
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa31.61■■■□□ 2.65
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pcgf6Q99NA9 353 aa31.6■■■□□ 2.65
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa31.59■■■□□ 2.65
Ube2b-201ENSMUST00000020657 CntlnA2AM05 1397 aa31.58■■■□□ 2.65
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rad54l2Q99NG0 1466 aa31.56■■■□□ 2.64
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Peg3Q3URU2 1571 aa31.54■■■□□ 2.64
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Slx4Q6P1D7 1565 aa31.5■■■□□ 2.63
Ube2b-201ENSMUST00000020657 BlmO88700 1416 aa31.47■■■□□ 2.63
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pla2r1Q62028 1487 aa31.45■■■□□ 2.63
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Plb1Q3TTY0 1478 aa31.42■■■□□ 2.62
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Magi3Q9EQJ9 1476 aa31.42■■■□□ 2.62
Ube2b-201ENSMUST00000020657 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
Ube2b-201ENSMUST00000020657 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa31.39■■■□□ 2.62
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gpatch8A2A6A1 1505 aa31.37■■■□□ 2.61
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Grin2aP35436 1464 aa31.36■■■□□ 2.61
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Disp1Q3TDN0 1521 aa31.34■■■□□ 2.61
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Aebp1Q640N1 1128 aa31.31■■■□□ 2.6
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abca5Q8K448 1642 aa31.3■■■□□ 2.6
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ift140E9PY46 1464 aa31.3■■■□□ 2.6
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kdm5bQ80Y84 1544 aa31.25■■■□□ 2.59
Ube2b-201ENSMUST00000020657 CadpsQ80TJ1 1355 aa31.25■■■□□ 2.59
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Adamts12Q811B3 1600 aa31.25■■■□□ 2.59
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa31.22■■■□□ 2.59
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa31.2■■■□□ 2.58
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
Ube2b-201ENSMUST00000020657 WizO88286 1684 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Soga1E1U8D0 1418 aa31.12■■■□□ 2.57
Ube2b-201ENSMUST00000020657 TonslQ6NZL6 1363 aa31.11■■■□□ 2.57
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Setd1bQ8CFT2 1985 aa31.11■■■□□ 2.57
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa31.11■■■□□ 2.57
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lmod2Q3UHZ5 550 aa31.1■■■□□ 2.57
Ube2b-201ENSMUST00000020657 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa31.03■■■□□ 2.56
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abca16E9PWJ7 1678 aa31.01■■■□□ 2.56
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa31.01■■■□□ 2.55
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kif27Q7M6Z4 1394 aa31■■■□□ 2.55
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa30.99■■■□□ 2.55
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mia2Q91ZV0 1396 aa30.98■■■□□ 2.55
Ube2b-201ENSMUST00000020657 PxdnQ3UQ28 1475 aa30.97■■■□□ 2.55
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fhad1A6PWD2 1420 aa30.94■■■□□ 2.54
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gcc2Q8CHG3 1679 aa30.88■■■□□ 2.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Vps8Q0P5W1 1427 aa30.86■■■□□ 2.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sall2Q9QX96 1004 aa30.86■■■□□ 2.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccer2J3QPU5 274 aa30.84■■■□□ 2.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Naip2Q9QUK4 1447 aa30.84■■■□□ 2.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccnb3Q810T2 1396 aa30.84■■■□□ 2.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 WrnO09053 1401 aa30.8■■■□□ 2.52
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NexmifQ5DTT1 1515 aa30.79■■■□□ 2.52
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abcc2Q8VI47 1543 aa30.79■■■□□ 2.52
Ube2b-201ENSMUST00000020657 BC005561E9Q5E2 1589 aa30.78■■■□□ 2.52
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rusc2Q80U22 1514 aa30.78■■■□□ 2.52
Ube2b-201ENSMUST00000020657 A2mQ6GQT1 1474 aa30.77■■■□□ 2.52
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa30.77■■■□□ 2.52
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Wdr66E9Q743 1299 aa30.75■■■□□ 2.51
Ube2b-201ENSMUST00000020657 ClspnQ80YR7 1315 aa30.74■■■□□ 2.51
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Shroom2A2ALU4 1481 aa30.74■■■□□ 2.51
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa30.73■■■□□ 2.51
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arhgap27A2AB59 869 aa30.69■■■□□ 2.5
Ube2b-201ENSMUST00000020657 UacaQ8CGB3 1411 aa30.69■■■□□ 2.5
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mug1P28665 1476 aa30.68■■■□□ 2.5
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Eid3Q3V124 375 aa30.65■■■□□ 2.5
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Map3k4O08648 1597 aa30.63■■■□□ 2.49
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arhgef11Q68FM7 1552 aa30.6■■■□□ 2.49
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ncoa3O09000 1398 aa30.59■■■□□ 2.49
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ncoa2Q61026 1462 aa30.58■■■□□ 2.49
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rfx7F8VPJ6 1459 aa30.56■■■□□ 2.48
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fhod3Q76LL6 1578 aa30.55■■■□□ 2.48
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa30.53■■■□□ 2.48
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa30.52■■■□□ 2.48
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa30.51■■■□□ 2.47
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa30.48■■■□□ 2.47
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa30.47■■■□□ 2.47
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Plekhh2Q8C115 1491 aa30.44■■■□□ 2.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Magi1Q6RHR9 1471 aa30.43■■■□□ 2.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cul7Q8VE73 1689 aa30.41■■■□□ 2.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fam163aQ8CAA5 168 aa30.41■■■□□ 2.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abcc5Q9R1X5 1436 aa30.4■■■□□ 2.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Chic2Q9D9G3 165 aa30.4■■■□□ 2.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa30.39■■■□□ 2.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Adcy10Q8C0T9 1614 aa30.38■■■□□ 2.45
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa30.38■■■□□ 2.45
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fgd6Q69ZL1 1399 aa30.36■■■□□ 2.45
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mroh2aD3Z750 1679 aa30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.2 ms