RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	PLP2	Q12017	286 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SLP1	Q12232	587 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	RMP1	Q12530	201 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	MDM12	Q92328	271 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	CTT1	P06115	562 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	NIP100	P33420	868 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YEL1	P34225	687 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	MCD4	P36051	919 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	BYE1	P36106	594 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	JNM1	P36224	373 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	PNT1	P38969	423 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	PES4	P39684	611 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SIT1	P39980	628 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	FMS1	P50264	508 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	LSB1	P53281	241 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	RTS3	P53289	263 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	DIP5	P53388	608 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	ORC4	P54791	529 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	MFM1	Q02783	413 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	OPY2	Q06810	360 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	TCO89	Q08921	799 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.23	□□□□□ -1.57	not detected
TRS33	YOR115C	RAD1	P06777	1100 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	ERG11	P10614	530 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	CLB1	P24868	471 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	RSC6	P25632	483 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	APL1	P27351	700 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	HXT1	P32465	570 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.23	□□□□□ -1.57	not detected
TRS33	YOR115C	PEX6	P33760	1030 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	MCM7	P38132	845 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YEN1	P40028	759 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	GIP2	P40036	548 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SPO74	P45819	413 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SMC3	P47037	1230 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	TOF1	P53840	1238 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	URH1	Q04179	340 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	FUS2	Q05670	677 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YPR078C	Q06813	372 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YPL277C	Q08989	487 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YOR223W	Q12015	292 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	DAS2	Q12084	232 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	ARP6	Q12509	438 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	TOP3	P13099	656 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	MLS1	P30952	554 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	UBP11	P36026	717 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SHC1	P39000	512 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YAR028W	P39548	234 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	VPS53	P47061	822 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	CTR1	P49573	406 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YGR130C	P53278	816 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	ARK1	P53974	638 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YMR102C	Q03177	834 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	GIC2	Q06648	383 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	OMS1	Q06668	471 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	MLH2	Q07980	695 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	NUR1	Q12066	484 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	MED1	Q12321	566 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	CDC8	P00572	216 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	MEF1	P25039	761 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	CNS1	P33313	385 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	SAF1	P38352	637 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	YGR045C	P53229	120 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	BTN2	P53286	410 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	TFB2	Q02939	513 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	CRF1	Q04930	467 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	BRE4	Q07660	1125 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	CBP1	P07252	654 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	SRD1	P09007	221 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	NFU1	P32860	256 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	ERC1	P38767	581 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	LCB2	P40970	561 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	YJR079W	P47126	109 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	KAP114	P53067	1004 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	SEC5	P89102	971 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	VTC3	Q02725	835 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	VTI1	Q04338	217 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRS33	YOR115C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58

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