RNA–Protein interactions for RNA: YKR049C

FMP46, Transcript of Putative redox protein containing a thioredoxin fold, yeast

Gene FMP46, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FMP46	YKR049C	YDR090C	Q03193	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	WAR1	Q03631	944 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	DON1	Q05610	365 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	TMA16	Q08687	178 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ECM29	P38737	1868 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
FMP46	YKR049C	APL1	P27351	700 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	RIM101	P33400	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YET1	P35723	206 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SAP190	P36123	1033 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	MMS4	P38257	691 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	BRL1	P38770	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	NPP2	P39997	493 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SPO74	P45819	413 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ORC5	P50874	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YGR130C	P53278	816 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YAP7	Q08182	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	PCD1	Q12524	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	COX4	P04037	155 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
FMP46	YKR049C	SWI6	P09959	803 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	CHS2	P14180	963 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	GLN3	P18494	730 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SPO11	P23179	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	PXL1	P36166	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	VID24	P38263	362 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	UBX7	P38349	436 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SSP1	P38871	571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
FMP46	YKR049C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	COS5	P47187	383 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	GCV2	P49095	1034 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	TIM8	P57744	87 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	MLH2	Q07980	695 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	PLP2	Q12017	286 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	TFC8	Q12308	588 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	PHO13	P19881	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	BIO2	P32451	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	MIC60	P36112	540 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	DRE2	P36152	348 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	MSC7	P38694	644 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YHL026C	P38740	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	FTR1	P40088	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	MGA2	P40578	1113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	LAM5	P43560	674 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	DAS1	P47005	663 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YNL115C	P53925	644 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	EAR1	Q03212	550 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SKY1	Q03656	742 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SPO75	Q07798	868 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	GIS3	Q12418	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SCJ1	P25303	377 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	MSH3	P25336	1018 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	PRR1	P28708	518 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
FMP46	YKR049C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SLX1	P38324	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SPT8	P38915	602 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	YER186C	P40101	306 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SDS3	P40505	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ALT2	P52892	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	VPS75	P53853	264 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SHS1	Q07657	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SEC65	P29478	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FMP46	YKR049C	SWI3	P32591	825 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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