RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	GPI10	P30777	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	STE5	P32917	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	VPS35	P34110	944 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	BIM1	P40013	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	SPO22	P40511	975 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YNL057W	YNL057W	YKE2	P52553	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	VTC3	Q02725	835 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	FUS2	Q05670	677 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	ADY4	Q05955	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	CDD1	Q06549	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	TFB4	Q12004	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	CTF3	Q12748	733 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	HSF1	P10961	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PPH22	P23595	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	GAC1	P28006	793 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PDR3	P33200	976 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	GIP1	P38229	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	IES1	P43579	692 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	ROG3	P43602	733 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	VPS25	P47142	202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	STR2	P47164	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	CBK1	P53894	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	SEC5	P89102	971 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	TIP41	Q12199	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	RAD16	P31244	790 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	NUD1	P32336	851 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	ISF1	P32488	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YSC83	P32792	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	SWE1	P32944	819 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	CSE1	P33307	960 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	SLA2	P33338	968 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	TBS1	P38114	1094 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	RMD8	P43620	662 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	GUP1	P53154	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	TOF1	P53840	1238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	GCR2	Q01722	534 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PRM6	Q04705	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	BSP1	Q06604	576 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PPX1	P38698	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	OCA5	P38738	679 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YHR054C	P38780	354 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	RGA1	P39083	1007 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YEL076C	P39971	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YGR153W	P48238	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	SHE10	P53075	577 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YAT1	P80235	687 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	TAF10	Q12030	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YDL206W	Q12424	762 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	MNN4	P36044	1178 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	PET10	P36139	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	YKR051W	P36142	418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	SDS3	P40505	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	GCN5	Q03330	439 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	WAR1	Q03631	944 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TPK1	P06244	397 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	CBP3	P21560	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	UTH1	P36135	365 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	AGP2	P38090	596 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	UBP13	P38187	747 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	NUP82	P40368	713 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	BUD6	P41697	788 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	VPS70	P47161	811 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	SMA1	Q02651	245 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	SEG1	Q04279	960 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL057W	YNL057W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.3 ms