RNA–Protein interactions for RNA: YBR293W

VBA2, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA2, Length 1,425 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA2	YBR293W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SAS3	P34218	831 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YHL012W	P38709	493 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	VFA1	P40080	203 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RIC1	P40395	1056 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YNL320W	P42840	284 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SWP82	P43554	623 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SNX4	P47057	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MPS2	P53159	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	IPI3	P53877	555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	UME1	Q03010	460 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	CAB1	Q04430	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	NNT1	Q05874	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	DCS1	Q06151	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RSC2	Q06488	889 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SIL1	Q08199	421 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MNL2	Q12205	849 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SEY1	Q99287	776 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	APC1	P53886	1748 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MRP7	P12687	371 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YAK1	P14680	807 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PEX5	P35056	612 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YKL063C	P35725	167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	TPO5	P36029	618 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MNN2	P38069	597 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	APD1	P38281	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	VAC8	P39968	578 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	IML2	P47031	731 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YJL055W	P47044	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	GNP1	P48813	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SPC105	P53148	917 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	TPO2	P53283	614 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ECM11	Q04110	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	DYN3	Q04949	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	FMP42	Q04991	504 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MCM21	Q06675	368 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	EMP46	Q12396	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RAD4	P14736	754 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PEP3	P27801	918 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MLS1	P30952	554 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YME1	P32795	747 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MSC7	P38694	644 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	HXT5	P38695	592 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SKN7	P38889	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SWD1	P39706	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SER3	P40054	469 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	FTR1	P40088	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MET12	P46151	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MDV1	P47025	714 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YGR237C	P50089	785 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	TOF1	P53840	1238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	VPS64	Q03944	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	COX20	Q04935	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ECI1	Q05871	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ARR2	Q06597	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	MDM36	Q06820	579 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	VHS3	Q08438	674 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	APC5	Q08683	685 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	DAS2	Q12084	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	POL3	P15436	1097 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA2	YBR293W	PPG1	P32838	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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