RNA–Protein interactions for RNA: YHR009C

TDA3, Transcript of Putative oxidoreductase involved in late endosome to Golgi transport, yeast

Gene TDA3, Length 1,572 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TDA3	YHR009C	CYC7	P00045	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	MSH1	P25846	959 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	DGR2	P32330	852 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	SAW1	P39735	261 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	STL1	P39932	569 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	ERR3	P42222	437 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	PFA3	P42836	336 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	YPS7	Q06325	596 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	ARP7	Q12406	477 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	SED4	P25365	1065 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	DUN1	P39009	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	GID8	P40208	455 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	ASI2	P53895	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	PLB2	Q03674	706 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
TDA3	YHR009C	RPN12	P32496	274 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	SDS22	P36047	338 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	YEL076C	P39971	216 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	VHR1	P40522	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	MET12	P46151	657 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	TAF1	P46677	1066 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	EXG2	P52911	562 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	STP4	Q07351	490 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	SSP2	Q08646	371 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	PSF3	Q12146	194 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	BEM3	P32873	1128 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	TGL1	P34163	548 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	MSS4	P38994	779 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	GCV2	P49095	1034 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	YBP2	P53169	641 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	VHS3	Q08438	674 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	ADH4	P10127	382 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	IME1	P21190	360 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	IML2	P47031	731 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	GTR1	Q00582	310 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	ROT1	Q03691	256 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	BLS1	Q06071	122 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	TRP3	P00937	484 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	HIS5	P07172	385 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	PET127	P32606	800 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	CHA4	P43634	648 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	MAD3	P47074	515 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	NCS6	P53088	359 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	SGD1	Q06132	899 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	RRI2	Q12348	645 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	SWM1	Q12379	170 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	YLR415C	O13578	112 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	MCM10	P32354	571 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	APM3	P38153	483 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	SWD1	P39706	426 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	SPC72	P39723	622 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	MAD2	P40958	196 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	UBA2	P52488	636 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	PKH1	Q03407	766 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	HMI1	Q12039	706 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	NGG1	P32494	702 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	LRG1	P35688	1017 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	PSY4	P38193	441 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	YBR259W	P38338	688 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	SIC1	P38634	284 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	LAM1	P38851	1228 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	IMA5	P40884	581 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	BUD8	P41698	603 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	REC102	Q02721	264 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	DIN7	Q12086	430 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TDA3	YHR009C	SSM4	P40318	1319 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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