RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	RPC53	P25441	422 aa		6.69	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	SUV3	P32580	737 aa		6.69	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	UTR4	P32626	227 aa		6.69	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	EFM2	P38347	419 aa		6.69	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	SSN3	P39073	555 aa		6.69	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	TOF1	P53840	1238 aa		6.69	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	ALF1	P53904	254 aa		6.69	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	TUP1	P16649	713 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	XRS2	P33301	854 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	TAD1	P53065	400 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	ARK1	P53974	638 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	GUD1	Q07729	489 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	YPL277C	Q08989	487 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	RAD57	P25301	460 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	ERC1	P38767	581 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	CAJ1	P39101	391 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	FIS1	P40515	155 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	CEP3	P40969	608 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	UBP15	P50101	1230 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	CRD1	Q07560	283 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	YLR001C	Q07895	862 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	PER1	P25625	357 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	LYS5	P50113	272 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	SEC5	P89102	971 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	PHM6	Q05637	104 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	APL1	P27351	700 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	MCD4	P36051	919 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	EFM4	P40516	257 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	BOP3	P53958	396 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	VPS60	Q03390	229 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	HPF1	Q05164	967 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	MED1	Q12321	566 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	TSC13	Q99190	310 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	PCK1	P10963	549 aa		6.65	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	PEP12	P32854	288 aa		6.65	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	VAB2	P40003	282 aa		6.65	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	TCB2	P48231	1178 aa		6.65	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	SML1	Q04964	104 aa		6.65	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	ERP3	Q12403	225 aa		6.65	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		6.65	□□□□□ -1.34
YCK1	YHR135C	SWI5	P08153	709 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	PET111	P08468	800 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SMC1	P32908	1225 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	NIP100	P33420	868 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	REG2	P38232	338 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	NDC80	P40460	691 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	YIL089W	P40500	205 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	LCB2	P40970	561 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	MMM1	P41800	426 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	AVT1	P47082	602 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SOV1	Q04748	898 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SVF1	Q05515	481 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	VAC14	Q06708	880 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	PHO8	P11491	566 aa		6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	YKR018C	P36114	725 aa		6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	JNM1	P36224	373 aa		6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	HUL5	P53119	910 aa		6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SLD5	Q03406	294 aa		6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	YPR078C	Q06813	372 aa		6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	MLH2	Q07980	695 aa		6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	PLP2	Q12017	286 aa		6.64	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	MOT1	P32333	1867 aa		6.63	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	STE11	P23561	717 aa		6.63	□□□□□ -1.35

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