RNA–Protein interactions for RNA: YJL038C

LOH1, Transcript of Protein involved in outer spore wall assembly, yeast

Gene LOH1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LOH1	YJL038C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	PIF1	P07271	859 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	MBR1	P23493	339 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	RAD27	P26793	382 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	ASF1	P32447	279 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	TOD6	P34219	525 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	RGD1	P38339	666 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	SPL2	P38839	148 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	PIK1	P39104	1066 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	YIR042C	P40586	236 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	CNN1	P43618	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	RSC1	P53236	928 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	INM2	Q05533	292 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	PEX19	Q07418	342 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	PPM2	Q08282	695 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	TAH18	Q12181	623 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	YER152C	P10356	443 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	SNF5	P18480	905 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	YCR015C	P25616	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	PEP3	P27801	918 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	RPN12	P32496	274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	DID4	P36108	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	YFL054C	P43549	646 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	TAF1	P46677	1066 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	ENV11	P53246	860 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	RTS3	P53289	263 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	DOS2	P54858	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	HKR1	P41809	1802 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	SOD2	P00447	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	COQ1	P18900	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	RDS1	P25611	832 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	MCM7	P38132	845 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	OCA5	P38738	679 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	GIP4	P39732	760 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	EPL1	P43572	832 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	GNP1	P48813	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	IRC4	Q03036	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LOH1	YJL038C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	KRE2	P27809	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	RER2	P35196	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
LOH1	YJL038C	RFC5	P38251	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	YHL017W	P38745	532 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	RSM25	P40496	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	IRC8	P47046	822 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	HNT2	P49775	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	YKE2	P52553	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	PEX14	P53112	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	ROT1	Q03691	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	RSM24	Q03976	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	SGD1	Q06132	899 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	IRC3	Q06683	689 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	FIG2	P25653	1609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	FLR1	P38124	548 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	MAL33	P38157	468 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	RKM3	P38222	552 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	LAM1	P38851	1228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
LOH1	YJL038C	HDA1	P53973	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	LCD1	Q04377	747 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	CYB2	P00175	591 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	PFF1	P38244	976 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	BUD6	P41697	788 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	YFH7	P43591	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	IOC3	P43596	787 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	NNF1	P47149	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	SPT20	P50875	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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