Protein–RNA interactions for Protein: P34227

PRX1, Peroxiredoxin PRX1, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRX1P34227 NSR1YGR159C 1245 nt23.26■■□□□ 1.31
PRX1P34227 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.21■■□□□ 1.31
PRX1P34227 NOP1YDL014W 984 nt22.38■■□□□ 1.17
PRX1P34227 MDJ1YFL016C 1536 nt20.99■□□□□ 0.95
PRX1P34227 YKL036CYKL036C 393 nt20.43■□□□□ 0.86
PRX1P34227 SRX1YKL086W 384 nt19.59■□□□□ 0.73
PRX1P34227 Q0297Q0297 156 nt19.54■□□□□ 0.72
PRX1P34227 YJL027CYJL027C 417 nt19.29■□□□□ 0.68
PRX1P34227 YCR051WYCR051W 669 nt18.58■□□□□ 0.56
PRX1P34227 SCS3YGL126W 1143 nt18.49■□□□□ 0.55
PRX1P34227 DBP2YNL112W 1641 nt18.46■□□□□ 0.55
PRX1P34227 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.9■□□□□ 0.46
PRX1P34227 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.9■□□□□ 0.46
PRX1P34227 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.9■□□□□ 0.46
PRX1P34227 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.9■□□□□ 0.46
PRX1P34227 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.9■□□□□ 0.46
PRX1P34227 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.9■□□□□ 0.46
PRX1P34227 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.9■□□□□ 0.46
PRX1P34227 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.9■□□□□ 0.46
PRX1P34227 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.9■□□□□ 0.46
PRX1P34227 YBR190WYBR190W 312 nt17.9■□□□□ 0.46
PRX1P34227 YOL085CYOL085C 342 nt17.73■□□□□ 0.43
PRX1P34227 CCC1YLR220W 969 nt17.72■□□□□ 0.43
PRX1P34227 RPP1BYDL130W 321 nt17.53■□□□□ 0.4
PRX1P34227 PKP1YIL042C 1185 nt17.53■□□□□ 0.4
PRX1P34227 RTC3YHR087W 336 nt17.5■□□□□ 0.39
PRX1P34227 RVS167YDR388W 1449 nt17.21■□□□□ 0.35
PRX1P34227 SCJ1YMR214W 1134 nt17.16■□□□□ 0.34
PRX1P34227 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.84■□□□□ 0.29
PRX1P34227 PET122YER153C 765 nt16.83■□□□□ 0.28
PRX1P34227 SHR5YOL110W 714 nt16.57■□□□□ 0.24
PRX1P34227 PUT4YOR348C 1884 nt16.51■□□□□ 0.23
PRX1P34227 SCR1SCR1 522 nt16.5■□□□□ 0.23
PRX1P34227 ATS1YAL020C 1002 nt16.44■□□□□ 0.22
PRX1P34227 URN1YPR152C 1398 nt16.3■□□□□ 0.2
PRX1P34227 RRN5YLR141W 1092 nt16.29■□□□□ 0.2
PRX1P34227 YDJ1YNL064C 1230 nt16.27■□□□□ 0.2
PRX1P34227 DEP1YAL013W 1218 nt16.24■□□□□ 0.19
PRX1P34227 ARE1YCR048W 1833 nt16.14■□□□□ 0.17
PRX1P34227 OPI9YLR338W 858 nt16.11■□□□□ 0.17
PRX1P34227 SAH1YER043C 1350 nt16.11■□□□□ 0.17
PRX1P34227 SSA3YBL075C 1950 nt16.04■□□□□ 0.16
PRX1P34227 GAR1YHR089C 618 nt15.98■□□□□ 0.15
PRX1P34227 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.97■□□□□ 0.15
PRX1P34227 POA1YBR022W 534 nt15.96■□□□□ 0.15
PRX1P34227 RPN10YHR200W 807 nt15.94■□□□□ 0.14
PRX1P34227 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.93■□□□□ 0.14
PRX1P34227 YNL208WYNL208W 600 nt15.9■□□□□ 0.14
PRX1P34227 RSB1YOR049C 1065 nt15.87■□□□□ 0.13
PRX1P34227 BSC6YOL137W 1494 nt15.68■□□□□ 0.1
PRX1P34227 PUN1YLR414C 792 nt15.62■□□□□ 0.09
PRX1P34227 BUD23YCR047C 828 nt15.53■□□□□ 0.08
PRX1P34227 YJR018WYJR018W 363 nt15.52■□□□□ 0.08
PRX1P34227 PTC2YER089C 1395 nt15.5■□□□□ 0.07
PRX1P34227 TIR1YER011W 765 nt15.45■□□□□ 0.06
PRX1P34227 SSA1YAL005C 1929 nt15.35■□□□□ 0.05
PRX1P34227 NAB2YGL122C 1578 nt15.32■□□□□ 0.04
PRX1P34227 YJR120WYJR120W 351 nt15.3■□□□□ 0.04
PRX1P34227 PST2YDR032C 597 nt15.27■□□□□ 0.04
PRX1P34227 SPT5YML010W 3192 nt15.16■□□□□ 0.02
PRX1P34227 FIS1YIL065C 468 nt15.13■□□□□ 0.01
PRX1P34227 RPP2BYDR382W 333 nt15.1■□□□□ 0.01
PRX1P34227 SRB2YHR041C 633 nt15.1■□□□□ 0.01
PRX1P34227 DAL1YIR027C 1383 nt15.08■□□□□ 0
PRX1P34227 FPR4YLR449W 1179 nt15.04■□□□□ -0
PRX1P34227 INM2YDR287W 879 nt14.97□□□□□ -0.01
PRX1P34227 PHO4YFR034C 939 nt14.96□□□□□ -0.01
PRX1P34227 YBL100CYBL100C 315 nt14.82□□□□□ -0.04
PRX1P34227 BDH2YAL061W 1254 nt14.78□□□□□ -0.04
PRX1P34227 YPS1YLR120C 1710 nt14.75□□□□□ -0.05
PRX1P34227 WWM1YFL010C 636 nt14.75□□□□□ -0.05
PRX1P34227 SHU1YHL006C 453 nt14.75□□□□□ -0.05
PRX1P34227 MEP2YNL142W 1500 nt14.73□□□□□ -0.05
PRX1P34227 SSA4YER103W 1929 nt14.72□□□□□ -0.05
PRX1P34227 FUN26YAL022C 1554 nt14.64□□□□□ -0.07
PRX1P34227 YDR095CYDR095C 411 nt14.62□□□□□ -0.07
PRX1P34227 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.62□□□□□ -0.07
PRX1P34227 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.59□□□□□ -0.07
PRX1P34227 DCW1YKL046C 1350 nt14.54□□□□□ -0.08
PRX1P34227 TRM9YML014W 840 nt14.53□□□□□ -0.08
PRX1P34227 YGR021WYGR021W 873 nt14.52□□□□□ -0.09
PRX1P34227 YKL097CYKL097C 411 nt14.51□□□□□ -0.09
PRX1P34227 LSM3YLR438C-A 270 nt14.51□□□□□ -0.09
PRX1P34227 HOM6YJR139C 1080 nt14.5□□□□□ -0.09
PRX1P34227 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.47□□□□□ -0.09
PRX1P34227 ALF1YNL148C 765 nt14.46□□□□□ -0.09
PRX1P34227 MNP1YGL068W 585 nt14.43□□□□□ -0.1
PRX1P34227 CCT6YDR188W 1641 nt14.42□□□□□ -0.1
PRX1P34227 PTP1YDL230W 1008 nt14.35□□□□□ -0.11
PRX1P34227 RPP2AYOL039W 321 nt14.33□□□□□ -0.12
PRX1P34227 EMI2YDR516C 1503 nt14.31□□□□□ -0.12
PRX1P34227 RKM5YLR137W 1104 nt14.29□□□□□ -0.12
PRX1P34227 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.28□□□□□ -0.12
PRX1P34227 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.28□□□□□ -0.12
PRX1P34227 CAC2YML102W 1407 nt14.28□□□□□ -0.12
PRX1P34227 SIS1YNL007C 1059 nt14.27□□□□□ -0.13
PRX1P34227 YDL221WYDL221W 552 nt14.19□□□□□ -0.14
PRX1P34227 BDF1YLR399C 2061 nt14.18□□□□□ -0.14
PRX1P34227 YMR090WYMR090W 684 nt14.17□□□□□ -0.14
PRX1P34227 YBR220CYBR220C 1683 nt14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.7 ms