RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	APC11	Q12157	165 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	MSN1	P22148	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	PRD1	P25375	712 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	KCC4	P25389	1037 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	NIP100	P33420	868 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	YHL041W	P38730	149 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RRF1	P38771	230 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	FAA3	P39002	694 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	MAM1	P40065	302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RET2	P43621	546 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RSC4	Q02206	625 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	VTC3	Q02725	835 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	VPS30	Q02948	557 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SHE9	Q04172	456 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	ADY3	Q07732	790 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RSC58	Q07979	502 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	FUS1	P11710	512 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	AEP2	P22136	580 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	GSY1	P23337	708 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	ISC10	P32645	267 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
KTR2	YKR061W	UBP5	P39944	805 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	ACA1	P39970	489 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SHE10	P53075	577 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	ENV11	P53246	860 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	NCE103	P53615	221 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	YNL050C	P53952	270 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
KTR2	YKR061W	BSC2	Q05611	235 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	CDC45	Q08032	650 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	BUG1	Q12191	341 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
KTR2	YKR061W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	PET111	P08468	800 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	AGP1	P25376	633 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	FUN30	P31380	1131 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	DUT1	P33317	147 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	AIM46	P38885	310 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	GDH3	P39708	457 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	HIS6	P40545	261 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SAE2	P46946	345 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RMT2	Q03305	412 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RAD33	Q04231	177 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	DAL4	Q04895	635 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	THI22	Q06490	572 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SWA2	Q06677	668 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	ALE1	Q08548	619 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
KTR2	YKR061W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RPB10	P22139	70 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RAD16	P31244	790 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	DBF4	P32325	704 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SMC1	P32908	1225 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	PBY1	P38254	753 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SEC9	P40357	651 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	ECL1	P48235	211 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RTA1	P53047	317 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SFB2	P53953	876 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	ZDS2	P54786	942 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RNH1	Q04740	348 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	ESC8	Q08119	714 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	ELG1	Q12050	791 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	NSI1	Q12457	570 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SPO16	P17122	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	KTR4	P38131	464 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	UBS1	P38290	277 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SPT8	P38915	602 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	DSS1	P39112	969 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RAD26	P40352	1085 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
KTR2	YKR061W	ENT3	P47160	408 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	MEP3	P53390	489 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	HST1	P53685	503 aa		4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.3 ms