RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cetn4Q8K4K1 168 aa24.47■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Flad1Q8R123 492 aa24.47■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 ApobrQ8VBT6 942 aa24.47■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ankrd23Q812A3 306 aa24.46■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hspa2P17156 633 aa24.45■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Myt1Q8CFC2 1127 aa24.45■■□□□ 1.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tlr7P58681 1050 aa24.45■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ggt6Q6PDE7 497 aa24.45■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Srgap3Q812A2 1099 aa24.45■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pm20d1Q8C165 503 aa24.45■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cap2Q9CYT6 476 aa24.45■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ak7Q9D2H2 614 aa24.45■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Exoc5Q3TPX4 708 aa24.44■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map3k13Q1HKZ5 959 aa24.43■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map7O88735 730 aa24.43■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trim52Q8CDV4 233 aa24.43■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cog6Q8R3I3 657 aa24.43■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nav1Q8CH77 1875 aa24.42■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mmp8O70138 465 aa24.42■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa24.41■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cwc27Q3TKY6 469 aa24.41■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eno4Q8C042 619 aa24.41■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atg4aQ8C9S8 396 aa24.41■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa24.41■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ank1Q02357 1862 aa24.41■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wdr63B2RY71 923 aa24.41■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cgnl1Q6AW69 1298 aa24.4■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa24.4■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ier5O89113 308 aa24.39■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gcc1Q9D4H2 778 aa24.39■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nphp1Q9QY53 687 aa24.39■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa24.39■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 MypnQ5DTJ9 1315 aa24.39■■□□□ 1.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Erbb4Q61527 1308 aa24.38■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc27Q3V036 639 aa24.38■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ipo8Q7TMY7 1010 aa24.38■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Clcn1Q64347 994 aa24.37■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ankle2Q6P1H6 964 aa24.37■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Syde2E9PUP1 1314 aa24.37■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc146E9Q9F7 977 aa24.37■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sema6bO54951 886 aa24.36■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Vps33bP59016 617 aa24.36■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tgfb1i1Q62219 461 aa24.36■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mylk2Q8VCR8 613 aa24.36■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa24.36■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kndc1Q0KK55 1742 aa24.36■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Grm8P47743 908 aa24.35■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cntnap1O54991 1385 aa24.35■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm12185Q5NCB2 835 aa24.34■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ltbp1Q8CG19 1712 aa24.34■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa24.33■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mcmdc2E9Q956 681 aa24.33■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dcaf5Q80T85 946 aa24.33■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 MypopQ8R4U1 393 aa24.33■■□□□ 1.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mcm2P97310 904 aa24.32■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tmc1Q8R4P5 757 aa24.32■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ripor2Q80U16 1078 aa24.31■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Emilin2Q8K482 1074 aa24.31■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mum1Q6DID5 682 aa24.31■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nyap1Q6PFX7 833 aa24.3■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abca3Q8R420 1704 aa24.29■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cers3Q1A3B0 383 aa24.29■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tceal9Q9DD24 104 aa24.29■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa24.28■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa24.28■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa24.28■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 NmiO35309 314 aa24.27■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nlrp9bQ66X22 1003 aa24.27■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ddx58Q6Q899 926 aa24.27■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sos2Q02384 1333 aa24.26■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 InhbeO08717 350 aa24.26■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nkx1-2P42580 305 aa24.26■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Jmjd4Q8BFT6 427 aa24.26■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa24.26■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Bcar3Q9QZK2 820 aa24.25■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa24.25■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mrc1Q61830 1456 aa24.25■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 AK157302I3ITR1 129 aa24.24■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fkbp5Q64378 456 aa24.24■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Isca1Q9D924 129 aa24.24■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 ChgaP26339 463 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa24.23■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Soga3Q6NZL0 945 aa24.23■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nek4Q9Z1J2 792 aa24.23■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppm1gQ61074 542 aa24.23■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.7 ms