RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020657.12

Ube2b-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2b, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NischQ80TM9 1593 aa42.5■■■■■ 4.39
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa42.24■■■■■ 4.35
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abcc9P70170 1546 aa41.32■■■■■ 4.21
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abcc8B2RUS7 1588 aa40.53■■■■■ 4.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rhox8Q6VSS7 320 aa38.54■■■■□ 3.76
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rtl1Q7M732 1744 aa38.12■■■■□ 3.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 ScribQ80U72 1612 aa37.96■■■■□ 3.67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dcaf1Q80TR8 1506 aa37.94■■■■□ 3.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa37.2■■■■□ 3.55
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kdm5dQ62240 1548 aa37.18■■■■□ 3.54
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccdc180J3QNE4 1664 aa37.18■■■■□ 3.54
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NacadQ5SWP3 1504 aa37.05■■■■□ 3.52
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Baz1aO88379 1555 aa36.83■■■■□ 3.49
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Crybg2B7ZCC2 1516 aa36.4■■■■□ 3.42
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sycp2Q9CUU3 1500 aa36.23■■■■□ 3.39
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35.94■■■■□ 3.34
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa35.73■■■■□ 3.31
Ube2b-201ENSMUST00000020657 HrcG5E8J6 738 aa35.41■■■■□ 3.26
Ube2b-201ENSMUST00000020657 BicraF8VPZ9 1578 aa35.39■■■■□ 3.26
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Trim41Q5NCC3 630 aa35.35■■■■□ 3.25
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa34.99■■■■□ 3.19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Synj1Q8CHC4 1574 aa34.7■■■■□ 3.15
Ube2b-201ENSMUST00000020657 CftrP26361 1476 aa34.58■■■■□ 3.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cep164Q5DU05 1446 aa34.55■■■■□ 3.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34.53■■■■□ 3.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Golga3P55937 1487 aa34.48■■■■□ 3.11
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cngb1E1AZ71 1325 aa34.3■■■■□ 3.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Top2bQ64511 1612 aa34.2■■■■□ 3.07
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa34.12■■■■□ 3.05
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa33.99■■■■□ 3.03
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Chic1Q8CBW7 227 aa33.96■■■■□ 3.03
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa33.95■■■■□ 3.02
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa33.75■■■□□ 2.99
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fmn1Q05860 1466 aa33.72■■■□□ 2.99
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Wdr62Q3U3T8 1523 aa33.53■■■□□ 2.96
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gab3Q8BSM5 595 aa33.49■■■□□ 2.95
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Frmpd1A2AKB4 1549 aa33.47■■■□□ 2.95
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ercc6F8VPZ5 1481 aa33.42■■■□□ 2.94
Ube2b-201ENSMUST00000020657 TnnQ80Z71 1560 aa33.35■■■□□ 2.93
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa33.23■■■□□ 2.91
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lamc3Q9R0B6 1581 aa33.16■■■□□ 2.9
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Unc13aQ4KUS2 1712 aa33.09■■■□□ 2.89
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cep162Q6ZQ06 1403 aa32.92■■■□□ 2.86
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kif15Q6P9L6 1387 aa32.91■■■□□ 2.86
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Camsap1A2AHC3 1581 aa32.78■■■□□ 2.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Npm2Q80W85 207 aa32.7■■■□□ 2.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fam135aQ6NS59 1506 aa32.69■■■□□ 2.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccdc18Q640L5 1455 aa32.68■■■□□ 2.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NrkQ9R0G8 1455 aa32.66■■■□□ 2.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Shroom4Q1W617 1475 aa32.57■■■□□ 2.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Grin2bQ01097 1482 aa32.51■■■□□ 2.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 PtprkP35822 1457 aa32.5■■■□□ 2.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arhgap35Q91YM2 1499 aa32.5■■■□□ 2.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Myt1lP97500 1187 aa32.49■■■□□ 2.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Il27Q8K3I6 234 aa32.47■■■□□ 2.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cux2P70298 1426 aa32.46■■■□□ 2.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ubl4bQ9CQ84 188 aa32.45■■■□□ 2.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Map3k1P53349 1493 aa32.44■■■□□ 2.78
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Baz1bQ9Z277 1479 aa32.39■■■□□ 2.78
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Clip1Q922J3 1391 aa32.28■■■□□ 2.76
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa32.21■■■□□ 2.75
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Efcab5A0JP43 1406 aa32.21■■■□□ 2.75
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mier1Q5UAK0 511 aa32.19■■■□□ 2.74
Ube2b-201ENSMUST00000020657 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Eea1Q8BL66 1411 aa32.16■■■□□ 2.74
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NefmP08553 848 aa32.16■■■□□ 2.74
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
Ube2b-201ENSMUST00000020657 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Duox2A2AQ99 1517 aa32.05■■■□□ 2.72
Ube2b-201ENSMUST00000020657 UbtfP25976 765 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zeb1Q64318 1117 aa32.02■■■□□ 2.72
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arap1Q4LDD4 1452 aa32■■■□□ 2.71
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Setd5Q5XJV7 1441 aa31.97■■■□□ 2.71
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Erich3F6QRE9 1637 aa31.97■■■□□ 2.71
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa31.96■■■□□ 2.71
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mrc2Q64449 1479 aa31.95■■■□□ 2.71
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Carmil1Q6EDY6 1374 aa31.92■■■□□ 2.7
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ankrd26Q811D2 1581 aa31.88■■■□□ 2.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 SynmQ70IV5 1561 aa31.84■■■□□ 2.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa31.83■■■□□ 2.69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Samd9lQ69Z37 1561 aa31.82■■■□□ 2.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Crocc2F6XLV1 1638 aa31.81■■■□□ 2.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kif21aQ9QXL2 1672 aa31.79■■■□□ 2.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tiam1Q60610 1591 aa31.78■■■□□ 2.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
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