RNA–Protein interactions for RNA: YKL108W

SLD2, Transcript of Single-stranded DNA origin-binding and annealing protein, yeast

Gene SLD2, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLD2	YKL108W	TRI1	Q05024	226 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	COX17	Q12287	69 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	SCM3	Q12334	223 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	PCD1	Q12524	340 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	SEM1	O94742	89 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	PCK1	P10963	549 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	CHS2	P14180	963 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	ARG1	P22768	420 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	CWH43	P25618	953 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	PEX5	P35056	612 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	YKL050C	P35736	922 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	NPR3	P38742	1146 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	YLF2	P38746	405 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	MSS4	P38994	779 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	YPL062W	Q02781	134 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	SED4	P25365	1065 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	MAC1	P35192	417 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	ESL2	P36168	1195 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	YBR225W	P38321	900 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	GID8	P40208	455 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	KHA1	P40309	873 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	MND2	P40577	368 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	IRC6	P43615	237 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	PRY1	P47032	299 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	PEF1	P53238	335 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	NSE5	Q03718	556 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	SIZ1	Q04195	904 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	MFB1	Q04922	465 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
SLD2	YKL108W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	CAB2	P40506	365 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	PRM2	P40534	656 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	TAH11	P47112	604 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	ARG5,6	Q01217	863 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	MEH1	Q02205	184 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	TIM50	Q02776	476 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	HPF1	Q05164	967 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	GPB1	Q08886	897 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	HIF1	Q12373	385 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	GAL10	P04397	699 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	TPK1	P06244	397 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	CBF2	P32504	956 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	MTC7	P32633	139 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	REC102	Q02721	264 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	CRD1	Q07560	283 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	ICL2	Q12031	575 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	UPC2	Q12151	913 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	SKM1	Q12469	655 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	HMG2	P12684	1045 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	PRE4	P30657	266 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	ATG19	P35193	415 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	MTH1	P35198	433 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	BYE1	P36106	594 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	YHR112C	P38716	378 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	NPR2	P39923	615 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	GCV2	P49095	1034 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	BSC5	P53755	489 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	ASI2	P53895	289 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	YPL071C	Q02864	156 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	PKH1	Q03407	766 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	PPN1	Q04119	674 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	TPO1	Q07824	586 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	SWM1	Q12379	170 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	SMC6	Q12749	1114 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLD2	YKL108W	YLR415C	O13578	112 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	MET17	P06106	444 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	STE14	P32584	239 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	YJR061W	P40355	935 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	GSM1	P42950	618 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	BIT61	P47041	543 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	ATG21	Q02887	496 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	RCF1	Q03713	159 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	ECM3	Q99252	613 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	ARG3	P05150	338 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	RED1	P14291	827 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	CKA1	P15790	372 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	SGF29	P25554	259 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SLD2	YKL108W	APT2	P36973	181 aa		5.7	□□□□□ -1.5

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