RNA–Protein interactions for RNA: YOR057W

SGT1, Transcript of Cochaperone protein, yeast

Gene SGT1, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SGT1	YOR057W	YJL049W	P47048	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	HDA1	P53973	706 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	SDP1	P40479	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	FLC1	Q08967	793 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	MMS22	Q06164	1454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	CHS7	P38843	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	HUL4	P40985	892 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	HUL5	P53119	910 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	CTF4	Q01454	927 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TAF8	Q03750	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	ENV7	Q12003	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	CTF8	P38877	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	BUL1	P48524	976 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	PEX19	Q07418	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	SPO14	P36126	1683 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	BET3	P36149	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
SGT1	YOR057W	NIT3	P49954	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	PUS2	P53167	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SGT1	YOR057W	PDR10	P51533	1564 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	ERG4	P25340	473 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	NNF1	P47149	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	ERG5	P54781	538 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	BDF2	Q07442	638 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	SWM1	Q12379	170 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	SPP41	P38904	1435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	CAN1	P04817	590 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	DAL7	P21826	554 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	EMC3	P36039	253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	KTR4	P38131	464 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	SUL1	P38359	859 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	YHR078W	P38799	552 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	GYP8	P43570	497 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	RTA1	P53047	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	NSE3	Q05541	303 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
SGT1	YOR057W	YCL002C	P25565	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	CTF13	P35203	478 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	TAD1	P53065	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	DAM1	P53267	343 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	TRM13	Q12383	476 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	TRM11	Q12463	433 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	GAL11	P19659	1081 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	VHR1	P40522	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	ALG2	P43636	503 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	PRC1	P00729	532 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
SGT1	YOR057W	MAK10	Q02197	733 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	RNT1	Q02555	471 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SGT1	YOR057W	ALG7	P07286	448 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	RAD53	P22216	821 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	OAR1	P35731	278 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	SAP190	P36123	1033 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	MOH1	P38191	138 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	RPP1	P38786	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	PZF1	P39933	429 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	ASI2	P53895	289 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	REH1	Q06709	432 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	USO1	P25386	1790 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	SAK1	P38990	1142 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	FKH2	P41813	862 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	SSY5	P47002	699 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	ATP25	Q03153	612 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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