RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	APM2	P38700	605 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	SPL2	P38839	148 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	INP52	P50942	1183 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	HUL5	P53119	910 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	HXT15	P54854	567 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.48	□□□□□ -1.53	not detected
TRS33	YOR115C	WAR1	Q03631	944 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	DCS2	Q12123	353 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	BUG1	Q12191	341 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	CDC6	P09119	513 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	HVG1	P0CE11	249 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	RDH54	P38086	958 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	TPM2	P40414	161 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	STU2	P46675	888 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	YGL140C	P53120	1219 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	IRC4	Q03036	179 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	TFC6	Q06339	672 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRS33	YOR115C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	PPG1	P32838	368 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	CSM2	P40465	213 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	CTH1	P47976	325 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	TMA16	Q08687	178 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	GLO4	Q12320	285 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	NHA1	Q99271	985 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	CYB2	P00175	591 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	FUS1	P11710	512 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	IDI1	P15496	288 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	PRI2	P20457	528 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	CBP3	P21560	335 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	NPR1	P22211	790 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	ANP1	P32629	500 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	PEX28	P38848	579 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	TYW3	P53177	273 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	BUD9	P53226	547 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	YOR131C	Q12486	218 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	YOR111W	Q99210	232 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	AGP1	P25376	633 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	CDC15	P27636	974 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	MDL2	P33311	773 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	MYO3	P36006	1272 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	NUP82	P40368	713 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	SIW14	P53965	281 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	YMR074C	Q04773	145 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	HDA2	Q06629	674 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	MRL1	Q06815	381 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	AFT2	Q08957	416 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	APL4	Q12028	832 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	PMD1	P32634	1753 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	KRE2	P27809	442 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	STE5	P32917	917 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	ALG14	P38242	237 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	RXT2	P38255	430 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	PCI8	P40512	444 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	YFH7	P43591	353 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.43	□□□□□ -1.54	not detected
TRS33	YOR115C	PPT1	P53043	513 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	RSC2	Q06488	889 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	PTC5	Q12511	572 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	MAK31	P23059	88 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	RIT1	P23796	513 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	LYP1	P32487	611 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	SQT1	P35184	431 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	PCH2	P38126	564 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	TOS1	P38288	455 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	EXO5	P38289	585 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	RTS1	P38903	757 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	VID27	P40157	782 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	SHE9	Q04172	456 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRS33	YOR115C	GIS4	Q04233	774 aa		5.42	□□□□□ -1.54

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